Comparative Genomics: International Workshop, RECOMB-CG 2010, Ottawa, Canada, October 9-11, 2010. Proceedings

پیچیدگی تکامل ژنوم چالش های هیجان انگیزی را برای زیست شناسان محاسباتی به وجود آورده است. طیف متنوعی از تکنیک‌های الگوریتمی، آماری، ریاضی برای روشن کردن تاریخچه مولکول‌ها هر ساله توسعه می‌یابد و بسیاری از آنها در کارگاه ماهواره‌ای RECOMB در ژنومیکس مقایسه‌ای ارائه می‌شوند. این مکانی است که در آن دانشمندانی که روی همه جنبه‌های ژنومیک مقایسه‌ای کار می‌کنند، می‌توانند ایده‌هایی را در مورد توسعه ابزارها و کاربرد آن‌ها برای سؤالات مربوطه به اشتراک بگذارند. این جلد شامل مقالات ارائه شده در RECOMB-CG 2010 است که در 9 تا 11 اکتبر در اتاوا برگزار شد. همانطور که از مقالات ارائه شده در سال جاری مشاهده می‌شود، این بخش همچنان پرمغز است: بسیاری از پیشرفت‌ها ترکیبیات بازآرایی ژنوم را غنی می‌کنند، در حالی که فیلوژنی‌های مرتبه ژنی به لطف ترکیبی از اصول ترکیبی و آماری، مرتبط با سرعت، بیشتر و بیشتر می‌شوند. و اکتشافی متفکرانه چندین مقاله تمایل به بازسازی مدل‌های تکامل ژنوم دارند و رویدادهای ژنومی بیشتری را می‌توان مدل‌سازی کرد، از جانشینی تک نوکلئوتیدی در هم‌ترازی‌های کل ژنوم گرفته تا جهش‌های ساختاری بزرگ یا انتقال افقی ژن.

The complexity of genome evolution has given birth to exciting challenges for computational biologists. A various range of algorithmic, statistical, mathem- ical techniques to elucidate the histories of molecules are developed each year and many are presented at the RECOMB satellite workshop on Comparative Genomics. It is a place where scientists working on all aspects of comparative genomics can share ideas on the development of tools and their application to relevant questions. This volume contains the papers presented at RECOMB-CG 2010, held on October 9–11 in Ottawa. The ?eld is still ?ourishing as seen from the papers presented this year: many developments enrich the combinatorics of genome rearrangements, while gene order phylogenies are becoming more and more - curate, thanks to a mixing of combinatorial and statistical principles, associated with rapid and thoughtful heuristics. Several papers tend to re?ne the models of genome evolution, and more and more genomic events can be modeled, from single nucleotide substitutions in whole genome alignments to large structural mutations or horizontal gene transfers.