Genomics of Tree Crops

درختانی که به طور انکارناپذیری از زندگی انسان حمایت می‌کنند، چالش بزرگی برای پرورش آن‌ها متناسب با نیازهای انسان هستند. از نوشابه‌های غیرالکلی گرفته تا آبجوسازی‌ها، نوشیدنی‌ها، روغن‌ها و لاستیک‌ها، ارزش افزوده محصولات درختان طیفی از محصولات را به نوع بشر می‌دهد. در حالی که تلاش‌ها برای بهره‌برداری از این منابع از طریق اصلاح متعارف در حال انجام است، روش سریع و ظریف دستکاری سیستم‌های ژنتیکی در سطح ژنوم فصل ضروری علم مدرن است. کتاب‌های مربوط به ژنومیک محصولات درختی کم هستند و ژنومیک علمی است که به سرعت تغییر می‌کند. ژنومیک محصولات درختی تلاش جدی برای گردآوری ژنومیک محصولات درختی است.

ژنومیک گیاهی در دهه گذشته گام های مهمی برداشته است که بینش هایی در مورد پدیده های درون ژنومی مانند هتروزیس ارائه می دهد. اپیستاز، پلیوتروپی و سایر برهمکنش‌های بین جایگاه‌ها و آلل‌های درون ژنوم. در مقابل، بررسی نقش و عملکرد ژن‌های منفرد، تمرکز اولیه زیست‌شناسی مولکولی است و موضوع مشترک تحقیقات ژنتیکی مدرن است. ژنوم مجموع کل ژن های یک موجود زنده است. بنابراین، ژنومیکس مطالعه تمام ژن‌های یک سلول یا بافت در سطح DNA (ژنوتیپ)، mRNA (ترانسکریپتوم)، یا پروتئین (پروتئوم) است. توالی کامل سه میلیارد جفت باز ژنوم انسان با 25000 ژن شناسایی شده و اختراع ریزآرایه‌های DNA، عصر جدیدی را در علم ژنومیک آغاز کرد که منجر به پیشرفت‌های انفجاری در تشخیص انکولوژی شد. این انگیزه به عصر ژنومیک منجر به پیشرفت در ژنومیک گیاهی شد که با Arabidopsis thaliana آغاز شد و از طریق مجموعه ای از محصولات مانند برنج، ذرت، پاپایا، غلات و حبوبات مختلف همراه با نخود کبوتر گذشت. درختان، از سوی دیگر، کمترین گونه از نظر تحقیقات ژنومی مورد توجه قرار گرفته اند. برخی از زمینه هایی که مورد توجه دانشمندان قرار گرفته عبارتند از: توالی یابی DNA، بیوانفورماتیک، ژنومیک گلدهی، جریان ژن، ساختار فضایی، سازگاری محلی و مهاجرت کمکی در درختان، تبدیل درختان میوه، ژنومیک درختان میوه گرمسیری و معتدل، ژنومیک لاستیک Hevea، ژنومیک پاپایا و ژنومیک نخل. ژنومیک محصولات درختی این اطلاعات را با فصل‌هایی که توسط متخصصان این محصولات تالیف شده است جمع‌آوری می‌کند.

Trees that are indispensably supportive to human life pose a formidable challenge to breed them to suit to human needs. From soft drinks to breweries to beverages to oil to tires, the value added products from trees give a spectrum of products to human kind. While attempts to tap these resources through conventional breeding are underway, the quick and elegant way of manipulating the genetic systems at the genome level is an essential chapter of modern science. Books featuring genomics of tree crops are few, and genomics is such a science that changes rapidly. Genomics of Tree Crops is an earnest attempt towards compiling genomics of tree crops.

Plant genomics has made monumental strides in the last decade providing insights into intra-genomic phenomena such as heterosis, epistasis, pleiotropy and other interactions between loci and alleles within the genome. In contrast, the investigation of the roles and functions of single genes is a primary focus of molecular biology and is a common topic of modern genetic research. A genome is the sum total of all of an individual organism's genes. Thus, genomics is the study of all the genes of a cell, or tissue, at the DNA (genotype), mRNA (transcriptome), or protein (proteome) levels. The complete sequencing of the three billion base pair human genome with 25,000 genes identified and the invention of DNA microarrays ushered in a new era in the science of genomics leading to explosive advancements in oncology diagnostics. This impetus into the genomics era lead the way toward advances in plant genomics which started with Arabidopsis thaliana and went through an array of crops such as rice, maize, papaya, various cereals and legumes, with pigeon pea added to the list towards the end of 2011. Trees, on the other hand, are the least attended taxa with regard to genomic research. Some of the areas that attained attention of the scientists are: DNA sequencing, bioinformatics, genomics of flowering, gene flow, spatial structure, local adaptation and assisted migration in trees, transformation of fruit trees, genomics of tropical and temperate fruit trees, genomics of Hevea rubber, genomics of papaya and genomics of palms. Genomics of Tree Crops compiles this information with chapters authored by experts on these crops.