Dissecting Regulatory Interactions of RNA and Protein: Combining Computation and High-throughput Experiments in Systems Biology

کار شرح داده شده در این کتاب نمونه ای عالی از تحقیقات بین رشته ای در زیست شناسی سیستم ها است. این نشان می‌دهد که چگونه می‌توان از مفاهیم و رویکردهای حوزه فیزیک برای پاسخ به سؤالات و گزارش‌های بیولوژیکی در مورد روش‌شناسی جدید که شامل تحلیل‌های خلاقانه مبتنی بر رایانه از داده‌های بیولوژیکی با کارایی بالا است، استفاده کرد. بسیاری از یافته های شرح داده شده در کتاب، که حاصل همکاری نویسنده (یک دانشمند نظری) و زیست شناسان تجربی و بین آزمایشگاه های مختلف است، در مجلات با کیفیت بالا مانند Molecular Cell و Nature منتشر شده است. با این حال، در حالی که این انتشارات به جنبه های مختلف تنظیم ژن پس از رونویسی می پردازند، این کتاب دیدگاهی کامل، منسجم و منطقی از پروژه تحقیقاتی به عنوان یک کل را در اختیار خوانندگان قرار می دهد. مقدمه تنظیم ژن پس از رونویسی را از زاویه‌ای مشخص ارائه می‌کند، جنبه‌های تئوری اطلاعات و تکامل را برجسته می‌کند و زمینه را برای سؤالات مطرح شده در فصل‌های بعدی، که به تنظیم رونوشت به‌عنوان حامل عملکردی اولیه اطلاعات ژنتیکی فعال مربوط می‌شود، ایجاد می‌کند.

The work described in this book is an excellent example of interdisciplinary research in systems biology. It shows how concepts and approaches from the field of physics can be efficiently used to answer biological questions and reports on a novel methodology involving creative computer-based analyses of high-throughput biological data. Many of the findings described in the book, which are the result of collaborations between the author (a theoretical scientist) and experimental biologists and between different laboratories, have been published in high-quality peer-reviewed journals such as Molecular Cell and Nature. However, while those publications address different aspects of post-transcriptional gene regulation, this book provides readers with a complete, coherent and logical view of the research project as a whole. The introduction presents post-transcriptional gene regulation from a distinct angle, highlighting aspects of information theory and evolution and laying the groundwork for the questions addressed in the subsequent chapters, which concern the regulation of the transcriptome as the primary functional carrier of active genetic information.