Evolucion. El Curso de la Vida

Contenido
Primera Parte: El Curso de la Vida
Capítulo 1  Origen y Crecimiento del Pensamiento Evolutivo, 37
Precursores del pensamiento evolutivo, 40; Las ideas de Charles Darwin (1809-1882), 
58; Argumentos que apoyan la evolución, 63; Externalismo versus internalismo, 68
Capítulo 2  Historia Planetaria y Vida Primigenia, 71
Historia de la vida en la Tierra y el registro fósil, 74; Fósiles y la explosión del 
Cámbrico, 74; Burgess Shale, 78; Colonización del ambiente terrestre, 85; El contexto 
histórico de la evolución de los cordados, 87; Extinciones masivas, 93
Capítulo 3  Sistemas Complejos y Orígenes del Orden, 97
El modelo de la complejidad, 100; Teoría general de sistemas, 102; Estructuras 
disipativas, 103; Origen del orden y autoorganización de la materia, 105; Teoría del 
Caos, 107; Geometría fractal de la naturaleza, 108; Gaia: el Planeta Viviente, 109; El 
modelo de las margaritas, 110
Capítulo 4  Síntesis Moderna o Neodarwinismo, 113
Adaptacionismo, 118; El gradualismo filético, 120; Equilibrios intermitentes, 121; 
Selección de especies, 123; La darwinización de Mendel, 126; La neodarwinización 
de la ecología, 128
Capítulo 5  Equilibrio Poblacional, 131
La visión poblacional de la evolución, 135; El axioma de Hardy-Weinberg como 
principio antievolutivo, 138; Factores de cambio de las frecuencias génicas, 140; 
Mutación, 140; Mutaciones adaptativas, 141; Selección natural, 143; Cálculo de la 
adecuación biológica (w) y del coeficiente de selección (s), 143; Selección total contra 
un alelo dominante, 145; Selección parcial contra el alelo recesivo, 146; Selección 
natural,, 146; modelos genético-cuantitativos, 146; y la evolución de la plasticidad 
fenotípica, 146; Selección direccional, 147; Selección estabilizante o normalizante, 
147; Selección diversificante o disruptiva y mantención de los polimorfismos 
balanceados, 148; Carga genética y costo de la selección, 150; Endogamia, 151; 
Coeficiente de endogamia (F), 152; Cambios aleatorios en las frecuencias alélicas: 
deriva génica (σ), 154; Cuellos de botella demográficos y genéticos producidos por 
erupción volcánica, 156; Poblaciones y biología de la conservación, 157; Tamaño 
poblacional efectivo ( Ne ), 158; Influencia de las fluctuaciones poblacionales 
sobre el Ne, 159; Efecto fundador, 161; Controversias poblacionales, 162; Genética 
cuantitativa, 168; Selección natural y genética cuantitativa , 170; El origen de la 
endotermia, 171
Capítulo 6  Especies y Especiación: Realidad, Proceso y Resultado, 175
Las especies, 177; El concepto biológico de especie, 181; Concepto fenético de especie, 
183; Las especies bacterianas, 184; Especiación, 186; Críticas a la visión neodarwiniana 
de especiación, 187; Especiación mediante hibridización, 187; Especiación mediante 
duplicación genómica total: alopoliploidía, 190; Especiación alopátrica, 191; Especies 
en anillo, 196; Experimentos de laboratorio en especiación, 197; Especies y radiación 
adaptativa, 198; Realidad de las especies, 199; Genómica y especiación, 201; Cómo 
procede el origen de las especies, 202; Consideraciones epistemológicas sobre la 
especiación, 203
Capítulo 7  Sistemática e Inducción Filogenética, 205
Transformación de los caracteres, 209; Cladogramas y árboles, 211; Árboles 
enraizados y no enraizados, 213; Filogenia, sistemática y homología, 215; Escuelas de 
clasificación, 216; Observaciones, rasgos y evidencias en el pensamiento filogenético, 
218; Inferencia filogenética, 219; Análisis de los caracteres, 220; Métodos algorítmicos 
de reconstrucción filogenética, 220; Métodos de optimización, 222; Evaluación y 
confiabilidad de los métodos de inferencia filogenética, 223; Duplicación génica 
y homología molecular, 223; Pasos hacia una nueva concepción filogenética, 224; 
Reticulación, 228
Capítulo 8  Descendencia con Modificación y el Árbol de la Vida, 233
Plantae, 240; Panorama actual de la clasificación animal, 245; El árbol de la vida, 248
Capítulo 9  Biogeografía, Deriva Continental y Migraciones, 253
Origen de los continentes, 258; Deriva continental, 261; Tectónica de placas, 263; 
Disgregación del supercontinente Pangea, 264; Escuelas biogeográficas, 267; Regiones 
o reinos biogeográficos, 272; Filogeografía y teoría de coalescencia, 274; Teoría de 
coalescencia, 275; Biogeografía de islas, 279; El Gran Intercambio Biótico Americano 
(GIBA), 280; Orogénesis de los Andes y GIBA, 285; Indicadores biogeográficos: 
Nothofagus,287; La Amazonía través del tiempo, 288; Mares interiores, Pebas y la 
biota sudamericana, 289; Origen de las gallinas en Sudamérica, 290; Origen de los 
roedores en Sudamérica, 291; Origen y evolución de los marsupiales, 291; Glaciaciones, 
292; Patagonia, glaciaciones cíclicas y desplazamientos bióticos , 292; Alteraciones 
climáticas y bióticas en el extremo austral del Cono Sur , 294; Poblamiento humano 
de América, 296; Huellas genéticas humanas, 297; La ruta de migración costera, 298; 
El origen híbrido de Homo sapiens,302; Contrastación de hipótesis en biogeografía, 
305
Capítulo 10  Cromosomas y Herencia Vertical, 309
Centrómeros, 315; Traslocaciones robertsonianas, 318; Diferencias cromosómicas 
y especies crípticas en jerbos del género Taterillus,319; El modelo de especiación 
cromosómica, 320; Ingeniería evolutiva y especiación cromosómica, 323; Especiación 
por poliploidía, 324; Transformación de los sistemas de determinación del sexo, 328; 
Determinación cromosómica del sexo en mamíferos, 330; Determinación del sexo sin 
Sry y sin cromosoma Y, 330; Compensación de dosis e inactivación del cromosoma 
X en mamíferos euterios, 331; Estimación del número cromosómico ancestral de los 
vertebrados, 334
Capítulo 11  Transformaciones Moleculares y Genómicas, 339
Teoría neutral de evolución molecular, 342; El Reloj Molecular, 345; Los genes de 
eucariontes, 348; Tasas de sustitución nucleotídica, 350; Elementos no codificantes 
y cambios genéticos rápidos y neutros, 354; Duplicación génica y adaptación, 356; 
Evolución concertada, 359; Un delirio reduccionista:, 360; el gen como unidad 
evolutiva, 360; Secuencias repetidas, LINES y la evolución del genoma, 362; 
Evolución genómica y la paradoja del Valor C, 363; Visión panorámica de algunos 
genomas completos [Diatomeas, 371; Algas, 372; Plantas, 372; Betarraga, 373; 
Protistas, 373; Paramecium tetraurelia, 373;El genoma de las esponjas y la evolución 
de la complejidad animal, 375; Ctenóforos, 375; Cefalópodos, 376; Equinodermos, 
377; Tunicados, 377]; Genómica comparada de cordados [El genoma de amphioxus 
(Branchiostoma floridae),378; Genomas de peces, 379; El genoma de la gallina, 380; 
El genoma del ornitorrinco (Ornithorhynchus anatinus),381; El genoma marsupial, 
382; El genoma de los euterios: la rata (Rattus rattus),384; El genoma del ratón 
(Mus musculus),385; El genoma humano (Homo sapiens)y del chimpancé (Pan 
troglodytes),385]; El genoma antes y después de la secuenciación, 389; Dinámica 
genómica y macroevolución, 391
Segunda Parte: otro Curso de la Vida
Capítulo 12  Macroevolución, 397
Introducción, 399
Transferencia lateral de genes, flujo génico a través de la biosfera, 404
Transferencia de genes, cromosomas y genomas completos, 408; Origen asexual de 
especies poliploides por TGL, 409; Transferencia lateral de genes a través del Árbol 
de la Vida, 410; Adquisición de adaptaciones complejas por transferencia génica 
lateral, 412
Alopoliploidía: hibridización, de linajes y duplicación genómica total, 415
Hipótesis 2R, 3R y 5R, 416; Poliploidía en bacterias, 419; Poliploidía en animales, 
420; El caso del roedor imposible, 420; Hipótesis 2R de poliploidización en los 
vertebrados, 423; Hipotesis 5R en vegetales, 427
El paradójico origen de los Phyla, 429
Crustáceos [Cirripedia, 434; Sobre el origen híbrido de los percebes (Thecostraca, 
Cirripedia), 436; Rhyzocephala, 436]
A la caza de la realidad: el controvertido origen de las larvas, 438
[Incongruencias larvarias, 440]; Phyla animales con larva trocófora: poliquetos, 
equiuroideos, sipunculoideos y moluscos, 442; Origen del lofóforo y de las quimeras, 
445; Origen de la larva de los cordados, 447; Experimentos de hibridización entre 
ascidias y erizos de mar, 447
Radiación macroevolutiva de los mamíferos euterios, 450
Capítulo 13  Novedades Evolutivas, 455
Introducción, 457
Despliegue evolutivo del mundo bacteriano, 461
El Dominio Archaea , 461; El pangenoma bacteriano, 462; Percepción mayoritaria 
(quorum sensing),467
El origen de la multicelularidad, 469
Multicelularidad naciente: las esponjas, 471; Origen de los sistemas neurales: los 
ctenóforos, 473; Origen de los cnidocitos de Cnidaria, 474; Origen de los Eucariontes, 
475; Origen del núcleo, 479; Acerca del origen de las plantas, 480
Novedades del desarrollo y las raíces de Evo-Devo, 484
Novedades ontogenéticas, 485; Biología molecular del desarrollo , 489; La epigénesis, 
492; Regulación génica en cis, 494; La orquestación del desarrollo en Drosophila 
melanogaster,497; Los genes Hox en Drosophila melanogaster,501; Los genes Hox en 
mamíferos, 503; Origen de la cabeza y del cerebro de los vertebrados, 504; Regulación 
génica y relojes circadianos, 505; Reclutamiento génico (coopción), 506; La ontogenia 
vegetal, 507; Homologías profundas, 508; Inferencia ontogenética: el ancestro 
Urbilaterio, 511; Reorganización genómica, metamorfosis y macroevolución en insectos 
holometábolos, 512; El paradigma evolutivo Evo-Devo, 513; Éxtasis y agonía de los genes 
Hox, 518; Evolución de los rasgos complejos, 522
Emergencia, sistemas complejos y origen de la vida, 527
Vida primigenia, 530; El origen de la vida, 534
Capítulo 14  Epistemología, Contexto Histórico y Teoría Evolutiva Actual, 543
Adam Smith, el libre mercado, 545; y la economía de la naturaleza, 545
Herbert Spencer (1820-1903) y la sobrevivencia del más apto, 548; La doctrina del shock,
Malthus y la eugenesia, 550; Darwin al desnudo, 554; Darwinismo social. Un ejemplo, 556
La estructura de la síntesis evolutiva y sus limitaciones, 559
Las dificultades del darwinismo, 562 [Ideas lamarckianas, 562; Desdén por la 
macroevolución, 562; La pugna estructura-función, 563; Extrapolación, 563; Confusión 
entre eliminación por selección natural, 563; y muerte por predación, 563; La vida 
como un campo de batalla, 563; El sojuzgamiento de la naturaleza, 564; Quimerismo y 
argumentación post hoc,565; Explicación ambiental en referencia a los Rhizocephala 
(Crustacea, Cirripedia), 566]; Domesticación de Evo-Devo, 567; Hipótesis ecológicas 
sobre la explosión del Cámbrico, 568; Interpretaciones filogenéticas, 569
La visión de recepción de la teoría evolutiva, 570
La teoría sintética de la evolución como sistema axiomático, 574; Principios 
axiomáticos, 575; Axiomas darwinianos y neodarwinianos, 576
La vision semántica de la teoría evolutiva, 582
Filosofía popperiana, método hipotético-deductivo y creacionismo, 588
Modelos biológicos, 588; El método hipotético-deductivo, 589; Creacionismo 
y evolución, 592; Diseño Inteligente: el nuevo atuendo del creacionismo, 594; 
Sociobiología o la biologización de las ciencias sociales, 595
Capítulo 15  Naturaleza y Ética, 597
Simbiosis, holobiontes y singamia, 599
Endosimbiosis y el genoma de las algas , 605; ¿Origen simbiótico de Cnidaria?, 607; 
Holobiontes y hologenomas, 608; Quimerismo, 610; Singamia, fusión genómica y el 
origen de la diversidad biótica, 614
Gaia: la metáfora del Planeta Viviente, 620
El mundo de las margaritas, 624; y consideraciones epistemológicas, 624
La revolución bacteriana y la visión de Carl Woese, 628
Biología para un nuevo siglo, 628; ¿Dos imperios o tres dominios?, 632; El árbol de la 
vida y el ancestro universal, 635; Teoría de la célula, 636
Ciencia y humanismo: la visión de Erwin Schrödinger, 639
Ciencia y humanismo, 642
La visión organísmica de Ludwig von Bertalanffy, 645
Hacia una física de los sistemas biológicos, 647
El concepto de naturaleza, 651; Naturaleza y ética, 653; Coda, 655
Apéndices, 659
Glosario, 661; Literatura citada, 674; Índice alfabético, 720