Encyclopedia of Metagenomics: Environmental Metagenomics

متاژنومیکس به‌عنوان یکی از زمینه‌های مهم تحقیقاتی مطرح شده است. این رشته پیامدهای گسترده ای برای سلامت و بیماری انسان، تولید حیوانات و سلامت محیط دارد. متاژنومیکس حجم زیادی از داده ها، ابزارها، فن آوری ها و برنامه های کاربردی را به ما باز کرده است که به ما امکان می دهد به اکثر موجوداتی که هنوز در فرهنگ خالص نمی توانیم به آنها دسترسی پیدا کنیم (تخمین زده شده 99٪ از زندگی میکروبی). گروه های تحقیقاتی متعددی در حال توسعه ابزارها، رویکردها و برنامه های کاربردی برای مقابله با این زمینه جدید هستند، زیرا مجموعه داده های بزرگتری از محیط هایی از جمله بدن انسان، اقیانوس ها و خاک در حال تولید است. به عنوان مثال به ابتکار میکروبیوم انسانی (HMP) که به یک تلاش جهانی تبدیل شده است و بررسی های نمونه برداری اقیانوس جهانی (GOS) را ببینید. تعداد انتشاراتی که از طریق PubMed اندازه‌گیری می‌شوند و بر متاژنومیک متمرکز هستند همچنان در حال افزایش است. زمینه متاژنومیکس با مجموعه داده های مشترک بزرگی که در دسترس جامعه علمی است به تکامل خود ادامه می دهد. برای جمع آوری همه این اطلاعات در یک مکان متمرکز به تلاشی هماهنگ نیاز است. با داشتن تمام اطلاعات در یک دایره المعارف، ما فرصتی برای دریافت کمک های اساسی از رهبران این حوزه داریم و در عین حال این اطلاعات را از طریق کالج ها، کتابخانه ها و فقط از طریق در اختیار تعداد قابل توجهی از دانشمندان جوان و ارشد قرار می دهیم. دسترسی آنلاین این فرمت همچنین به دانشمندان کشورهای در حال توسعه اجازه می دهد تا به این حوزه رو به رشد دسترسی مستمر داشته باشند. پیش‌بینی می‌شود که این دایره‌المعارف توسط بسیاری از گروه‌های دیگر از جمله پزشکان، دانشجویان مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد، و همچنین گروه‌های اخلاقی و قانونی مرتبط یا علاقه‌مند به موضوعات پیرامون علم متاژنوم استفاده شود.

Metagenomics has taken off as one of the major cutting-edge fields of research. The field has broad implications for human health and disease, animal production and environmental health. Metagenomics has opened up a wealth of data, tools, technologies and applications that allow us to access the majority of organisms that we still cannot access in pure culture (an estimated 99% of microbial life). Numerous research groups are developing tools, approaches and applications to deal with this new field, as larger data sets from environments including the human body, the oceans and soils are being generated. See for example the human microbiome initiative (HMP) which has become a world-wide effort and the Global Ocean Sampling (GOS) surveys. The number of publications as measured through PubMed that are focused on metagenomics continues to increase. The field of metagenomics continues to evolve with large common datasets available to the scientific community. A concerted effort is needed to collate all this information in a centralized place. By having all the information in an Encyclopedia form, we have an opportunity to receive seminal contributions from the leaders in the field and at the same time provide this information to a significant number of junior and senior scientists, via colleges, libraries, and just through online access. This format also allows scientists in the developing world to have continued access to this growing field. It is anticipated that the Encyclopedia will also be used by many other groups including, clinicians, undergraduate and graduate level students, as well as ethical and legal groups associated with or interested in the issues surrounding metagenome science.