Protein Bioinformatics: From Protein Modifications and Networks to Proteomics

این جلد روش‌های تحقیق بیوانفورماتیک برای پروتئین‌ها را با تمرکز ویژه بر اصلاحات پس از ترجمه پروتئین (PTMs) و شبکه‌ها معرفی می‌کند. این کتاب در چهار بخش سازماندهی شده است و چارچوب اساسی و منابع اصلی برای تجزیه و تحلیل توالی پروتئین، ساختار و عملکرد را پوشش می دهد. رویکردها و منابع برای تجزیه و تحلیل PTM های پروتئین، برهمکنش های پروتئین-پروتئین (PPIs) و شبکه های پروتئین، از جمله ابزارهایی برای پیش بینی PPI و رویکردهای ساخت شبکه های PPI و PTM. و رویکردهای بیوانفورماتیک در پروتئومیکس، از جمله روش‌های محاسباتی برای پروتئومیکس مبتنی بر طیف‌سنجی جرمی و تحلیل یکپارچه برای ایزوفرم‌های اسپلایس جایگزین، برای کشف عملکردی. این فصل‌ها که با فرمت بسیار موفق مجموعه روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی یا محاسباتی گام به گام، قابل تکرار آسان و نکات می‌شوند. در مورد عیب‌یابی و اجتناب از دام‌های شناخته شده.

پیش‌روز و کامل، بیوانفورماتیک پروتئین: از اصلاحات و شبکه‌های پروتئینی تا پروتئومیکس منبع ارزشمندی برای خوانندگانی است که می‌خواهند در مورد وضعیت موجود بیاموزند. پایگاه‌های اطلاعاتی و ابزارهای بیوانفورماتیک، روش‌های محاسباتی جدید، و روندهای آینده در تجزیه و تحلیل داده‌های پروتئین و پروتئومی در زیست‌شناسی سیستم‌ها. این کتاب برای محققانی که در صنایع بیوتکنولوژی و داروسازی و در بخش‌های مختلف دانشگاهی مانند علوم زیستی و پزشکی و علوم کامپیوتر و مهندسی کار می‌کنند مفید است.

This volume introduces bioinformatics research methods for proteins, with special focus on protein post-translational modifications (PTMs) and networks. This book is organized into four parts and covers the basic framework and major resources for analysis of protein sequence, structure, and function; approaches and resources for analysis of protein PTMs, protein-protein interactions (PPIs) and protein networks, including tools for PPI prediction and approaches for the construction of PPI and PTM networks; and bioinformatics approaches in proteomics, including computational methods for mass spectrometry-based proteomics and integrative analysis for alternative splice isoforms, for functional discovery. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory or computational protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Cutting-edge and thorough, Protein Bioinformatics: From Protein Modifications and Networks to Proteomics is a valuable resource for readers who wish to learn about state-of-the-art bioinformatics databases and tools, novel computational methods, and future trends in protein and proteomic data analysis in systems biology. This book is useful to researchers who work in the biotechnology and pharmaceutical industries, and in various academic departments, such as biological and medical sciences and computer sciences and engineering.