Pharmacophores and Pharmacophore Searches, Volume 32

ویرایش:  
نویسندگان: Raimund Mannhold,  Hugo Kubinyi,  Gerd Folkers(eds.)  
سری: Methods and Principles in Medicinal Chemistry 
ISBN (شابک) : 9783527312504, 9783527609161 
ناشر: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA 
سال نشر: 2006 
تعداد صفحات: 387 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 5 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 51,000

این کتاب اولین کتابی است که به جنبه های عملی این روش جدید می پردازد. این یک نمای کلی از این زمینه ارائه می دهد و از ملاحظات کلی به سناریوهای زندگی واقعی در تحقیقات کشف دارو پیشرفت می کند.

با یک مرور کلی تاریخی مقدماتی، نویسندگان به بحث در مورد رویکردهای مبتنی بر لیگاند، از جمله فارماکوفورهای سه بعدی و QSAR 4 بعدی ادامه می‌دهند. و همچنین مفهوم و کاربرد شبه گیرنده ها. بخش بعدی در مورد رویکردهای مبتنی بر ساختار شامل فارمکوفورها از کمپلکس های لیگاند-پروتئین، FLIP و برهمکنش های اتصال پروتئین-لیگاند سه بعدی است. کل با بخش کاملی که به برنامه‌ها و مثال‌ها، از جمله مدل‌سازی ویژگی‌های ADME اختصاص دارد، گرد می‌شود.

این کتاب با ارزیابی انتقادی خود از استراتژی های مبتنی بر فارماکوفور کمک ارزشمندی برای رهبران پروژه و تصمیم گیرندگان در صنعت داروسازی و همچنین داروشناسان و داروسازان و شیمیدانان.

مطالب:
فصل 1 فارماکوفورها: دیدگاه تاریخی و دیدگاه یک شیمیدان دارویی (صفحات 1-13): Camille G. Wermuth
فصل 2 ابزارهای نرم افزار تولید مدل فارماکوفور (صفحات 15-47): کنستانتین Poptodorov، Tien Luu و Remy D. Hoffmann
تراز فصل 3؟ الگوهای فارماکوفور آزاد - یک همبستگی؟ رویکرد برداری (صفحه های 49-79): استفن رنر، اولی فچنر و گیسبرت اشنایدر
در فصل 4 نظریه و درختان ویژگی: برنامه های کاربردی از غربالگری مجازی در مقیاس بزرگ تا تجزیه و تحلیل داده ها (صفحه های 81-116): ماتیاس ریری، سالی هیندل، پاتریک ماآ؟، گونتر متز، کریستین رامی و مارک زیمرمن
فصل 5 مفهوم و کاربردهای شبه گیرنده ها (صفحه های 130-117) ): Klaus?Jurgen Schleifer
فصل 6 فارماکوفورها از مجتمع های ماکرومولکولی با LigandScout (صفحات 131-150): گرهارد ولبر و رابرت کوسارا
فصل 7 مدل های فارماکوفور مبتنی بر GRID: مفهوم و مثال های کاربردی 710- صفحه : فرانچسکو اورتوزو، استفانو آلکارو و تیری لانگر
بخش 8 "نقطه داغ" تجزیه و تحلیل سایت های اتصال پروتئین به عنوان پیش نیاز برای غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار و بهینه سازی سرنخ (صفحات 171-192): روث برنک و گرهارد کلبه
فصل 9 کاربرد اثر انگشت فارماکوفور بر اساس اثر انگشت؟ طراحی و داده کاوی (صفحات 193-206): پرابها کارناچی و آمیت کولکارنی
فصل 10 SIFt: تجزیه و تحلیل، سازماندهی و استخراج پایگاه داده برای مجتمع های بازدارنده پروتئین. کاربرد در مهارکننده‌های پروتئین کیناز (صفحه‌های 207-222): جوسویندر سینگ، ژان دنگ و کلودیو چواکی
فصل 11 کاربرد ساختار؟ روش‌های همترازی مبتنی بر آنالیزهای 3 بعدی QSAR (صفحه‌های 223-249 SipplChappl) کاربرد مدل های فارماکوفور در شیمی دارویی (صفحات 251-282): فابریزیو مانتی، مائوریتزیو بوتا و آندریا تافی
فصل 13 GPCR ضد؟ توماس کلابوند
فصل 14 فارماکوفورها برای پروتئین های مرتبط با ADME/Tox انسان (صفحه های 299-324): چنگ چانگ و شان اکینس
فصل 15 آیا مطمئن هستید که مدل خوبی دارید؟ (صفحات 325-364): نیکلاس تریبالو، هوگ، اولیویه برتراند و فرانسین آچر

This handbook is the first to address the practical aspects of this novel method. It provides a complete overview of the field and progresses from general considerations to real life scenarios in drug discovery research.

Starting with an introductory historical overview, the authors move on to discuss ligand-based approaches, including 3D pharmacophores and 4D QSAR, as well as the concept and application of pseudoreceptors. The next section on structure-based approaches includes pharmcophores from ligand-protein complexes, FLIP and 3D protein-ligand binding interactions. The whole is rounded off with a complete section devoted to applications and examples, including modeling of ADME properties.

With its critical evaluation of pharmacophore-based strategies, this book represents a valuable aid for project leaders and decision-makers in the pharmaceutical industry, as well as pharmacologists, and medicinal and chemists.

Content:
Chapter 1 Pharmacophores: Historical Perspective and Viewpoint from a Medicinal Chemist (pages 1–13): Camille G. Wermuth
Chapter 2 Pharmacophore Model Generation Software Tools (pages 15–47): Konstantin Poptodorov, Tien Luu and Remy D. Hoffmann
Chapter 3 Alignment?Free Pharmacophore Patterns – A Correlation?Vector Approach (pages 49–79): Steffen Renner, Uli Fechner and Gisbert Schneider
Chapter 4 Feature Trees: Theory and Applications from Large?scale Virtual Screening to Data Analysis (pages 81–116): Matthias Rarey, Sally Hindle, Patrick Maa?, Gunther Metz, Christian Rummey and Marc Zimmermann
Chapter 5 Concept and Applications of Pseudoreceptors (pages 117–130): Klaus?Jurgen Schleifer
Chapter 6 Pharmacophores from Macromolecular Complexes with LigandScout (pages 131–150): Gerhard Wolber and Robert Kosara
Chapter 7 GRID?based Pharmacophore Models: Concept and Application Examples (pages 151–170): Francesco Ortuso, Stefano Alcaro and Thierry Langer
Chapter 8 “Hot Spot” Analysis of Protein?binding Sites as a Prerequisite for Structure?based Virtual Screening and Lead Optimization (pages 171–192): Ruth Brenk and Gerhard Klebe
Chapter 9 Application of Pharmacophore Fingerprints to Structure?Based Design and Data Mining (pages 193–206): Prabha Karnachi and Amit Kulkarni
Chapter 10 SIFt: Analysis, Organization and Database Mining for Protein?Inhibitor Complexes. Application to Protein Kinase Inhibitors (pages 207–222): Juswinder Singh, Zhan Deng and Claudio Chuaqui
Chapter 11 Application of Structure?Based Alignment Methods for 3D QSAR Analyses (pages 223–249): Wolfgang Sippl
Chapter 12 Application of Pharmacophore Models in Medicinal Chemistry (pages 251–282): Fabrizio Manetti, Maurizio Botta and Andrea Tafi
Chapter 13 GPCR Anti?Target Modeling: Pharmacophore Models to Avoid GPCR?Mediated Side?Effects (pages 283–297): Thomas Klabunde
Chapter 14 Pharmacophores for Human ADME/Tox?Related Proteins (pages 299–324): Cheng Chang and Sean Ekins
Chapter 15 Are You Sure You Have a Good Model? (pages 325–364): Nicolas Triballeau, Hugues?Olivier Bertrand and Francine Acher

00.pdf......Page 2
01.pdf......Page 22
02.pdf......Page 34
03.pdf......Page 66
04.pdf......Page 97
05.pdf......Page 133
06.pdf......Page 147
07.pdf......Page 167
08.pdf......Page 187
09.pdf......Page 209
10.pdf......Page 223
11.pdf......Page 239
12.pdf......Page 266
13.pdf......Page 297
14.pdf......Page 312
15.pdf......Page 338
16.pdf......Page 378