The Bacteriophages

10 سال از زمانی که Plenum مجموعه ای از بررسی ها را در مورد ریوفاژهای باکتریایی در ویروس شناسی جامع ارائه کرد می گذرد. فصل‌های آن سری حاوی نقشه‌های فیزیکی-ژنتیکی بودند اما اطلاعات توالی DNA بسیار کمی داشتند. اکنون توالی کامل DNA برای برخی از فاژها شناخته شده است، و توالی های بعدی برای برخی دیگر به زودی دنبال می شوند. در طول 10 سال گذشته دو فاژ به عنوان معرف مورد استفاده رایج قرار گرفته اند: یک فاژ برای شبیه سازی نسخه های منفرد از ژن ها، و Ml3 برای شبیه سازی و تعیین توالی DNA به روش دی اکسی پایانی. همچنین در آن دوره استفاده از فاکتورهای سیگما جایگزین توسط RNA پلیمراز برای SPOl و T4 ایجاد شده است. به نظر می رسد که این یک مکانیسم به طور گسترده در باکتری ها استفاده می شود، زیرا در هاگ زایی، پاسخ شوک حرارتی و تنظیم متابولیسم نیتروژن نقش دارد. کنترل رونویسی با اتصال پروتئین فاژ CII به ناحیه 35- پروموتر یک یافته اخیر است و مشخص نیست که این مکانیسم چقدر ممکن است گسترده باشد. این پیشرفت سریع من را مشتاق کرد تا سری جدیدی از بررسی ها را درخواست کنم. این کمک ها دو نوع هستند. هر یک از نوع اول به موضوعی می پردازد که نمونه آن انواع فاژها است. فصول از این نوع باید در آموزش دروس پیشرفته مفید باشد. فصل‌های نوع دوم تصاویر جامعی از خانواده‌های فاژی منفرد ارائه می‌دهند و باید اطلاعات ارزشمندی را برای استفاده در آزمایش‌های برنامه‌ریزی ارائه دهند.

It has been 10 years since Plenum included a series of reviews on bacte­ riophages, in Comprehensive Virology. Chapters in that series contained physical-genetic maps but very little DNA sequence information. Now the complete DNA sequence is known for some phages, and the se­ quences for others will soon follow. During the past 10 years two phages have come into common use as reagents: A phage for cloning single copies of genes, and Ml3 for cloning and DNA sequencing by the dideoxy termi­ nation method. Also during that period the use of alternative sigma fac­ tors by RNA polymerase has become established for SPOl and T4. This seems to be a widely used mechanism in bacteria, since it has been implicated in sporulation, heat shock response, and regulation of nitro­ gen metabolism. The control of transcription by the binding of A phage CII protein to the -35 region of the promoter is a recent finding, and it is not known how widespread this mechanism may be. This rapid progress made me eager to solicit a new series of reviews. These contributions are of two types. Each of the first type deals with an issue that is exemplified by many kinds of phages; chapters of this type should be useful in teaching advanced courses. Chapters of the second type provide comprehensive pictures of individual phage families and should provide valuable information for use in planning experiments.