Modern Proteomics – Sample Preparation, Analysis and Practical Applications

ویرایش: 1 
نویسندگان: Hamid Mirzaei. Martin Carrasco (eds.)  
سری: Advances in Experimental Medicine and Biology 919 
ISBN (شابک) : 9783319414461, 9783319414485 
ناشر: Springer International Publishing 
سال نشر: 2016 
تعداد صفحات: 525 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 19 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 28,000



این جلد به عنوان یک کتابچه راهنمای مرجع پروتئومیکس عمل می کند که طراحی و اجرای آزمایشی را توصیف می کند. این کتاب همچنین تعداد زیادی مثال را نشان می دهد که با استفاده از تکنیک های پروتئومیکس چه چیزی می توان به دست آورد. به عنوان یک حوزه نسبتاً جوان از تحقیقات علمی، وسعت و عمق وضعیت فعلی هنر در پروتئومیکس ممکن است برای همه کاربران بالقوه آشکار نباشد. کتاب‌ها و مقالات مروری مختلفی وجود دارد که جنبه‌های خاصی از پروتئومیکس را پوشش می‌دهند، اما اغلب فاقد جزئیات فنی هستند. ادبیات موضوعی خاص همچنین فاقد کلیات کلی است که برای طراحی آزمایشی مورد نیاز است که در آن همه مراحل سازگار و منسجم باشند. هدف این کتاب ایجاد یک کتابچه راهنمای پروتئومیکس بود تا به دانشمندانی که در این زمینه متخصص نیستند، مروری بر موارد زیر ارائه دهد:

1. انواع نمونه ها را می توان با طیف سنجی جرمی برای آنالیز پروتئومیکس آنالیز کرد.

2. راه‌هایی برای تبدیل نمونه‌های بیولوژیکی یا اکولوژیکی به آنالیت‌های آماده برای تجزیه و تحلیل طیفی جرمی.

3. راه‌هایی برای کاهش پیچیدگی پروتئوم برای دستیابی به پوشش بهتر پروتئین‌های سازنده.

4. نحوه کار طیف‌سنج‌های جرمی مختلف و روش‌های متفاوتی که می‌توان از آنها برای تجزیه و تحلیل پروتئومیکس استفاده کرد

5. پلتفرم‌های مختلفی که برای تجزیه و تحلیل داده‌های پروتئومیکس در دسترس هستند

6. کاربردهای مختلف فناوری‌های پروتئومیکس در علوم زیستی و پزشکی

این کتاب باید برای هر کسی که علاقه‌مند به فناوری‌های پروتئومیکس، بیوانفورماتیک مرتبط با پروتئومیکس و تولید و تفسیر داده‌های پروتئومیکس است، جذاب باشد. با مجموعه گسترده و فصول نوشته شده توسط متخصصان در این زمینه، اطلاعاتی وجود دارد که برای دانش آموزان و همچنین برای محققانی که به دنبال آشنایی با نقاط قوت، ضعف و فرصت های پروتئومیکس هستند، ارزشمند است.

</ p>

This volume serves as a proteomics reference manual, describing experimental design and execution. The book also shows a large number of examples as to what can be achieved using proteomics techniques. As a relatively young area of scientific research, the breadth and depth of the current state of the art in proteomics might not be obvious to all potential users. There are various books and review articles that cover certain aspects of proteomics but they often lack technical details. Subject specific literature also lacks the broad overviews that are needed to design an experiment in which all steps are compatible and coherent. The objective of this book was to create a proteomics manual to provide scientists who are not experts in the field with an overview of:

1. The types of samples can be analyzed by mass spectrometry for proteomics analysis.

2. Ways to convert biological or ecological samples to analytes ready for mass spectral analysis.

3. Ways to reduce the complexity of the proteome to achieve better coverage of the constituent proteins.

4. How various mass spectrometers work and different ways they can be used for proteomics analysis

5. The various platforms that are available for proteomics data analysis

6. The various applications of proteomics technologies in biological and medical sciences

This book should appeal to anyone with an interest in proteomics technologies, proteomics related bioinformatics and proteomics data generation and interpretation. With the broad setup and chapters written by experts in the field, there is information that is valuable for students as well as for researchers who are looking for a hands on introduction into the strengths, weaknesses and opportunities of proteomics.

Front Matter....Pages i-ix
Front Matter....Pages 1-1
Proteomes, Their Compositions and Their Sources....Pages 3-21
Protein Fractionation and Enrichment Prior to Proteomics Sample Preparation....Pages 23-41
Sample Preparation for Mass Spectrometry-Based Proteomics; from Proteomes to Peptides....Pages 43-62
Plant Structure and Specificity – Challenges and Sample Preparation Considerations for Proteomics....Pages 63-81
Improving Proteome Coverage by Reducing Sample Complexity via Chromatography....Pages 83-143
Front Matter....Pages 145-145
Database Search Engines: Paradigms, Challenges and Solutions....Pages 147-156
Mass Analyzers and Mass Spectrometers....Pages 157-169
Top-Down Mass Spectrometry: Proteomics to Proteoforms....Pages 171-200
Front Matter....Pages 201-201
Platforms and Pipelines for Proteomics Data Analysis and Management....Pages 203-215
Tandem Mass Spectrum Sequencing: An Alternative to Database Search Engines in Shotgun Proteomics....Pages 217-226
Visualization, Inspection and Interpretation of Shotgun Proteomics Identification Results....Pages 227-235
Protein Inference....Pages 237-242
Modification Site Localization in Peptides....Pages 243-247
Useful Web Resources....Pages 249-253
Mass Spectrometry-Based Protein Quantification....Pages 255-279
Bioinformatics Tools for Proteomics Data Interpretation....Pages 281-341
Front Matter....Pages 343-343
Identification, Quantification, and Site Localization of Protein Posttranslational Modifications via Mass Spectrometry-Based Proteomics....Pages 345-382
Protein-Protein Interaction Detection Via Mass Spectrometry-Based Proteomics....Pages 383-396
Protein Structural Analysis via Mass Spectrometry-Based Proteomics....Pages 397-431
Front Matter....Pages 433-433
Introduction to Clinical Proteomics....Pages 435-441
Front Matter....Pages 433-433
Discovery of Candidate Biomarkers....Pages 443-462
Statistical Approaches to Candidate Biomarker Panel Selection....Pages 463-492
Qualification and Verification of Protein Biomarker Candidates....Pages 493-514
Protocol for Standardizing High-to-Moderate Abundance Protein Biomarker Assessments Through an MRM-with-Standard-Peptides Quantitative Approach....Pages 515-530
Back Matter....Pages 531-533