Protein Modelling

در این جلد، شرح مفصلی از روش‌های محاسباتی پیشرفته که برای مدل‌سازی پروتئین و همچنین کاربردهای خاص اعمال می‌شوند، ارائه شده است. فصل‌ها عبارتند از: کاربرد تکنیک‌های Car-Parrinello برای مکانیسم‌های آنزیمی، طرح کلی و کاربرد روش‌های QM/MM، میدان‌های نیروی قطبی‌پذیر، روش‌های اخیر اتصال لیگاند، دینامیک مولکولی مرتبط با طیف‌سنجی NMR، بهینه‌سازی کامپیوتری جذب، توزیع، متابولیسم و دفع افزایش یافته توسط سمیت برای داروها، طراحی آنزیم و بیوانفورماتیک اعمال شده برای پیش بینی ساختار پروتئین. تاکید زیادی بر ارائه واضح مفاهیم پیچیده شده است، زیرا هدف این کتاب در درجه اول دکتری است. دانش آموزانی که نیاز به بینش در مدل سازی پروتئین به روز دارند. گنجاندن شکل‌های توصیفی و رنگی به خواننده این امکان را می‌دهد که تصویری تصویری از مسائل ساختاری پیچیده به دست آورد.

In this volume, a detailed description of cutting-edge computational methods applied to protein modeling as well as specific applications are presented. Chapters include: the application of Car-Parrinello techniques to enzyme mechanisms, the outline and application of QM/MM methods, polarizable force fields, recent methods of ligand docking, molecular dynamics related to NMR spectroscopy, computer optimization of absorption, distribution, metabolism and excretion extended by toxicity for drugs, enzyme design and bioinformatics applied to protein structure prediction. A keen emphasis is laid on the clear presentation of complex concepts, since the book is primarily aimed at Ph.D. students, who need an insight in up-to-date protein modeling. The inclusion of descriptive, color figures will allow the reader to get a pictorial representation of complicated structural issues.