دسترسی نامحدود
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
برای ارتباط با ما می توانید از طریق شماره موبایل زیر از طریق تماس و پیامک با ما در ارتباط باشید
در صورت عدم پاسخ گویی از طریق پیامک با پشتیبان در ارتباط باشید
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
درصورت عدم همخوانی توضیحات با کتاب
از ساعت 7 صبح تا 10 شب
دسته بندی: مولکولی: بیوانفورماتیک ویرایش: نویسندگان: Dariusz Mrozek سری: Computational Biology ISBN (شابک) : 3319988387, 9783319988382 ناشر: Springer سال نشر: 2018 تعداد صفحات: 331 زبان: English فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) حجم فایل: 12 مگابایت
کلمات کلیدی مربوط به کتاب آنالیز داده های بزرگ مقیاس پذیر برای بیوانفورماتیک پروتئین: راه حل های محاسباتی کارآمد برای ساختار پروتئین: Microsoft Azure، Cloud Computing، الگوریتم ها، تجزیه و تحلیل، Multithreading، Big Data، بیوانفورماتیک، برنامه نویسی موازی، پایگاه های داده رابطه ای، Apache Spark، Apache Hadoop، خوشه ها، ساختار پروتئین، زیست شناسی محاسباتی
در صورت تبدیل فایل کتاب Scalable Big Data Analytics for Protein Bioinformatics: Efficient Computational Solutions for Protein Structures به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.
توجه داشته باشید کتاب آنالیز داده های بزرگ مقیاس پذیر برای بیوانفورماتیک پروتئین: راه حل های محاسباتی کارآمد برای ساختار پروتئین نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.
این کتاب تمرکز بر پروتئین ها و ساختار آنها را ارائه می دهد. این متن راهحلهای مقیاسپذیر مختلفی را برای جستجوی تشابه ساختار پروتئین، که در سطوح نمایش اصلی و برای پیشبینی ساختارهای سهبعدی پروتئینها انجام میشود، توصیف میکند. تاکید بر تکنیک هایی است که می توانند برای تسریع جستجوهای مشابه و فرآیندهای مدل سازی ساختار پروتئین مورد استفاده قرار گیرند. محتوای کتاب به چهار بخش تقسیم شده است. بخش اول اطلاعات پسزمینهای در مورد پروتئینها و سطوح نمایش آنها، از جمله یک مدل رسمی از ساختار پروتئین سهبعدی مورد استفاده در فرآیندهای محاسباتی، و مروری کوتاه بر فناوریهای مورد استفاده در راهحلهای ارائهشده در کتاب، ارائه میکند. بخش دوم کتاب درباره خدمات ابری است که در توسعه برنامههای ابری مقیاسپذیر و قابل اعتماد برای جستجوی شباهت ساختار پروتئین سه بعدی و پیشبینی ساختار پروتئین استفاده میشود. بخش سوم کتاب، استفاده از چارچوبهای محاسباتی دادههای بزرگ مقیاسپذیر، مانند Hadoop و Spark را در همترازیهای ساختار پروتئینی عظیم سه بعدی و شناسایی مناطق ذاتاً بینظم در ساختارهای پروتئینی نشان میدهد. بخش چهارم کتاب بر یافتن شباهتهای ساختار پروتئینی سهبعدی تمرکز دارد که با استفاده از پردازندههای گرافیکی و استفاده از پایگاههای داده چند رشتهای و رابطهای برای جستجوی تقریبی کارآمد در ساختارهای ثانویه پروتئین تسریع شده است. این کتاب تکنیک های پیشرفته و معماری های محاسباتی را معرفی می کند که از دستاوردهای اخیر در زمینه محاسبات و موازی سازی بهره می برند. پیشرفتهای اخیر در علم کامپیوتر به الگوریتمهایی که قبلاً بسیار وقتگیر در نظر گرفته میشدند اجازه میدهد تا اکنون به طور مؤثر برای کاربردهای بیوانفورماتیک و علوم زیستی مورد استفاده قرار گیرند. با توجه به عمق پوشش آن، این کتاب مورد توجه محققان و توسعه دهندگان نرم افزاری است که در زمینه های بیوانفورماتیک ساختاری و پایگاه داده های زیست پزشکی کار می کنند.
This book presents a focus on proteins and their structures. The text describes various scalable solutions for protein structure similarity searching, carried out at main representation levels and for prediction of 3D structures of proteins. Emphasis is placed on techniques that can be used to accelerate similarity searches and protein structure modeling processes. The content of the book is divided into four parts. The first part provides background information on proteins and their representation levels, including a formal model of a 3D protein structure used in computational processes, and a brief overview of the technologies used in the solutions presented in the book. The second part of the book discusses Cloud services that are utilized in the development of scalable and reliable cloud applications for 3D protein structure similarity searching and protein structure prediction. The third part of the book shows the utilization of scalable Big Data computational frameworks, like Hadoop and Spark, in massive 3D protein structure alignments and identification of intrinsically disordered regions in protein structures. The fourth part of the book focuses on finding 3D protein structure similarities, accelerated with the use of GPUs and the use of multithreading and relational databases for efficient approximate searching on protein secondary structures. The book introduces advanced techniques and computational architectures that benefit from recent achievements in the field of computing and parallelism. Recent developments in computer science have allowed algorithms previously considered too time-consuming to now be efficiently used for applications in bioinformatics and the life sciences. Given its depth of coverage, the book will be of interest to researchers and software developers working in the fields of structural bioinformatics and biomedical databases.
Front Matter ....Pages i-xxvi
Front Matter ....Pages 1-1
Formal Model of 3D Protein Structures for Functional Genomics, Comparative Bioinformatics, and Molecular Modeling (Dariusz Mrozek)....Pages 3-27
Technological Roadmap (Dariusz Mrozek)....Pages 29-48
Front Matter ....Pages 49-49
Azure Cloud Services (Dariusz Mrozek)....Pages 51-67
Scaling 3D Protein Structure Similarity Searching with Azure Cloud Services (Dariusz Mrozek)....Pages 69-102
Cloud Services for Efficient Ab Initio Predictions of 3D Protein Structures (Dariusz Mrozek)....Pages 103-134
Front Matter ....Pages 135-135
Foundations of the Hadoop Ecosystem (Dariusz Mrozek)....Pages 137-150
Hadoop and the MapReduce Processing Model in Massive Structural Alignments Supporting Protein Function Identification (Dariusz Mrozek)....Pages 151-182
Scaling 3D Protein Structure Similarity Searching on Large Hadoop Clusters Located in a Public Cloud (Dariusz Mrozek)....Pages 183-214
Scalable Prediction of Intrinsically Disordered Protein Regions with Spark Clusters on Microsoft Azure Cloud (Dariusz Mrozek)....Pages 215-247
Front Matter ....Pages 249-249
Massively Parallel Searching of 3D Protein Structure Similarities on CUDA-Enabled GPU Devices (Dariusz Mrozek)....Pages 251-282
Exploration of Protein Secondary Structures in Relational Databases with Multi-threaded PSS-SQL (Dariusz Mrozek)....Pages 283-309
Back Matter ....Pages 311-315