Functional Proteomics: Methods and Protocols

از آنجایی که حوزه نوظهور پروتئومیکس با سرعتی بسیار سریع به گسترش خود ادامه می‌دهد، تعیین کمیت نسبی پروتئین‌ها که توسط عملکرد آنها هدف قرار می‌گیرد، به بزرگترین چالش آن تبدیل می‌شود. استراتژی‌های تحلیلی پیچیده‌ای طراحی شده‌اند که امکان تجزیه و تحلیل مقایسه‌ای پروتئوم‌های بزرگ و همچنین در تشخیص عمقی پروتئوم هسته یا شبکه تعامل یک پروتئین مورد نظر را فراهم می‌کند. در Functional Proteomics: Methods and Protocols، محققان خبره آخرین پروتکل‌هایی را که برای رسیدگی به مشکلاتی که در پروژه‌های پروتئومیکس با کارایی بالا با آن مواجه می‌شوند، با تأکید بر عوامل حاکم بر انتخاب‌های فنی برای کاربردهای معین، توسعه داده شده‌اند، توصیف می‌کنند. مطالعات موردی در حجم بر روی سه جنبه حیاتی طراحی آزمایشی زیر تمرکز دارد: 1) استراتژی مورد استفاده برای انتخاب، خالص سازی و آماده سازی نمونه برای تجزیه و تحلیل توسط طیف سنجی جرمی، 2) نوع طیف سنج جرمی مورد استفاده و نوع داده ای که از آن به دست می آید، و 3) روش مورد استفاده برای تفسیر داده های طیف سنجی جرمی و موتور جستجوی مورد استفاده برای شناسایی پروتئین ها در انواع مختلف بانک های داده توالی موجود. به‌عنوان بخشی از مجموعه‌های بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی™، این فصل‌ها پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و قابل تکرار آسان، فهرست‌هایی از مواد و معرف‌های لازم، و نکاتی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از شناخته شده را گردآوری می‌کنند. مشکلات.

جامع و پیشرو، پروتئومیکس کاربردی: روش ها و پروتکل ها یک منبع ایده آل برای همه دانشمندانی است که این رشته در حال توسعه و داده های متعدد آن را دنبال می کنند.

As the emerging field of proteomics continues to expand at an extremely rapid rate, the relative quantification of proteins, targeted by their function, becomes its greatest challenge. Complex analytical strategies have been designed that allow comparative analysis of large proteomes, as well as in depth detection of the core proteome or the interaction network of a given protein of interest. In Functional Proteomics: Methods and Protocols, expert researchers describe the latest protocols being developed to address the problems encountered in high-throughput proteomics projects, with emphasis on the factors governing the technical choices for given applications. The case studies within the volume focus on the following three crucial aspects of the experimental design: 1) the strategy used for the selection, purification and preparation of the sample to be analyzed by mass spectrometry, 2) the type of mass spectrometer used and the type of data to be obtained from it, and 3) the method used for the interpretation of the mass spectrometry data and the search engine used for the identification of the proteins in the different types of sequence data banks available. As a part of the highly successful Methods in Molecular Biology™ series, the chapters compile step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, lists of the necessary materials and reagents, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Comprehensive and cutting-edge, Functional Proteomics: Methods and Protocols is an ideal resource for all scientists pursuing this developing field and its multitudinous data.