Microbial Gene Essentiality: Protocols and Bioinformatics

ضرورت ژن میکروبی: پروتکل‌ها و بیوانفورماتیک شامل مجموعه‌ای جامع از استراتژی‌ها و تکنیک‌های تجربی و محاسباتی برای مطالعات ضروری در مقیاس ژنوم میکروبی است که توسط گروه‌های پیشرو در این زمینه توسعه و ارائه شده است. علاوه بر پروتکل‌های آزمایشگاهی مرطوب، این کتاب (من) روش‌های آماری ضروری برای برنامه‌ریزی صفحه‌های ضروری در مقیاس بزرگ، و همچنین برای ارزیابی و تجزیه و تحلیل داده‌ها را شرح می‌دهد. (ب) پیش‌بینی درون سیلیکونی ضرورت ژن با استفاده از مدل‌های متابولیک بازسازی‌شده در مقیاس ژنوم. و (iii) یکپارچه سازی داده ها و تجزیه و تحلیل مقایسه ای در زمینه پایگاه های داده ژنومی. این جلد یک راهنمای اولیه برای انتخاب مناسب ترین استراتژی برای مطالعات ضروری برنامه ریزی شده در اختیار محققان قرار می دهد. جنبه‌های تجربی و محاسباتی در تجزیه و تحلیل اساسی ژن در مقیاس ژنوم، مانند سایر فناوری‌های ژنومی، به همان اندازه مهم هستند و ضرورت ژن میکروبی: پروتکل‌ها و بیوانفورماتیک هر دوی این جنبه‌ها را منعکس می‌کند. همه پروتکل‌ها از روش‌های موفق در قالب سری Biology Molecular پیروی می‌کنند، هر کدام مقدمه‌ای را ارائه می‌دهند که اصول پشت تکنیک‌ها، دستورالعمل‌های گام به گام، فهرست‌هایی از تجهیزات و معرف‌های لازم، و نکاتی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از دام‌ها را بیان می‌کند و در نظر گرفته شده است. هم برای دانشمندان تازه کار و هم برای دانشمندان متخصص.

Microbial Gene Essentiality: Protocols and Bioinformatics contains a comprehensive collection of experimental and computational strategies and techniques for microbial genome-scale essentiality studies, developed and presented by the leading groups in the field. In addition to wet-lab protocols, the book describes (i) statistical methods essential for planning successful large-scale essentiality screens, as well for data evaluation and analysis; (ii) in-silico prediction of gene essentiality using genome-scale reconstructed metabolic models; and (iii) data integration and comparative analysis in the context of genomic databases. This volume provides researchers with a first-stop guide for choosing the most appropriate strategy for planned essentiality studies. Experimental and computational aspects are equally important in genome-scale gene essentiality analysis, as in all other genomic technologies, and Microbial Gene Essentiality: Protocols and Bioinformatics reflects both of these aspects. All protocols follow the successful Methods in Molecular Biology™ series format, each offering an introduction outlining the principles behind the techniques, step-by-step instructions, lists of the necessary equipment and reagents, and tips on troubleshooting and avoiding pitfalls, and are intended for both novice and expert scientists.