Mathematical Methods for Protein Structure Analysis and Design: C.I.M.E. Summer School, Martina Franca, Italy, July 9-15, 2000. Advanced Lectures

مقالات جمع‌آوری‌شده در این مجلد، مشارکت‌های پیشرو کارگاه آموزشی بین‌المللی مدرسه‌ای را که با هدف ایجاد یک رشد سرسام‌آمیز در رشته‌ای فوری سازمان‌دهی و نگهداری می‌شد، بازتولید می‌کنند. در واقع، حوزه تا کردن پروتئین، اتصال و هم ترازی در پاسخ به نیازهای ترکیبی از تخصص های ناهمگون که شامل زیست شناسی، شیمی، ریاضیات، علوم کامپیوتر، و آمار و غیره است، در حال توسعه است. برخی از مشکلاتی که در این زمینه با آن مواجه می‌شوند، نه تنها برای چالش‌های علمی که ایجاد می‌کنند، بلکه برای فرصت‌هایی که در میان بهره‌برداری پزشکی و صنعتی آشکار می‌کنند نیز مهم هستند. نمونه غیرعادی ناشی از برهمکنش پروتئین-دارو (داکینگ)، مشکلی که مشکلات محاسباتی دلهره‌آوری را در تقاطع هندسه، فیزیک و شیمی ایجاد می‌کند، و در عین حال، مشکلی با پیامدهای غیرقابل تصور برای فارماکوپه آینده. این مدرسه بر مشکلات ناشی از مطالعه مکانیسم‌ها - تاخوردگی پروتئین عقبی متمرکز شد و راه‌های مختلف حمله به این مشکلات را تحت ارزیابی عینی روش‌ها بررسی کرد. همراه با هسته نسبتاً کوچکی از دانش و ابزار تلفیقی، بازتاب‌های مهمی با مطالعات در جهت‌ها و رویکردهای متعدد به این عرصه ارائه شد. واضح است که نمی توان پیش بینی کرد که کدام یک از این تکنیک ها، در صورت وجود، کاملاً موفق خواهند بود، اما دقیقاً دیالکتیک ضمنی در میان آنهاست که به بهترین وجه میل فعلی را منتقل می کند. چنین تنوع و غنای منحصربه‌فردی الهام‌بخش قالب جلسه بود، و همچنین انحراف جزئی جلد حاضر از قالب معمولی در این مجموعه را توضیح می‌دهد: نمایش رسوب فعلی در اینجا با مجموعه‌ای از مشارکت‌های تخصصی با کیفیت تکمیل می‌شود.< /p>

The papers collected in this volume reproduce contributions by leading sch- arstoaninternationalschoolandworkshopwhichwasorganizedandheldwith thegoaloftakinga snapshotofadiscipline undertumultuous growth. Indeed, the area of protein folding, docking and alignment is developing in response to needs for a mix of heterogeneous expertise spanning biology, chemistry, mathematics, computer science, and statistics, among others. Some of the problems encountered in this area are not only important for the scienti?c challenges they pose, but also for the opportunities they disclose intermsofmedicalandindustrialexploitation. Atypicalexampleiso?eredby protein-drug interaction (docking), a problem posing daunting computational problems at the crossroads of geometry, physics and chemistry, and, at the same time, a problem with unimaginable implications for the pharmacopoeia of the future. The schoolfocused on problems posed by the study of the mechanisms - hind protein folding, and explored di?erent ways of attacking these problems under objective evaluations of the methods. Together with a relatively small core of consolidated knowledge and tools, important re?ections were brought to this e?ort by studies in a multitude of directions and approaches. It is obviously impossible to predict which, if any, among these techniques will prove completely successful, but it is precisely the implicit dialectic among them that best conveys the current ?avor of the ?eld. Such unique diversity and richness inspired the format of the meeting, and also explains the slight departure of the present volume from the typical format in this series: the exposition of the current sediment is complemented here by a selection of quali?ed specialized contributions.