Network Biology: Methods and Applications

در حالی که مجموعه داده‌های بسیار بزرگی که توالی‌های ژنی، رونوشت‌های mRNA، فراوانی پروتئین و غلظت متابولیت‌ها را توصیف می‌کنند به طور فزاینده‌ای رایج هستند، اینها فقط «فهرست‌های قطعات» ابتدایی را نشان می‌دهند که معمولاً برای باز کردن بینش‌های مکانیکی به تنهایی کافی نیستند. خوشبختانه، همانطور که زیست‌شناسی شبکه: روش‌ها و کاربردها بررسی می‌کند، مفاهیمی که از مطالعه موجودیت‌های بیولوژیکی مانند شبکه‌ها (مانند فعل و انفعالات عملکردی پیوند دهنده ژن‌ها، پروتئین‌ها، متابولیت‌ها و غیره) به دست می‌آیند، نشان می‌دهد که نظم به جای هرج و مرج حاکم است. ، با اصولی مانند سازمان دهی مدولار و سلسله مراتبی، رفتارهای واکنشی مبتنی بر اطلاعات علت و معلولی، استحکام سیستم ها، تکامل مشترک، و خود سازمان دهی راهنما. این جلد توضیحات دقیق و عملی از رویکردهای تجربی و محاسباتی رایج در زیست‌شناسی شبکه را ارائه می‌کند که توسط متخصصان مجرب در این زمینه نوشته شده است. در قالب بسیار موفق Methods in Molecular Biology™ نوشته شده است، فصل های مربوطه حاوی مقدمه هایی برای موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد لازم، پروتکل های گام به گام و به راحتی قابل تکرار، و نکاتی در مورد عیب یابی و اجتناب از تله‌های شناخته شده.

جامع و در دسترس، زیست‌شناسی شبکه: روش‌ها و کاربردها مجموعه‌ای از رویه‌ها را ارائه می‌کند که برای مجموعه‌ای وسیع ارزش زیادی دارد. از خوانندگان، از دانشجویان فارغ التحصیل گرفته تا متخصصان باتجربه که به دنبال بهبود مجموعه مهارت های خود هستند.

While extremely large datasets describing gene sequences, mRNA transcripts, protein abundance, and metabolite concentrations are increasingly commonplace, these represent only starting ‘parts lists’ that are usually insufficient to unlock mechanistic insights on their own right. Fortunately, as Network Biology: Methods and Applications examines, concepts emerging from the study of biological entities such as networks (e.g. functional interactions linking genes, proteins, metabolites, etc.) suggest that order rather than chaos prevails, with such principles as modular and hierarchical organization, reactive information-driven causal-response behaviours, systems robustness, co-evolution, and self-organization guiding the way. This volume presents detailed, practical descriptions of the experimental and computational approaches currently prevalent in network biology as written by practiced experts in the field. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, relevant chapters contain introductions to their respective topics, lists of the necessary materials, step-by-step, readily reproducible protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Comprehensive and accessible, Network Biology: Methods and Applications provides an ensemble of procedures that will be of great value to a broad assortment of readers, ranging from graduate students to seasoned professionals looking to polish their skill sets.