RNA 3D Structure Analysis and Prediction

با افزایش چشمگیر تعیین ساختار سه بعدی RNA در سال های اخیر، اکنون می دانیم که مولکول های RNA ساختار بسیار بالایی دارند. علاوه بر این، دانش ساختارهای سه بعدی RNA برای درک جزئیات اتمی چگونگی انجام عملکردهای بیولوژیکی خود بسیار مهم است. به دلیل تعداد بسیار زیاد مولکول‌های بالقوه مهم RNA در زیست‌شناسی، بسیار بیشتر از آنچه که بتوان به صورت تجربی مورد مطالعه قرار داد، ما به رویکردهای نظری برای پیش‌بینی ساختارهای سه‌بعدی تنها بر اساس توالی‌ها نیاز داریم. این جلد یک مرور کلی از پیشرفت فعلی در این زمینه توسط متخصصان برجسته ارائه می‌کند که از روش‌های مختلفی برای مدل‌سازی ساختارهای سه‌بعدی RNA بر اساس همسانی، با مونتاژ قطعه، و با استفاده از انرژی جدید و رویکردهای مبتنی بر دانش استفاده می‌کنند.

With the dramatic increase in RNA 3D structure determination in recent years, we now know that RNA molecules are highly structured. Moreover, knowledge of RNA 3D structures has proven crucial for understanding in atomic detail how they carry out their biological functions. Because of the huge number of potentially important RNA molecules in biology, many more than can be studied experimentally, we need theoretical approaches for predicting 3D structures on the basis of sequences alone. This volume provides a comprehensive overview of current progress in the field by leading practitioners employing a variety of methods to model RNA 3D structures by homology, by fragment assembly, and by de novo energy and knowledge-based approaches.