Differential Display Methods and Protocols

پنگ لیانگ و همکاران با استانداردهای بالای اولین نسخه از روش‌های نمایش دیفرانسیل. نسخه دوم خود را بر اساس مدل ریاضی جدیدی از نمایشگر دیفرانسیل (DD) استوار کرده اند که از اتوماسیون و همچنین جمع آوری و تجزیه و تحلیل داده های دیجیتال بهره می برد. این نویسندگان متبحر، تمام اصلاحات روش‌شناختی اخیر را توضیح داده و برجسته می‌کنند، از جمله مدیریت خودکار مایع صدها تنظیم واکنش DD PCR همراه با الکتروفورز مویرگی، یک برنامه کامپیوتری نمونه اولیه که به طور خودکار امکان شناسایی باند مثبت از یک تصویر نمایش دیفرانسیل فلورسانس، و قطعه محدود را فراهم می‌کند. غربالگری‌های مبتنی بر DD که می‌توانند هر قطعه cDNA را مستقیماً به یک ژن معین مرتبط کنند، وقتی اطلاعات توالی همه رونوشت‌ها در دسترس قرار گرفت. دیگر پیشرفت‌های مورد بحث، ترکیب ریزآرایه‌های DD و DNA با کاهش پیچیدگی پروب‌های cDNA و در عین حال افزایش حساسیت تشخیص، و رویکرد DD برای تشخیص بیان mRNA پروکاریوتی است. نویسندگان همچنین قدرت فناوری DD را با مجموعه‌ای از نمونه‌های برجسته از کاربردهای DD و روش‌های آزمایشی دقیق نشان می‌دهند. مطالعات ظریفی که در اینجا توضیح داده شده است منجر به کشف بسیاری از ژن های مهم درگیر در عفونت ویروسی، بیماری پریون، سرطان، تخمک گذاری، ساعت شبانه روزی، رنگ گل، خاموشی ژن سرکوب رونویسی، پلی مورفیسم mRNA و برهمکنش پروتئین-RNA شده است.
پیشرفته ترین و بسیار کاربردی، روش های نمایش دیفرانسیل، ویرایش دوم به شکارچیان ژن امکان غربالگری جامع DD در سطح ژنوم و همچنین یک نقشه راه اثبات شده برای هر اکسپدیشن موفق "ماهیگیری ژن" را ارائه می دهد. .

Carrying on the high standards of the first edition of Differential Display Methods, Peng Liang et al. have based their second edition on a new mathematical model of differential display (DD) that takes advantage of automation, as well as digital data acquisition and analysis. These well-versed authors explain and highlight all the recent methodological refinements, including automated liquid handling of hundreds of DD PCR reaction setups combined with capillary electrophoresis, a prototype computer program to automatically allow positive band identification from a fluorescence differential display image, and restriction fragment-based DD screenings that can link any cDNA fragment directly to a given gene once the sequence information of all transcripts becomes available. Other improvements discussed are combining DD and DNA microarrays by reducing the complexity of cDNA probes while increasing the sensitivity of detection, and a DD approach to detect prokaryotic mRNA expression. The authors also demonstrate the power of DD technology with a collection of outstanding examples of DD applications and detailed experimental procedures. The elegant studies described here have led to the discovery of many important genes involved in viral infection, Prion disease, cancer, ovulation, circadian clock, floral color, transcription repression gene silencing, mRNA polymorphism, and protein-RNA interaction.
State-of-the-art and highly practical, Differential Display Methods, Second Edition offers gene hunters the possibility of genome-wide comprehensive DD screening, as well as a proven road map for any successful "gene fishing" expedition.