Marine Genomics: Methods and Protocols

این جلد آخرین پروتکل‌ها را برای آنالیزهای آزمایشگاهی و بیوانفورماتیکی در زمینه ژنومیک دریایی ارائه می‌کند. فصول ارائه شده در کتاب طیف وسیعی از موضوعات را شامل می‌شود، از جمله نمونه‌برداری و ژنومیک جوامع باکتریایی، استخراج DNA در موجودات دریایی، توالی‌یابی با توان بالای کل ژنوم‌های میتوکندری، فیلوژنومیک، کشف SNP، آرایه‌های SNP برای شناسایی گونه‌ها، دیجیتال روش‌های کمی‌سازی مبتنی بر PCR، DNA محیطی برای نظارت و پایش گونه‌های مهاجم، ریزآرایه‌ها برای تشخیص پاتوژن‌های موجود در آب، بارکد DNA تنوع زیستی دریایی، پروتکل‌های metabarcoding برای یوکاریوت‌های دریایی، پروتکل‌های تحلیلی برای تجسم تنوع یوکاریوتی، و کاربردهای داده‌ها برای شاخص های اعماق دریا برای پایش محیطی این فصل‌ها با فرمت بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و به آسانی قابل تکرار و نکاتی در مورد عیب‌یابی است. و اجتناب از دام های شناخته شده.

جدید و کامل، ژنومیک دریایی: روش ها و پروتکل ها منبع ارزشمندی برای محققان، دانشجویان و سیاست گذاران در زمینه زیست شناسی دریایی است.< /p>

This volume presents the latest protocols for both laboratory and bioinformatics based analyses in the field of marine genomics. The chapters presented in the book cover a wide range of topics, including the sampling and genomics of bacterial communities, DNA extraction in marine organisms, high-throughput sequencing of whole mitochondrial genomes, phylogenomics, SNP discovery, SNP-arrays for species identification, digital PCR-based quantification methods, environment DNA for invasive species surveillance and monitoring, microarrays for the detection of waterborne pathogens, DNA barcoding of marine biodiversity, metabarcoding protocols for marine eukaryotes, analytical protocols for the visualization of eukaryotic diversity, and applications for genomic data to benthic indices for environmental monitoring. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introduction to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Cutting-edge and thorough, Marine Genomics: Methods and Protocols is a valuable resource for researchers, students, and policy makers in the field of marine biology.