Population Genomics: Microorganisms

ژنومیک جمعیت یک زمینه به سرعت در حال ظهور است که این پتانسیل را دارد که درک ما را از اینکه چگونه نیروهای تکاملی تنوع ژنومی را در میان میکروب ها شکل می دهند تغییر دهد. قبلاً پیشرفت‌های قابل‌توجهی در درک جریان ژن و گسترش صفات تطبیقی ​​و پیوند اپیدمیولوژی با زیست‌شناسی تکاملی صورت گرفته است. چالش کنونی یافتن اصول تکاملی یکپارچه برای ارگانیسم هایی است که طیف وسیعی از زیست شناسی تولیدمثلی را نشان می دهند - از بسیار کلونال گرفته تا بی بند و باری - و اکثریت قریب به اتفاق از کشت برای آنها طفره رفته اند. این امر مستلزم رویکردهای بین رشته‌ای است که ابزارهای محاسباتی جدید، آزمایش مدل‌های ژنتیکی جمعیت موجود و جدید، و روش‌های خلاقانه جدید برای پیوند تنوع ژنتیکی به عوامل اکولوژیکی را در بر می‌گیرد. این کتاب پیشگام، پیشرفت‌ها و وعده‌های ژنومیک جمعیت در میکروارگانیسم‌ها را مورد بحث قرار می‌دهد، برخی از چالش‌های نظری و عملی کلیدی برای ژنومیک جمعیت میکروبی، از جمله تعریف و شناسایی جمعیت‌ها، اکولوژی معکوس مبتنی بر ژنومیک و ساخت ابزارهای مناسب برای درک میکروب‌ها در انواع محیط های پیچیده.

Population genomics is a rapidly emerging field that has the potential to transform our understanding of how evolutionary forces shape genomic diversity among microbes. There have already been considerable advances in understanding gene flow and spread of adaptive traits, and in linking epidemiology with evolutionary biology. The current challenge is to find unifying evolutionary principles for organisms that display a wide range of reproductive biology – from highly clonal to promiscuous – and for which the vast majority have eluded cultivation. This requires interdisciplinary approaches that incorporate novel computational tools, testing of existing and novel population genetic models, and creative new ways of linking genetic diversity to ecological factors. This pioneering book will discuss the advances made and promises of population genomics in microorganisms, outlining some of the key theoretical and practical challenges for microbial population genomics, including defining and identifying populations, genomics-based reverse ecology and building appropriate tools to understand microbes in a variety of complex environments.