Microbial Environmental Genomics (MEG)

این جلد، محققان را در مورد چگونگی توصیف، تصویربرداری از گونه‌های نادر و  تا کنون ناشناخته و برهمکنش‌های آنها راهنمایی می‌کند تا عملکردها و زیست‌مولکول‌های جدید را شناسایی کنند و بفهمند که چگونه تغییرات محیطی فعالیت و واکنش ارگانیسم‌هایی را که با ما زندگی می‌کنند، مشروط می‌کنند. و در محیط ما.

فصل‌ها انواع مختلف ارگانیسم‌ها (مانند باستان‌ها، باکتری‌ها، قارچ‌ها، اعتراض، میکروفون و میکرویوکاریوت‌ها) را پوشش می‌دهند و پروتکل‌های دقیقی را برای تولید DNA با کیفیت بالا پیشنهاد می‌کنند. تجزیه و تحلیل جوامع میکروبی فعال به طور مستقیم در تعاملات یا فرآیندهای پیچیده از طریق کاوش ایزوتوپ پایدار، برای شناسایی و مشخص کردن ژن های عملکردی جدید، به تصویر کشیدن درجا تعاملات و به کارگیری ابزارهای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک به داده های پیچیده متاژنومی یا توالی RNAseq. این فصل‌ها با فرمت موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی  نوشته شده‌اند و شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های گام به گام و به راحتی قابل تکرار است. و یادداشت هایی در مورد عیب یابی و اجتناب از دام های شناخته شده.

معتبر و پیشرفته،  ژنومیکس محیطی میکروبی (MEG): روش‌ها و پروتکل‌ها، ویرایش دوم هدف دارد به عنوان یک مرجع تحقیقاتی اولیه برای محققان میکروبیولوژی که در زمینه در حال گسترش اکولوژی مولکولی و ژنومیک محیطی.

This volume guides researchers on how to characterize, image rare, and  hitherto unknown taxa and their interactions, to identify new functions and biomolecules and to understand how environmental changes condition the activity and the response of the organisms living with us and in our environment.

Chapters cover different organism types (i.e., archaea, bacteria, fungi, protest, microfauna and microeukaryotes) and propose detailed protocols to produce high quality DNA, to analyse active microbial communities directly involved in complex interactions or processes through stable isotope probing, to identify and characterize of new functional genes, to image in situ interactions and to apply bioinformatics analysis tools to complex metagenomic or RNAseq sequence data. Written in the successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and cutting-edge, Microbial Environmental Genomics (MEG): Methods and Protocols, Second Edition aims to serve as a primary research reference for researchers in microbiology working to in the expanding field of molecular ecology and environmental genomics.