Parasite Genomics Protocols

بیماری انگلی همچنان یک مسئله مهم بهداشتی در بیشتر مناطق جهان است و عامل اصلی مرگ و میر در کشورهای در حال توسعه است. در پروتکل‌های ژنومیک انگل، محققان پیشگام به طور مفصل تکنیک‌های پیشرفته‌ای را که برای تجزیه و تحلیل ژنوم‌ها و محصولات ژنی در طیف متنوعی از انگل‌های تک یاخته‌ای و متازوئه توسعه داده‌اند، شرح می‌دهند. این تکنیک‌های قابل تکرار را می‌توان در مطالعات ژنومی، ژنومی عملکردی و پس ژنومیک مورد استفاده قرار داد و شامل روش‌های ترانسفکشن و ناقل‌ها برای چندین انگل تک یاخته‌ای، آنالیز جهانی با استفاده از ریزآرایه‌ها، فرسایش ژن با استفاده از تداخل RNA، حذف ژن، جهش‌زایی، و دستکاری کروموزوم است. برخی از پروتکل ها به داده های توالی DNA نیاز دارند، در حالی که برخی دیگر مستقل از داده های توالی کل ژنوم توسعه یافته اند. فصل‌های اضافی توالی‌های ژنوم موجود را بررسی می‌کنند و به محققان تازه‌کار کمک می‌کنند تا بر مشکلات دسترسی به پایگاه‌های اطلاعاتی و استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک برای عملکرد بیولوژیکی غلبه کنند. پروتکل‌های ارائه‌شده از روش‌های موفق در قالب سری بیولوژی مولکولی پیروی می‌کنند، که هر کدام دستورالعمل‌های آزمایشگاهی گام به گام، مقدمه‌ای را ارائه می‌دهند که اصل این تکنیک، فهرست تجهیزات و معرف‌ها، و نکاتی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از مشکلات شناخته شده را نشان می‌دهد. .
پیشرفته ترین و بسیار کاربردی، پروتکل های ژنومیکس انگل، مجموعه گسترده ای از روش های متنوع برای روشن کردن محتوای ژنوم موجودات انگلی، استفاده از توالی ژنوم برای تجزیه و تحلیل ژنتیکی، و به محققین انگل شناسی ارائه می دهد. نسبت دادن عملکرد به توالی های ژنوم موجود.

Parasitic disease remains an important health issue in most regions of the world and constitutes a major cause of morbidity and mortality in developing countries. In Parasite Genomics Protocols, pioneering bench researchers describe in detail the cutting-edge techniques they have developed for analyzing the genomes and gene products in a diverse range of protozoan and metazoan parasites. These readily reproducible techniques can be used in genomic, functional genomic, and postgenomic studies and include transfection methods and vectors for several protozoan parasites, global analysis using microarrays, gene ablation using RNA interference, gene knockout, mutagenesis, and chromosome manipulation. Some of the protocols require DNA sequence data, whereas others were developed independently of whole-genome sequence data. Additional chapters survey the available genome sequences, helping novice researchers overcome the difficulties of accessing the databases and applying bioinformatics analysis to biological function. The protocols presented follow the successful Methods in Molecular Biology™ series format, each one offering step-by-step laboratory instructions, an introduction outlining the principle behind the technique, lists of equipment and reagents, and tips on troubleshooting and the avoidance of known pitfalls.
State-of-the-art and highly practical, Parasite Genomics Protocols offers bench investigators in parasitology a wide-ranging collection of diverse methods for elucidating the content of the genomes of parasitic organisms, utilizing the genome sequence for genetic analysis, and ascribing function to the available genome sequences.