Phylogenetic Supertrees: Combining information to reveal the Tree of Life

این اولین کتاب در مورد \"ابردرختان فیلوژنتیک\" است، یک توسعه اخیر اما بحث برانگیز برای استنتاج درختان تکاملی. به جای تجزیه و تحلیل مستقیم داده های ترکیبی کاراکترهای اولیه، ساخت ابردرخت با ترکیب توپولوژی های درختی به دست آمده از آن داده ها پیش می رود. این تفاوت در استراتژی امکان هیجان‌انگیز فیلوژنی‌های بزرگ‌تر و کامل‌تر از آنچه در حال حاضر امکان‌پذیر است، با پتانسیل ایجاد تحول در تحقیقات مبتنی بر تکامل را فراهم کرده است. این کتاب نگاهی جامع به ابردرخت‌ها، از روش‌های مورد استفاده برای ساخت ابردرخت‌ها تا اهمیت ابردرخت‌ها تا تحقیقات بیوانفورماتیک و بیولوژیکی را ارائه می‌کند. بررسی بسیاری از روش‌های اصلی ابردرخت ارائه شده و چهار تکنیک جدید، از جمله اجرای بیزی ابردرخت، برای اولین بار شرح داده شده‌اند. تأثیر گسترده ابردرختان بر تحقیقات بیولوژیکی هم به صورت کلی و هم از طریق نمونه‌های خاص از کلاسه‌های مختلف مانند گیاهان گلدار، ونگل‌ها و نخستی‌ها برجسته می‌شود. این کتاب همچنین به بررسی انتقادی بسیاری از چالش‌های برجسته و زمینه‌های مشکل برای این رشته نسبتاً جدید می‌پردازد و راه را برای ساخت ابردرخت در عصر ژنومیک نشان می‌دهد. مشارکت‌های میان رشته‌ای از اکثر مقامات برجسته در ساخت ابردرخت در تمام زمینه‌های جامعه بیوانفورماتیک (زیست‌شناسی، علوم کامپیوتر و ریاضیات) تضمین می‌کند که این کتاب مرجع ارزشمندی با جذابیت گسترده برای هر کسی است که علاقه‌مند به استنتاج فیلوژنتیک است.

This is the first book on "phylogenetic supertrees", a recent, but controversial development for inferring evolutionary trees. Rather than analyze the combined primary character data directly, supertree construction proceeds by combining the tree topologies derived from those data. This difference in strategy has allowed for the exciting possibility of larger, more complete phylogenies than are otherwise currently possible, with the potential to revolutionize evolutionarily-based research. This book provides a comprehensive look at supertrees, ranging from the methods used to build supertrees to the significance of supertrees to bioinformatic and biological research. Reviews of many the major supertree methods are provided and four new techniques, including a Bayesian implementation of supertrees, are described for the first time. The far-reaching impact of supertrees on biological research is highlighted both in general terms and through specific examples from diverse clades such as flowering plants, even-toed ungulates, and primates. The book also critically examines the many outstanding challenges and problem areas for this relatively new field, showing the way for supertree construction in the age of genomics. Interdisciplinary contributions from the majority of the leading authorities on supertree construction in all areas of the bioinformatic community (biology, computer sciences, and mathematics) will ensure that this book is a valuable reference with wide appeal to anyone interested in phylogenetic inference.