Prokaryotic Systems Biology

ویرایش: [1 ed.] 
نویسندگان: Nevan J. Krogan,  PhD,  Mohan Babu,  PhD (eds.)  
سری: Advances in Experimental Medicine and Biology 883 
ISBN (شابک) : 9783319236025, 9783319236032 
ناشر: Springer International Publishing 
سال نشر: 2015 
تعداد صفحات: IX, 319
[326] 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 8 Mb 

قیمت کتاب (تومان) : 51,000



این کتاب بر روی رویکردهای تجربی و محاسباتی ابتکاری برای ترسیم شبکه‌های تعامل در گونه‌های باکتریایی تمرکز دارد. بخش اول این جلد شامل 9 فصل است که بر روی رویکردهای بیوشیمیایی و ژنتیکی و ژنومیک تمرکز دارد، از جمله مخمر دو هیبرید، متاژنومیکس، خالص سازی میل ترکیبی در ترکیب با طیف سنجی جرمی، کروماتین-ایمونوفیل همراه با توالی یابی، صفحه نمایش های ژنتیکی مصنوعی در مقیاس بزرگ، و کمیت. استراتژی‌های طیف‌سنجی جرمی مبتنی بر نقشه‌برداری از شبکه‌های برهمکنش فیزیکی، عملکردی، بستر و تنظیمی باکتریایی که برای تفسیر شبکه‌های بیولوژیکی، استنتاج عملکرد ژن، کشف آنزیم و شناسایی اهداف دارویی جدید مورد نیاز است.

بخش دوم شامل پنج فصل است که شبکه شرکت کنندگان را برای تاخوردگی پروتئین و بلوغ آنزیم پیچیده پوشش می دهد. همچنین رویکردهای ساختاری مورد نیاز برای درک پروتئولیز درون غشایی باکتری و ساختار و عملکرد پروتئین‌های باکتریایی درگیر در پلی‌ساکاریدهای سطحی، غشای خارجی و مونتاژ پوششی را پوشش می‌دهد.

این جلد با تمرکز بر رویکردهای ژنومیک محاسباتی و مقایسه‌ای، به‌ویژه روش‌های مبتنی بر شبکه برای پیش‌بینی فعل و انفعالات فیزیکی یا عملکردی، و رویکردهای تحلیلی یکپارچه برای تولید اطلاعات قابل اعتمادتر در مورد عملکرد ژن باکتری به پایان می‌رسد. این کتاب دانش بنیادی در درک زیست شناسی سیستم های پروکاریوتی را با روشن کردن چگونگی عملکرد ژن های باکتریایی در چارچوب فرآیندهای سلولی جهانی ارائه می دهد. این کتاب جامعه میکروبیولوژی را قادر می‌سازد تا منابع قابل‌توجهی را برای پاسخگویی به بسیاری از سؤالات بی‌پاسخ در انتظار ایجاد کند و توسعه فناوری‌های جدیدی را که می‌تواند برای سایر گونه‌های باکتریایی فاقد داده‌های تجربی اعمال شود، تسهیل می‌کند. ​

This book focuses on innovative experimental and computational approaches for charting interaction networks in bacterial species. The first part of the volume consists of nine chapters, focusing on biochemical and genetics and genomics approaches including yeast two hybrid, metagenomics, affinity purification in combination with mass spectrometry, chromatin-immunoprecipitation coupled with sequencing, large-scale synthetic genetic screens, and quantitative-based mass spectrometry strategies for mapping the bacterial physical, functional, substrate, and regulatory interaction networks needed for interpreting biological networks, inferring gene function, enzyme discovery, and identifying new drug targets.

The second part comprises five chapters, covering the network of participants for protein folding and complex enzyme maturation. It also covers the structural approaches required to understand bacterial intramembrane proteolysis and the structure and function of bacterial proteins involved in surface polysaccharides, outer membrane, and envelope assembly.

This volume concludes with a focus on computational and comparative genomics approaches, especially network-based methods for predicting physical or functional interactions, and integrative analytical approaches for generating more reliable information on bacterial gene function. This book provides foundational knowledge in the understanding of prokaryotic systems biology by illuminating how bacterial genes f

unction within the framework of global cellular processes. The book will enable the microbiology community to create substantive resources for addressing many pending unanswered questions, and facilitate the development of new technologies that can be applied to other bacterial species lacking experimental data. ​ ​