دسترسی نامحدود
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
برای ارتباط با ما می توانید از طریق شماره موبایل زیر از طریق تماس و پیامک با ما در ارتباط باشید
در صورت عدم پاسخ گویی از طریق پیامک با پشتیبان در ارتباط باشید
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
درصورت عدم همخوانی توضیحات با کتاب
از ساعت 7 صبح تا 10 شب
ویرایش: [1 ed.]
نویسندگان: Zia Ur Rahman. Srinivasareddy Putluri
سری:
ISBN (شابک) : 0367615800, 9780367615802
ناشر: CRC Press
سال نشر: 2021
تعداد صفحات: 192
[203]
زبان: English
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود)
حجم فایل: 8 Mb
در صورت ایرانی بودن نویسنده امکان دانلود وجود ندارد و مبلغ عودت داده خواهد شد
در صورت تبدیل فایل کتاب Genomic Sequence Analysis for Exon Prediction Using Adaptive Signal Processing Algorithms به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.
توجه داشته باشید کتاب تجزیه و تحلیل توالی ژنومی برای پیشبینی اگزون با استفاده از الگوریتمهای پردازش سیگنال تطبیقی نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.
این کتاب به موضوع بهبود دقت در پیشبینی اگزون در توالیهای DNA با استفاده از تکنیکهای تطبیقی مختلف بر اساس معیارهای عملکردی مختلف که در تشخیص و درمان بیماریها حیاتی هستند، میپردازد. ابتدا، نویسندگان مروری بر مهندسی ژنومیک، ساختار توالی DNA و بلوکهای سازنده آن، جریان اطلاعات ژنتیکی در سلول، پیشبینی ژن همراه با اهمیت آن، و انواع مختلف روشهای پیشبینی ژن ارائه میکنند، و پس از آن مروری بر متون آغاز میشود. پس زمینه بیولوژیکی تجزیه و تحلیل توالی ژنومی در مرحله بعد، آنها ملاحظات نظری مختلف تکنیکهای فیلتر تطبیقی مورد استفاده برای تجزیه و تحلیل DNA را با مقدمهای بر فیلترینگ تطبیقی، ویژگیهای الگوریتمهای تطبیقی، و نیاز به توسعه پیشبینیکنندههای اگزون تطبیقی (AEPs) و ساختار AEP مورد استفاده برای تجزیه و تحلیل DNA پوشش میدهند. سپس، آنها رویکرد الگوریتم حداقل میانگین مربعات (LMS) و تحققهای مبتنی بر علامت آن را با ضریب نرمالسازی برای تجزیه و تحلیل DNA گسترش میدهند. آنها همچنین الگوریتم های تطبیقی مبتنی بر لگاریتمی نرمال شده حداقل میانگین لگاریتمی مربع (LMLS) و حداقل تفاوت لگاریتمی لگاریتمی (LLAD) را ارائه می دهند که شامل الگوریتم LMLS نرمال شده (NLMLS)، الگوریتم LLAD نرمال شده (NLLAD) و انواع علامت آنها می شود. این کتاب با مروری بر اهداف به دست آمده به پایان می رسد و دستاوردهای اولیه را با استفاده از تمام تکنیک های پیشنهادی برجسته می کند. این کتاب برای استفاده دقیق از الگوریتم های پردازش سیگنال تطبیقی برای مهندسی ژنتیک، مهندسی زیست پزشکی و بیوانفورماتیک در نظر گرفته شده است و برای دانشجویان کارشناسی و کارشناسی ارشد مفید است. این همچنین به عنوان یک راهنمای عملی برای Ph.D. دانشجویان و محققین و تعدادی جهت تحقیقاتی را برای کار بیشتر ارائه خواهد کرد.
ویژگی ها
</ p>
دکتر دکتر ضیاء الرحمن، استاد گروه الکترونیک و مهندسی ارتباطات در بنیاد آموزشی Koneru Lakshmaiah (دانشگاه K. L.)، Guntur، هند است. علایق تحقیقاتی فعلی او شامل پردازش سیگنال تطبیقی، پردازش سیگنال زیست پزشکی، مهندسی ژنتیک، تصویربرداری پزشکی، پردازش سیگنال آرایه، تله متری پزشکی و نانوفوتونیکس است.
دکتر Srinivasareddy Putluri در حال حاضر یک مهندس نرم افزار در Tata Consultancy Services Ltd.، حیدرآباد است. او دکترای خود را دریافت کرد. مدرک (پردازش سیگنال ژنومی با استفاده از الگوریتمهای پردازش سیگنال تطبیقی) از گروه الکترونیک و مهندسی ارتباطات در بنیاد آموزشی Koneru Lakshmaiah (دانشگاه K. L.)، Guntur، هند. علایق تحقیقاتی او شامل پردازش سیگنال ژنومی و پردازش سیگنال تطبیقی است. وی 15 مقاله پژوهشی در مجلات و مقالات مختلف منتشر کرده است. او در حال حاضر منتقد ناشران مانند IEEE Access و IGI است.
This book addresses the issue of improving the accuracy in exon prediction in DNA sequences using various adaptive techniques based on different performance measures that are crucial in disease diagnosis and therapy. First, the authors present an overview of genomics engineering, structure of DNA sequence and its building blocks, genetic information flow in a cell, gene prediction along with its significance, and various types of gene prediction methods, followed by a review of literature starting with the biological background of genomic sequence analysis. Next, they cover various theoretical considerations of adaptive filtering techniques used for DNA analysis, with an introduction to adaptive filtering, properties of adaptive algorithms, and the need for development of adaptive exon predictors (AEPs) and structure of AEP used for DNA analysis. Then, they extend the approach of least mean squares (LMS) algorithm and its sign-based realizations with normalization factor for DNA analysis. They also present the normalized logarithmic-based realizations of least mean logarithmic squares (LMLS) and least logarithmic absolute difference (LLAD) adaptive algorithms that include normalized LMLS (NLMLS) algorithm, normalized LLAD (NLLAD) algorithm, and their signed variants. This book ends with an overview of the goals achieved and highlights the primary achievements using all proposed techniques. This book is intended to provide rigorous use of adaptive signal processing algorithms for genetic engineering, biomedical engineering, and bioinformatics and is useful for undergraduate and postgraduate students. This will also serve as a practical guide for Ph.D. students and researchers and will provide a number of research directions for further work.
Features
Dr. Md. Zia Ur Rahman is a professor in the Department of Electronics and Communication Engineering at Koneru Lakshmaiah Educational Foundation (K. L. University), Guntur, India. His current research interests include adaptive signal processing, biomedical signal processing, genetic engineering, medical imaging, array signal processing, medical telemetry, and nanophotonics.
Dr. Srinivasareddy Putluri is currently a Software Engineer at Tata Consultancy Services Ltd., Hyderabad. He received his Ph.D. degree (Genomic Signal Processing using Adaptive Signal Processing algorithms) from the Department of Electronics and Communication Engineering at Koneru Lakshmaiah Educational Foundation (K. L. University), Guntur, India. His research interests include genomic signal processing and adaptive signal processing. He has published 15 research papers in various journals and proceedings. He is currently a reviewer of publishers like the IEEE Access and IGI.
Cover Half Title Title Page Copyright Page Table of Contents Authors Chapter 1 Introduction 1.1 Genomics Engineering 1.2 DNA Sequence Structure 1.3 Motivation for the Work 1.4 Objectives 1.5 Molecular Basis for Genomic Information 1.5.1 Understanding the Genome 1.5.2 Building Blocks of DNA 1.6 Gene Prediction 1.6.1 Significance of Gene Prediction 1.7 Types of Gene Prediction Approaches 1.7.1 Extrinsic Gene Prediction 1.7.2 Ab Initio Gene Prediction 1.7.3 Comparative Gene Prediction 1.8 DNA Representations for Genomic Sequence Analysis 1.9 Types of DNA Representations 1.9.1 Voss Mapping 1.9.2 Z-Curve Representation 1.9.3 Tetrahedron 1.9.4 Complex 1.9.5 Quaternion 1.9.6 Electron-Ion Interaction Potential 1.9.7 Inter-nucleotide Distance 1.9.8 Maximum Likelihood Estimate 1.8.1 Desirable Properties 1.10 Organization of Book Chapter 2 Literature Review 2.1 Biological Background of Genomic Sequence Analysis 2.2 The Gene and Early Development of Genetics 2.3 Origin of Three-Base Periodicities in Genomic Sequences 2.4 DSP-Based Techniques for DNA Analysis 2.4.1 Application of Discrete Fourier Transform 2.4.2 Spectral Content (SC) Measure 2.4.3 Optimized Spectral Content (SC) Measure 2.4.4 Spectral Rotation (SR) Measure 2.4.5 Fourier Product Spectrum (FPS) Method 2.4.6 Digital Filters for Genomic Analysis 2.4.7 Autoregressive Models 2.5 Adaptive Algorithms for DNA Analysis 2.6 Conclusions Chapter 3 Sign LMS Based Realization of Adaptive Filtering Techniques for Exon Prediction 3.1 Introduction 3.2 Theoretical Considerations of Adaptive Filtering Techniques in DNA Analysis 3.2.1 Adaptive Filter 3.2.2 Properties of Adaptive Algorithms 3.2.3 Need for Development of Adaptive Exon Predictors 3.3 Structure of Adaptive Exon Predictor for DNA Analysis 3.4 LMS Algorithm 3.5 LMF Algorithm 3.6 Variable Step Size LMS (VSLMS) Algorithm 3.7 Least Mean Logarithmic Squares (LMLS) Algorithm 3.8 Least Logarithmic Absolute Difference (LLAD) Algorithm 3.9 Simplified Algorithms Based on Signum Function 3.9.1 Sign-Based LMS Algorithms 3.10 Extension to Sign-Based Realizations of LMS-Based Variants 3.10.1 Sign-Based Least Mean Fourth (LMF) Algorithms 3.10.2 Sign-Based Variable Step Size LMS (VSLMS) Algorithms 3.10.3 Sign-Based Least Mean Logarithmic Squares (LMLS) Algorithms 3.10.4 Sign-Based Least Logarithmic Absolute Difference (LLAD) Algorithms 3.11 Computational Complexity Issues 3.12 Convergence Analysis 3.13 Results and Discussion for LMS-Based Variants 3.13.1 Gene Datasets from the NCBI Gene Databank for Gene Sequence Analysis 3.13.2 Analysis of Gene Datasets of NCBI Gene Databank 3.13.2.1 Nucleotide Densities of Monomers and Dimers in Gene Dataset 3.13.3 Performance Measures of Exon Prediction 3.13.4 Exon Prediction Results 3.14 Conclusions Chapter 4 Normalization-Based Realization of Adaptive Filtering Techniques for Exon Prediction 4.1 Introduction 4.2 Normalized Adaptive Algorithms 4.3 Normalized LMS (NLMS) Algorithm 4.4 Error-Normalized LMS (ENLMS) Algorithm 4.5 Normalized Least Mean Fourth (NLMF) Algorithm 4.6 Variable Step Size Normalized LMS (VNLMS) Algorithm 4.7 Extension to Sign-Based Realizations of Normalized Algorithms 4.7.1 Sign-Based Normalized LMS (NLMS) Algorithms 4.7.2 Sign-Based Error-Normalized LMS (ENLMS) Algorithms 4.7.3 Sign-Based Normalized LMF (NLMF) Algorithms 4.7.4 Sign-Based Variable Step Size NLMS (VNLMS) Algorithms 4.8 Computational Complexity Issues 4.9 Convergence Analysis 4.10 Results and Discussion for Normalization-Based Variants 4.10.1 Exon Prediction Results 4.11 Conclusions Chapter 5 Logarithmic-Based Realization of Adaptive Filtering Techniques for Exon Prediction 5.1 Introduction 5.2 Logarithmic Adaptive Algorithms 5.3 Normalized LMLS (NLMLS) Algorithm 5.4 Error-Normalized LMLS (ENLMLS) Algorithm 5.5 Normalized LLAD (NLLAD) Algorithm 5.6 Error-Normalized LLAD (ENLLAD) Algorithm 5.7 Extension to Sign-Based Realizations of Logarithmic Normalized Algorithms 5.7.1 Extension to Sign-Based Realizations of NLMLS-Based Variants 5.7.2 Extension to Sign-Based Realizations of ENLMLS-Based Variants 5.7.3 Extension to Sign-Based Realizations of NLLAD-Based Variants 5.7.4 Extension to Sign-Based Realizations of ENLLAD-Based Variants 5.8 Computational Complexity Issues 5.9 Convergence Analysis 5.10 Results and Discussion for Logarithmic Normalized Variants 5.10.1 Exon Prediction Results 5.11 Conclusions Chapter 6 Conclusion and Future Perspective 6.1 Summary and Conclusions 6.2 Recommendations for Future Research References Index