Systems Chemical Biology: Methods and Protocols

این جلد جدیدترین تکنیک‌های موجود در آزمایشگاه مرطوب و روش‌های محاسباتی را برای مطالعه رفتار مولکول‌های کوچک درون سلولی و برهمکنش‌های آنها با اهدافشان بررسی می‌کند. فصل‌های این کتاب موضوعاتی مانند مدل‌های مرتبط با بیماری برای مطالعات زیست‌شناسی شیمیایی، درگیری هدف با استفاده از سنجش تغییر حرارت سلولی یا انتقال انرژی تشدید بیولومینسانس را مورد بحث قرار می‌دهند. تجسم مولکول های کوچک فعال زیستی میکروسکوپ رامان. (فسفو-)پروتئومیکس و ترانس کریپتومیکس برای مطالعات حالت عمل، پروفایل کموژنومیک مبتنی بر CRISPR/Cas9 در سلول‌های پستانداران. پیش بینی تداخلات دارویی با استفاده از رویکردهای محاسباتی. مقایسه پروفایل های ناشی از ترکیب با استفاده از تصویربرداری با محتوای بالا یا پانل های رده سلولی سرطان و ابزارهای مبتنی بر وب برای پیش بینی پلی فارماکولوژی. این فصل‌ها که با فرمت بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام، قابل تکرار آسان و نکاتی در مورد عیب‌یابی است. و اجتناب از دام های شناخته شده.

پیشرفته و کامل، سیستم های زیست شناسی شیمیایی: روش ها و پروتکل ها منبع ارزشمندی برای دانشمندان و محققان مبتدی یا متخصص است که در تلاش برای شروع یا ادامه زیست شناسی شیمیایی خود هستند. در سطح سیستمی مطالعه می کند.

This volume explores the latest available wet-lab techniques and computational methods to study in-cell small-molecule behavior and interactions with their targets. The chapters in this book discuss topics such as disease-relevant models for chemical biology studies, target engagement using cellular thermal shift assay or bioluminescence resonance energy transfer; visualization of bio-active small molecules Raman microscopy; (phospho-)proteomics and transcriptomics for mode-of-action studies, CRISPR/Cas9-based chemogenomic profiling in mammalian cells; predicting drug interactions using computational approaches; comparison of compound-induced profiles using high-content imaging or cancer cell line panels and web-based tools for polypharmacology prediction. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Cutting-edge and thorough, Systems Chemical Biology: Methods and Protocols is a valuable resource for novice or expert scientists and researchers trying to initiate or continue their chemical biology studies at a systems level.