Protein Dynamics, Function, and Design

این جلد مجموعه ای از مقالات از مجموعه مقالات دانشکده بین المللی زیست شناسی ساختاری و دوره سوم رزونانس مغناطیسی: دینامیک پروتئین، عملکرد و طراحی است. این موسسه مطالعات پیشرفته ناتو در اریس در مرکز فرهنگ علمی اتوره مایورانا در تاریخ 16-28 آوریل 1997 برگزار شد. هدف این موسسه گرد هم آوردن متخصصان با استفاده از روش های فیزیکی مختلف برای مشکلات دینامیک مولکولی ماکرو - به ویژه اشعه ایکس بود. پراش، NMR و سایر اشکال طیف‌سنجی، و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی. تاکید بر آن سیستم‌ها و انواع مشکلات - مانند مکانیسم‌های کنترل آلوستریک، انتقال سیگنال، تناسب القایی به لیگاندهای مختلف با پیامدهای آن برای طراحی دارو، و اثرات دینامیک بر تعیین ساختار - که در آن همبستگی یافته‌های به‌دست‌آمده توسط متفاوت است. روش‌ها می‌توانند بیشترین نور را بر مکانیسم‌های درگیر روشن کنند و جستجو برای رویکردهای جدید را تحریک کنند. مقالات جداگانه نشان دهنده وضعیت هنر در هر یک از حوزه های تحت پوشش هستند و راهنمایی برای ادبیات اصلی در این زمینه به سرعت در حال توسعه ارائه می دهند. v محتویات 1. تعیین ساختار مجتمع های ProteinlDN A توسط NMR Angela M. Gronenbom و G. Marius Clore 2. تناسب ساختارهای پروتئینی با داده های تجربی: درس هایی از قبل از تولد مادر شما . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 Jeffrey C. Hoch، Alan S. Stem و Peter J. Connolly 3. Multisuunit Allosteric Proteins. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 William N. Lipscomb 4. مطالعه ساختار و عملکرد پروتئین توسط تکامل هدایت شده: نمونه هایی با آنتی بادی های مهندسی شده. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 Andreas Pliickthun 5. اثرات فشار بالا بر ساختار پروتئین. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

This volume is a collection of articles from the proceedings of the International School of Structural Biology and Magnetic Resonance 3rd Course: Protein Dynamics, Function, and Design. This NATO Advance Study Institute was held in Erice at the Ettore Majorana Centre for Scientific Culture on April 16-28, 1997. The aim of the Institute was to bring together experts applyipg different physical methods to problems of macro­ molecular dynamics-notably x-ray diffraction, NMR and other forms of spectroscopy, and molecular dynamics simulations. Emphasis was placed on those systems and types of problems-such as mechanisms of allosteric control, signal transmission, induced fit to different ligands with its implications for drug design, and the effects of dynamics on structure determination-where a correlation of findings obtained by different methods could shed the most light on the mechanisms involved and stimulate the search for new approaches. The individual articles represent the state of the art in each of the areas cov­ ered and provide a guide to the original literature in this rapidly developing field. v CONTENTS 1. Determining Structures of ProteinlDN A Complexes by NMR Angela M. Gronenbom and G. Marius Clore 2. Fitting Protein Structures to Experimental Data: Lessons from before Your Mother Was Born . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 Jeffrey C. Hoch, Alan S. Stem, and Peter J. Connolly 3. Multisubunit Allosteric Proteins. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 William N. Lipscomb 4. Studying Protein Structure and Function by Directed Evolution: Examples with Engineered Antibodies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 Andreas Pliickthun 5. High Pressure Effects on Protein Structure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .