Targeting Functional Centers of the Ribosome

این پایان نامه تحقیقاتی را در مورد نحوه عملکرد، مهار، و تکامل مرکز کاتالیزوری ریبوزومی، مرکز پپتیدیل ترانسفراز (PTC) توصیف می کند - تحقیقاتی که قبلاً به تلاش هایی برای بهبود آنتی بیوتیک های PTC منجر شده است. کاندیدای دکترا دو مطالعه موازی انجام داد. یکی با استفاده از ترکیبی از کریستالوگرافی اشعه ایکس، بیوشیمی، زیست شناسی مولکولی، و مطالعات نظری برای به دست آوردن ساختارهای بلوری ذرات ریبوزومی با آنتی بیوتیک هایی که PTC را هدف قرار می دهند، که حالت های عمل، مقاومت، مقاومت متقاطع و تمایز بین ریبوزوم های پاتوژن های اوباکتریایی را آشکار می کند. و میزبان های یوکاریوتی در مطالعه موازی دوم، کاندید یک زیرساخت ریبوزومی را سنتز کرد - زیرساختی که ممکن است نشان دهنده حداقل موجودیتی باشد که قادر به کاتالیز کردن تشکیل پیوند پپتیدی است - که نور خود را بر منشاء ریبوزوم می‌تاباند.

This thesis describes research into the mode of function, inhibition, and evolution of the ribosomal catalytic center, the Peptidyl Transferase Center (PTC)--research that has already led to attempts at improving PTC antibiotics. The PhD candidate carried out two parallel studies. One using a combination of X-ray crystallography, biochemistry, molecular biology, and theoretical studies to obtain crystal structures of ribosomal particles with antibiotics that target the PTC, revealing the modes of action, resistance, cross-resistance and discrimination between ribosomes of eubacterial pathogens and eukaryotic hosts. In the second parallel study, the candidate synthesized a ribosomal substructure--one that may represent the minimal entity capable of catalyzing peptide bond formation--shedding light on the origin of the ribosome itself.