مشخصات کتاب

Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra

ویرایش:  
نویسندگان: Geraldine A. Van der Auwera,  Brian D. O'Connor  
سری:  
ISBN (شابک) : 9781491975145, 1491975148 
ناشر: O'Reilly Media, Inc. 
سال نشر: 2020 
تعداد صفحات: 496 
زبان: English 
فرمت فایل : EPUB (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 28 Mb 

در صورت تبدیل فایل کتاب Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.

توجه داشته باشید کتاب ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.

توضیحاتی در مورد کتاب ژنومیک در ابر: استفاده از Docker، GATK، و WDL در Terra

داده ها در زمینه ژنومیک در حال رونق است. تنها در چند سال، سازمان‌هایی مانند مؤسسه ملی سلامت (NIH) میزبان بیش از 50 پتابایت یا بیش از 50 میلیون گیگابایت از داده‌های ژنومی خواهند بود و آنها به زیرساخت‌های ابری روی می‌آورند تا این داده‌ها را در دسترس جامعه تحقیقاتی قرار دهند. . چگونه ابزارها و پروتکل های تجزیه و تحلیل را برای دسترسی و تجزیه و تحلیل آن حجم از داده ها در فضای ابری تطبیق می دهید؟ با استفاده از این کتاب کاربردی، محققان نحوه کار با الگوریتم‌های ژنومیک را با استفاده از ابزارهای منبع باز از جمله جعبه ابزار تجزیه و تحلیل ژنوم (GATK)، Docker، WDL و Terra یاد خواهند گرفت. Geraldine Van der Auwera، متولی قدیمی جامعه کاربران GATK، و برایان اوکانر از مؤسسه ژنومیک UC Santa Cruz، شما را در این فرآیند راهنمایی می‌کنند. شما با کار با داده های واقعی و الگوریتم های ژنومیک از این زمینه یاد خواهید گرفت. این کتاب موارد زیر را شامل می‌شود: پیش‌زمینه فناوری محاسباتی و ژنومیک اساسی عملیات محاسبات ابری اولیه شروع به کار با GATK، به‌علاوه سه خط لوله مهم بهترین روش‌های GATK، تجزیه و تحلیل خودکار با جریان‌های کاری اسکریپت‌شده با استفاده از WDL و Cromwell افزایش مقیاس اجرای گردش کار در ابر، از جمله موازی‌سازی و بهینه‌سازی هزینه، تحلیل تعاملی در ابر با استفاده از نوت‌بوک‌های Jupyter همکاری امن و تکرارپذیری محاسباتی با استفاده از Terra

توضیحاتی درمورد کتاب به خارجی

Data in the genomics field is booming. In just a few years, organizations such as the National Institutes of Health (NIH) will host 50+ petabytes—or over 50 million gigabytes—of genomic data, and they’re turning to cloud infrastructure to make that data available to the research community. How do you adapt analysis tools and protocols to access and analyze that volume of data in the cloud? With this practical book, researchers will learn how to work with genomics algorithms using open source tools including the Genome Analysis Toolkit (GATK), Docker, WDL, and Terra. Geraldine Van der Auwera, longtime custodian of the GATK user community, and Brian O’Connor of the UC Santa Cruz Genomics Institute, guide you through the process. You’ll learn by working with real data and genomics algorithms from the field. This book covers: Essential genomics and computing technology background Basic cloud computing operations Getting started with GATK, plus three major GATK Best Practices pipelines Automating analysis with scripted workflows using WDL and Cromwell Scaling up workflow execution in the cloud, including parallelization and cost optimization Interactive analysis in the cloud using Jupyter notebooks Secure collaboration and computational reproducibility using Terra

نظرات کاربران

کتاب های تصادفی

دانلود کتاب Genocide in Bangladesh

دانلود کتاب Feminism and the Mastery of Nature (Opening Out)

دانلود کتاب Superfuel: the future of thorium, the zero-risk alternative power source that will solve the world energy crisis

دانلود کتاب Job Hunting for Rookies

دانلود کتاب Making Dimensional Wood Plaques