Systems Biology in Animal Production and Health, Vol. 1

این اثر دو جلدی مروری بر روش‌های مختلف تجربی و آماری، رویکردهای مدل‌سازی و ابزارهای نرم‌افزاری است که برای تولید، ادغام و تجزیه و تحلیل مجموعه‌های داده چند omics به منظور شناسایی نشانگرهای زیستی، نشانگرهای ژنتیکی و پتانسیل موجود است. ژن های علّی برای بهبود تولید و سلامت حیوانات. این کتاب حاوی منابع آنلاینی است که می‌توان به داده‌ها و برنامه‌های اضافی دسترسی داشت. برخی از فصل‌ها همچنین با کدهای برنامه‌نویسی رایانه‌ای و مجموعه داده‌های نمونه ارائه می‌شوند تا تمرین‌های عملی (رایانه‌ای) را به خوانندگان ارائه دهند.

این جلد اول اصول و مفاهیم اولیه زیست‌شناسی سیستم‌ها را با مبانی نظری از جمله ژنتیک، بیان مشترک و شبکه های متابولیک این مؤلفه‌های چند اومیکس زیست‌شناسی سیستم‌ها را از ژنومیک، از طریق رونویسی، پروتئومیکس تا متابولومیک معرفی می‌کند. علاوه بر این، روش‌های آماری و ابزارهای (بیوانفورماتیک) موجود برای مدل‌سازی و تحلیل این مجموعه داده‌ها همراه با فنوتیپ‌ها در تولید و سلامت حیوانات را برجسته می‌کند. این کتاب هم برای دانشجویان و معلمان علوم دامی و دامپزشکی و هم برای محققان این رشته مناسب است.

This two-volume work provides an overview on various state of the art experimental and statistical methods, modeling approaches and software tools that are available to generate, integrate and analyze multi-omics datasets in order to detect biomarkers, genetic markers and potential causal genes for improved animal production and health. The book will contain online resources where additional data and programs can be accessed. Some chapters also come with computer programming codes and example datasets to provide readers hands-on (computer) exercises.

This first volume presents the basic principles and concepts of systems biology with theoretical foundations including genetic, co-expression and metabolic networks. It will introduce to multi omics components of systems biology from genomics, through transcriptomics, proteomics to metabolomics. In addition it will highlight statistical methods and (bioinformatic) tools available to model and analyse these data sets along with phenotypes in animal production and health. This book is suitable for both students and teachers in animal sciences and veterinary medicine as well as to researchers in this discipline.