Annotating New Genes: From In Silico Screening To Experimental Validation

ویرایش: 1 
نویسندگان: S Uchida  
سری: Woodhead Publishing Series in Biomedicine 
ISBN (شابک) : 1907568689, 9781908818126 
ناشر: Woodhead Publishing 
سال نشر: 2012 
تعداد صفحات: 197 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 6 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 52,000

در سال های اخیر، تعدادی از بسته های نرم افزاری دانشگاهی و تجاری و پایگاه های داده برای تجزیه و تحلیل و غربالگری داده های بیولوژیکی توسعه یافته است. با این حال، قابلیت استفاده از این داده ها توسط ژن های به اصطلاح جدید که هیچ عملکرد بیولوژیکی به آنها اختصاص داده نشده است، به خطر می افتد. حاشیه‌نویسی ژن‌های جدید رویکردی را برای تجزیه و تحلیل ژن‌های حفظ‌شده تکاملی و غنی‌شده با عملکردهای ناشناخته، ارائه می‌کند و شرح گام به گام این روش را از غربالگری تا اعتبار ارائه می‌دهد. این کتاب با ارائه مقدمه‌ای بر پایگاه‌های داده و نرم‌افزارهای موجود آغاز می‌شود، قبل از اینکه دستورالعمل‌های برنامه‌نویسی را پوشش دهد، از جمله یک مطالعه موردی خاص در مورد استفاده از C-It برای غربالگری سیلیکو. نیمه دوم کتاب راهنمای گام به گام مفاهیم و روش‌های اعتبارسنجی تجربی و همچنین مروری بر کاربردهای بالقوه اضافی این رویکرد در زمینه سلول‌های بنیادی و بازسازی بافت ارائه می‌کند، قبل از اینکه فصل پایانی مفاهیم را خلاصه کند. و تئوری های ارائه شده.

• نه تنها بر غربالگری، بلکه بر اعتبارسنجی های بیولوژیکی نیز تمرکز دارد
• جزئیاتی از پایگاه های داده و محصولات نرم افزاری (واسط وب) را برای زیست شناسان با حداقل مهارت های محاسباتی ارائه می کند
• یک طرح کلی گام به گام از روش درگیر ارائه می دهد

In recent years, a number of academic and commercial software packages and databases have been developed for the analysis and screening of biological data; however, the usability of these data is compromised by so-called novel genes to which no biological function is assigned. Annotating new genes outlines an approach to the analysis of evolutionary-conserved, heart-enriched genes with unknown functions, offering a step-by-step description of the procedure from screening to validation. The book begins by offering an introduction to the databases and software available, before moving on to cover programming guidelines, including a specific case study on the use of C-It for in silico screening. The second half of the book offers a step-by-step guide to experimental validation concepts and procedures, as well as an overview of additional potential applications of this approach in the field of stem cells and tissue regeneration, before a concluding chapter summarises the concepts and theories presented.

• Focuses not only on screening but also on biological validations
• Provides details of databases and software (web interface) products for biologists with minimal computation skills
• Offers a step-by-step outline of the procedure involved