Practical Bioinformatics

این کتاب از این جهت منحصر به فرد است که شکاف بین بیوانفورماتیکان و زیست شناسان مولکولی، یعنی توسعه دهندگان و کاربران روش های محاسباتی برای تجزیه و تحلیل داده های بیولوژیکی را پر می کند و از این جهت که نمونه هایی از کاربردهای عملی ابزارهای بیوانفورماتیک را ارائه می دهد. \"تمرین روزانه\" یک محقق تجربی.

این کتاب با مروری بر روش‌های محاسباتی برای تجزیه و تحلیل توالی-ساختار-تابع پروتئین (مطالعات توالی، پیش‌بینی ساختار)، و سپس روش‌هایی که به صراحت از داده‌های تجربی که به طور معمول در آزمایشگاه به دست می‌آیند برای بهبود پیش‌بینی‌های عملکردی استفاده می‌کنند، شروع می‌شود. بخش دوم شامل مجموعه‌ای از مثال‌ها است که نشان می‌دهد چگونه کاربردهای خاص انواع مختلف روش‌های بیوانفورماتیک در ترکیب با مطالعات تجربی برای تأیید فرضیه‌ها منجر به اکتشافات علمی مهمی شده است.

بنابراین، این کتاب راهنمای استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک در زیست‌شناسی مولکولی است که عمدتاً به دانشمندان محقق، فوق‌دکتری‌ها و دانشجویان تحصیلات تکمیلی پیشرفته می‌پردازد.

The book is unique in that it bridges the gap between bioinformaticists and molecular biologists, i.e. the developers and the users of computational methods for biological data analysis and in that it presents examples of practical applications of the bioinformatics tools in the "daily practice" of an experimental research scientist.

The book starts with reviews on computational methods for protein sequence-structure-function analysis (sequence studies, structure prediction), followed by methods that explicitly utilize experimental data routinely obtained in the laboratory to improve the functional predictions. The second part comprises a series of examples on how particular applications of different types of bioinformatics methods in combination with experimental studies to validate the hypotheses have led to important scientific discoveries.

Therefore, the book is a guide to application of bioinformatics methods in molecular biology, addressed mainly to research scientists, postdocs, and advanced graduate students.