مشخصات کتاب

From protein structure to function with bioinformatics

ویرایش: 2ed. 
نویسندگان: Rigden. Daniel John (eds.)  
سری:  
ISBN (شابک) : 9789402410679, 9402410678 
ناشر: Springer 
سال نشر: 2017 
تعداد صفحات: 509 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 9 مگابایت 

کلمات کلیدی مربوط به کتاب از ساختار پروتئین تا عملکرد با بیوانفورماتیک: پروتئین ها -- روابط ساختار-فعالیت -- تحقیق -- روش شناسی، پروتئین ها -- ساختار -- تحقیق -- روش شناسی، پروتئین ها -- ساختار، پروتئین ها -- ساختار -- شبیه سازی کامپیوتری، بیوانفورماتیک، ترکیب پروتئین ها، توالی اسیدهای آمینه، پروتئین ها -- فیزیولوژی، زیست شناسی محاسباتی، مدل ها، شیمی، پروتئومیکس.

در صورت تبدیل فایل کتاب From protein structure to function with bioinformatics به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.

توجه داشته باشید کتاب از ساختار پروتئین تا عملکرد با بیوانفورماتیک نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.

توضیحاتی در مورد کتاب از ساختار پروتئین تا عملکرد با بیوانفورماتیک

این کتاب در مورد بیوانفورماتیک ساختاری پروتئین و چگونگی کمک به درک و پیش‌بینی عملکرد پروتئین است. این روش‌های مبتنی بر ساختار را پوشش می‌دهد که می‌توانند عملکرد پروتئین را بر اساس چین‌های کلی، ویژگی‌های سطوح پروتئین، وقوع نقش‌های سه بعدی کوچک، برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین و ویژگی‌های دینامیکی اختصاص داده و توضیح دهند. چنین روش‌هایی به استخراج حداکثر ارزش از ساختارهای تجربی جدید کمک می‌کنند، اما اغلب می‌توانند برای مدل‌های پروتئینی اعمال شوند. بنابراین، این کتاب همچنین پوشش جامعی از روش‌های پیش‌بینی یا استنباط ساختار پروتئین را ارائه می‌کند، که تمام کلاس‌های ساختاری از پروتئین‌های کروی و همتایان ساکن غشاء آن‌ها تا ساختارهای آمیلوئید و پروتئین‌های ذاتاً بی‌نظم را پوشش می‌دهد. این کتاب به دو بخش بزرگ تقسیم شده است، اولی روش‌های تولید یا استنتاج ساختار پروتئین را پوشش می‌دهد، بخش دوم به حاشیه‌نویسی عملکرد مبتنی بر ساختار می‌پردازد. هر فصل توسط متخصصان جهانی در این زمینه نوشته شده است. بخش اول روش‌هایی را شامل می‌شود که از مدل‌سازی همسانی سنتی و تشخیص چین‌ها گرفته تا روش‌های اولیه مبتنی بر قطعه را پوشش می‌دهد، و شامل یک فصل جدید برای ویرایش دوم، در مورد پیش‌بینی ساختار با استفاده از کوواریانس تکاملی است. پروتئین‌های غشایی و پروتئین‌های ذاتاً بی‌نظم هر کدام فصل‌های اختصاص داده شده‌اند، در حالی که دو فصل جدید به ساختارهای آمیلوئید و ابزارهایی برای پیش‌بینی حالت‌های تعامل پروتئین-پروتئین می‌پردازند. بخش دوم شامل فصل‌هایی است که تنوع عملکردی در چین‌های پروتئینی و ابزارهایی برای اختصاص عملکرد بر اساس ویژگی‌های سطحی و نقوش تکرار شونده را پوشش می‌دهد. فصل‌های بعدی نقش‌های کلیدی پویایی پروتئین در عملکرد پروتئین و استفاده از سرورهای خودکار برای استنتاج عملکرد را پوشش می‌دهند. این کتاب با دو فصل به پایان می رسد که شامل مطالعات موردی پیش بینی ساختار، به ترتیب بر اساس ساختارهای کریستالی و مدل های پروتئینی است، و نمونه های متعددی از استفاده در دنیای واقعی از روش هایی که قبلا ذکر شد ارائه می دهد. این کتاب برای دانشجویان مقاطع تحصیلات تکمیلی و محققین دانشگاهی مورد توجه قرار گرفته است. به وضوح مورد توجه بیوانفورماتیکان پروتئین و زیست شناسان ساختاری است، اما همچنین باید با برجسته کردن بینش هایی که بیوانفورماتیک ساختاری می تواند در مورد پروتئین های مورد علاقه آنها ارائه دهد، به عنوان راهنمای زیست شناسان به طور گسترده تر عمل کند.

توضیحاتی درمورد کتاب به خارجی

This book is about protein structural bioinformatics and how it can help understand and predict protein function. It covers structure-based methods that can assign and explain protein function based on overall folds, characteristics of protein surfaces, occurrence of small 3D motifs, protein-protein interactions and on dynamic properties. Such methods help extract maximum value from new experimental structures, but can often be applied to protein models. The book also, therefore, provides comprehensive coverage of methods for predicting or inferring protein structure, covering all structural classes from globular proteins and their membrane-resident counterparts to amyloid structures and intrinsically disordered proteins. The book is split into two broad sections, the first covering methods to generate or infer protein structure, the second dealing with structure-based function annotation. Each chapter is written by world experts in the field. The first section covers methods ranging from traditional homology modelling and fold recognition to fragment-based ab initio methods, and includes a chapter, new for the second edition, on structure prediction using evolutionary covariance. Membrane proteins and intrinsically disordered proteins are each assigned chapters, while two new chapters deal with amyloid structures and means to predict modes of protein-protein interaction. The second section includes chapters covering functional diversity within protein folds and means to assign function based on surface properties and recurring motifs. Further chapters cover the key roles of protein dynamics in protein function and use of automated servers for function inference. The book concludes with two chapters covering case studies of structure prediction, based respectively on crystal structures and protein models, providing numerous examples of real-world usage of the methods mentioned previously. This book is targeted at postgraduate students and academic researchers. It is most obviously of interest to protein bioinformaticians and structural biologists, but should also serve as a guide to biologists more broadly by highlighting the insights that structural bioinformatics can provide into proteins of their interest.

فهرست مطالب

Front Matter....Pages i-xv
Front Matter....Pages 1-1
Ab Initio Protein Structure Prediction....Pages 3-35
Protein Structures, Interactions and Function from Evolutionary Couplings....Pages 37-58
Fold Recognition....Pages 59-90
Comparative Protein Structure Modelling....Pages 91-134
Advances in Computational Methods for Transmembrane Protein Structure Prediction....Pages 135-165
Bioinformatics Approaches to the Structure and Function of Intrinsically Disordered Proteins....Pages 167-203
Prediction of Protein Aggregation and Amyloid Formation....Pages 205-263
Prediction of Biomolecular Complexes....Pages 265-292
Front Matter....Pages 293-293
Function Diversity Within Folds and Superfamilies....Pages 295-325
Function Prediction Using Patches, Pockets and Other Surface Properties....Pages 327-360
3D Motifs....Pages 361-392
 Protein Dynamics : From Structure to Function....Pages 393-425
Integrated Servers for Structure-Informed Function Prediction....Pages 427-448
Case Studies: Function Predictions of Structural Genomics Results....Pages 449-465
Prediction of Protein Function from Theoretical Models....Pages 467-498
Back Matter....Pages 499-503

نظرات کاربران

کتاب های تصادفی

دانلود کتاب New Directions for Organization Theory: Problems and Prospects

دانلود کتاب The Rules of Disorder (Social Worlds of Childhood)

دانلود کتاب The Visual (Un)Conscious and Its (Dis)Contents A microtemporal approach

دانلود کتاب Limit Distributions for Sums of Independent Random Variables. Revised Edition

دانلود کتاب Coding for Absolute Beginners: Master the Basics of Computer Programming with Python, Java, SQL, C, C++, C#, HTML, and CSS