Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique: 3e édition revue et augmentée

Sommaire
Avant-propos
Remerciements
Liste des rédacteurs
Partie 1 – Les bases
	Fiche 1 – Structure et expression d’un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine
	Fiche 2 – Définition des ARN non codants
	Fiche 3 – Paramètres de description d’un génome
	Fiche 4 – Enzymes de restriction
	Fiche 5 – Électrophorèse des acides nucléiques
	Fiche 6 – PCR (Polymerase Chain Reaction)
	Fiche 7 – Description d’un plasmide et d’un phagemide
	Fiche 8 – Description d’un YAC et autres grands vecteurs
	Fiche 9 – Clonage moléculaire
	Fiche 10 – Transformation génétique des bactéries et des levures
	Fiche 11 – Construction de banques d’acides nucléiques
	Fiche 12 – Extraction d’ADN
	Fiche 13 – Extraction d’ARN
	Fiche 14 – Marquage des acides nucléiques (ADN et ARN)
	Fiche 15 – Hybridation moléculaire
	Fiche 16 – Hybridation in situ d’ARN
	Fiche 17 – La cytogénétique moléculaire : FISH, GISH
	Fiche 18 – Électrophorèse en champ pulsé
Partie 2 – Caractérisation d’un gène
	Fiche 19 – Séquençage d’ADN par la technique Sanger
	Fiche 20 – RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction)
	Fiche 21 – PCR quantitative
	Fiche 22 – Amplification rapide d’extrémités d’ADNc : RACE
	Fiche 23 – Transcription in vitro
	Fiche 24 – Détermination du site d’initiation de la transcription
	Fiche 25 – Gel-retard
	Fiche 26 – Production de protéines recombinantes
	Fiche 27 – Système du double hybride
Partie 3 – Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse
	Fiche 28 – Grands principes de la transgenèse et de la mutagenèse
	Fiche 29 – Transfert de gènes
	Fiche 30 – Transgenèse chez la souris
	Fiche 31 – Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse chez les poissons
	Fiche 32 – Transgenèse chez Drosophila melanogaster
	Fiche 33 – Transgenèse de Caenorhabditis elegans
	Fiche 34 – Transgenèse stable des plantes par les agrobactéries
	Fiche 35 – Techniques de ARNi (ARN interférence)
	Fiche 36 – Transformation des plantes par agro-infiltration par Agrobacterium tumefaciens
	Fiche 37 – Analyse fonctionnelle de promoteurs
	Fiche 38 – Mutagenèse chimique du génome de drosophile
	Fiche 39 – Mutagenèse d’insertion
	Fiche 40 – Le TILLING (Targeting-Induced Local Lesions IN Genomes)
	Fiche 41 – Mutagenèse dirigée par le système CRISPR-Cas9
Partie 4 – Approches haut débit
	Fiche 42 – Séquencer un génome : généralités
	Fiche 43 – Séquençage d’ADN par la technique Illumina
	Fiche 44 – Séquençage d’ADN par la technique Single Molecule Real Time (SMRT) : PacBio
	Fiche 45 – Séquençage d’ADN grande longueur par la technique Nanopore
	Fiche 46 – Séquençage d’ADN par la technique Ion Torrent™
	Fiche 47 – Séquençage d’ADN grande longueur « synthétique » par la technique 10X Genomics®
	Fiche 48 – Cartographie optique de génomes (Optical Mapping)
	Fiche 49 – La capture d’exons
	Fiche 50 – Métagénomique et métatranscriptomique
	Fiche 51 – Barcoding et métabarcoding
	Fiche 52 – Analyse des données RNA-seq (RNA-sequencing)
	Fiche 53 – Interactions protéines-ARN à la résolution du nucléotide (iCLIP)
	Fiche 54 – Méthodes d’analyse du traductome
	Fiche 55 – Structure de la chromatine : introduction
	Fiche 56 – Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)
	Fiche 57 – Analyse tridimensionnelle de la chromatine par Chromosome Conformation Capture : les techniques 3C, 4C-seq et Hi-C
	Fiche 58 – Techniques d’identification de régions génomiques accessibles à des régulateurs : FAIRE et ATAC
	Fiche 59 – Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE
	Fiche 60 – La méthylation de l’ADN
Partie 5 – Étude du polymorphisme d’un génome
	Fiche 61 – Les principaux types de polymorphisme
	Fiche 62 – Microsatellites, répétitions de séquences simples : SSR
	Fiche 63 – Génotypage SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
	Fiche 64 – Utilisation des polymorphismes : QTL, GWAS et scans génomiques
	Fiche 65 – Détermination du polymorphisme par séquençage de nouvelle génération
	Fiche 66 – Approches populationnelles par séquençage en pools (Pool-Seq)
	Fiche 67 – Détection génomique de CNV par nouvelles technologies de séquençage
	Fiche 68 – Étude du polymorphisme par séquençage d’ADN associé à des sites de restriction (RAD-seq)
	Fiche 69 – Génotypage par séquençage : GBS (Genotyping By Sequencing)
Partie 6 – Bioanalyses
	Fiche 70 – Assemblage de génomes
	Fiche 71 – Annotation de génomes
	Fiche 72 – Galaxy
	Fiche 73 – La programmation