Protein-protein Interactions and Networks: Identification, Computer Analysis, and Prediction

برهم‌کنش‌های بیولوژیکی موجودات زنده، و به‌ویژه برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین، به‌طور شگفت‌انگیزی متنوع هستند و به دلیل پیچیدگی‌شان، چالش‌های متعددی را برای تحقیقات بیومولکولی مدرن ایجاد می‌کنند. تجزیه و تحلیل الگوها و اصول حاکم بر این فعل و انفعالات باعث توسعه سریع روش‌های محاسباتی برای شناسایی شرکای تعامل پروتئینی و درک نقش اجزای مجزای شبکه‌های برهمکنش پروتئینی در عملکرد سلولی شده است.

این کتاب رویکردهای متفاوتی را ادغام می‌کند. بیوانفورماتیک، بیوشیمی، تجزیه و تحلیل محاسباتی و زیست‌شناسی سیستم‌ها برای ارائه یک دید جهانی جامع از داده‌های متنوع در مورد تعاملات پروتئین-پروتئین و شبکه‌های برهمکنش پروتئین به خواننده ارائه می‌کند. این توصیف تکنیک‌های تجربی و توضیحاتی در مورد الگوریتم‌های محاسباتی مختلف برای تجزیه و تحلیل شبکه پروتئین و پیش‌بینی تعاملات پروتئین و دامنه را گرد هم می‌آورد و هر فصل شامل شرحی از مسئله، مروری بر روش‌ها و الگوریتم‌ها، فهرستی از منابع و نتیجه‌گیری‌های فعلی است. .

ویژگی ها

• بررسی تکنیک های تجربی برای شناسایی برهمکنش های پروتئینی

• پایگاه داده های تعامل پروتئین و روش های یکپارچه سازی داده ها از منابع متنوع

• روش های محاسباتی را برای پیش بینی شرکای تعامل پروتئین و دامنه توصیف می کند

• ویژگی های رابط های تعامل را بررسی می کند و رویکردهای برجسته برای مدل سازی مجموعه کمپلکس های پروتئینی را برجسته می کند

>• خواص توپولوژیکی و دینامیکی شبکه های برهمکنش پروتئینی را بررسی می کند و ابزارهایی را برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای این شبکه ها ارائه می دهد

نوشته شده توسط متخصصان برجسته، برهم کنش ها و شبکه های پروتئین-پروتئین اطلاعات گسترده ای را ارائه می دهد. ، پوشش کامل و چند رشته ای این رشته. این برای محققان دانشگاهی و صنعت بیوانفورماتیک و همچنین یک متن کمکی عالی برای دانشجویان فارغ التحصیل در حال مطالعه این موضوع ارزشمند خواهد بود.

The biological interactions of living organisms, and protein-protein interactions in particular, are astonishingly diverse and present numerous challenges to modern biomolecular research because of their complexity. Analysis of patterns and principles governing these interactions has prompted a rapid development of computational methods to identify protein interaction partners and to understand the roles of individual components of protein interaction networks in cell functions.

This book integrates different approaches from bioinformatics, biochemistry, computational analysis and systems biology to offer the reader a comprehensive global view of the diverse data on protein-protein interactions and protein interaction networks. It brings together the descriptions of experimental techniques and expounds on different computational algorithms for protein network analysis and prediction of protein and domain interactions, with each chapter containing a description of the problem, a review of methods and algorithms, a list of resources and current conclusions.

Features

• Reviews experimental techniques for identification of protein interactions

• Discusses protein interaction databases and methods of integrating data from diverse sources

• Describes computational methods to predict protein and domain interaction partners

• Explores the properties of interaction interfaces and highlights approaches to model the assembly of protein complexes

• Examines the topological and dynamical properties of protein interaction networks and presents the tools for comparative analysis of these networks

Written by leading experts, Protein-protein Interactions and Networks provides a broad, thorough and multidisciplinary coverage of this field. It will be invaluable to researchers from academia and the bioinformatics industry, as well as an excellent auxiliary text for graduate students studying the topic.