Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols: Meso- and Microcosms

این جلد روش‌هایی را برای شبیه‌سازی محیط‌های طبیعی با استفاده از آزمایش‌های میان و کیهان قابل تکرار و کنترل برای تجزیه و تحلیل میکروارگانیسم‌های تجزیه‌کننده هیدروکربن و آزمایش فرضیه‌ها توصیف می‌کند. جنبه‌های مهم آماده‌سازی مجموعه‌های آزمایشی، کاربرد هیدروکربن و نمونه‌برداری را ارائه می‌کند، و پروتکل‌هایی را برای آزمایش‌ها با انواع مختلف نمونه‌ها، مانند بیوفیلم‌ها، سیستم‌های آبی (مانند آب‌های زیرزمینی، نهرها)، و رسوبات، از جمله نوسانات اکسیژن-آوکسیک ارائه می‌کند. mesocosms، و همچنین برای آزمایش در محل در رسوبات جزر و مدی و عمیق. دو فصل به کشت در شرایط فشار بالا اختصاص دارد و چندین فصل شامل پروتکل هایی برای پردازش نمونه ها برای تجزیه و تحلیل شیمیایی، میکروبی یا فعالیت پایین دست است. بسیاری از رویکردهای ارائه شده عمومی هستند و برای هر کسی که طراحی آزمایش‌های میان و کیهان کوچک را آغاز کند مفید خواهد بود.

پروتکل های میکروب شناسی هیدروکربن و لیپید

ده ها هزار هیدروکربن، مشتقات هیدروکربنی و لیپیدهای ساختاری مختلف وجود دارد و مجموعه وسیعی از این مولکول ها برای سلول ها مورد نیاز است. تابع. چرخه جهانی هیدروکربن، که عمدتا توسط میکروارگانیسم ها هدایت می شود، تأثیر زیادی بر محیط زیست و آب و هوای ما دارد. میکروب ها مسئول پاکسازی آلودگی های زیست محیطی ناشی از بهره برداری از مخازن هیدروکربنی هستند و همچنین در کاهش اتکای ما به سوخت های فسیلی با ارائه سوخت های زیستی، پلاستیک ها و مواد شیمیایی صنعتی نقش اساسی دارند. به دست آوردن درک درستی از عملکردهای مربوط به طیف وسیعی از میکروب ها که هیدروکربن ها و ترکیبات مرتبط را تولید، مصرف و اصلاح می کنند، کلید پاسخگویی به این چالش ها خواهد بود. این مجموعه جامع از پروتکل‌های فعلی و در حال ظهور، کسب این درک و بهره‌برداری از فعالیت‌های مفید چنین میکروبی را تسهیل می‌کند.

This Volume describes methods for simulating natural environments by using reproducible and controllable meso- and microcosm experiments to analyse hydrocarbon-degrading microorganisms and to test hypotheses. It presents important aspects of the preparation of experimental set-ups, hydrocarbon application and sampling, and features protocols for experiments with different types of samples, such as biofilms, aquatic systems (e.g. groundwater, streams), and sediments, including oscillating oxic-anoxic mesocosms, as well as for in-situ experimentation in subtidal and deep sediments. Two chapters are dedicated to cultivation under high-pressure conditions, and several chapters include protocols for processing samples for downstream chemical, microbial or activity analyses. Several of the approaches presented are generic and will benefit anyone embarking on designing meso- and microcosm experiments. <

Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols

There are tens of thousands of structurally different hydrocarbons, hydrocarbon derivatives and lipids, and a wide array of these molecules are required for cells to function. The global hydrocarbon cycle, which is largely driven by microorganisms, has a major impact on our environment and climate. Microbes are responsible for cleaning up the environmental pollution caused by the exploitation of hydrocarbon reservoirs and will also be pivotal in reducing our reliance on fossil fuels by providing biofuels, plastics and industrial chemicals. Gaining an understanding of the relevant functions of the wide range of microbes that produce, consume and modify hydrocarbons and related compounds will be key to responding to these challenges. This comprehensive collection of current and emerging protocols will facilitate acquisition of this understanding and exploitation of useful activities of such microbes.