Microbial Biochemistry

فیزیولوژی میکروبی، بیوشیمی و ژنتیک امکان فرمول بندی مفاهیمی را فراهم کردند که معلوم شد در مطالعه موجودات برتر مهم هستند. در بخش اول، اصول رشد باکتری ارائه شده است، و همچنین توصیف لایه های مختلف که سیتوپلاسم باکتری را در بر می گیرد، و نقش آنها در به دست آوردن مواد مغذی از محیط های بیرونی از طریق مکانیسم های نفوذپذیری مختلف به تفصیل شرح داده شده است. یک فصل به آلوستری اختصاص داده شده است و برای درک بسیاری از مکانیسم های تنظیمی که در سراسر کتاب توضیح داده شده است ضروری است. بخش دیگری مکانیسم هایی را که توسط آن سلول ها انرژی لازم برای رشد، گلیکولیز، مسیر پنتوز فسفات، چرخه های تری کربوکسیلیک و آناپلروتیک را به دست می آورند، تجزیه و تحلیل می کند. دو فصل به کلاس‌هایی از میکروارگانیسم‌ها اختصاص دارد که به ندرت در کتاب‌های درسی به آنها پرداخته می‌شود، یعنی Archaea، عمدتاً باکتری‌های متانوژن، و متیلوتروف‌ها. هشت فصل به تشریح اصول آیین نامه در سطح رونویسی با آگاهی لازم از ماشین آلات رونویسی و ترجمه می پردازد. پانزده فصل بعدی به بیوسنتز بلوک های سازنده سلول، اسیدهای آمینه، نوکلئوتیدها و دئوکسی نوکلئوتیدهای پورین و پیریمیدین، ویتامین ها و کوآنزیم های محلول در آب، مشتقات ایزوپرن و تتراپیرول و ویتامین B12 می پردازد. دو فصل آخر به مطالعه برهمکنش های پروتئین-DNA و تکامل مسیرهای بیوسنتزی اختصاص یافته است. پیشرفت‌های قابل‌توجهی که در سی سال گذشته در این زمینه با معرفی شبیه‌سازی و توالی‌یابی ژن و با توسعه نمایی روش‌های فیزیکی مانند کریستالوگرافی اشعه ایکس یا تشدید مغناطیسی هسته‌ای انجام شده است، به ارائه متابولیسم تحت یک زاویه جذاب چند رشته‌ای کمک کرده است. p>

Microbial physiology, biochemistry and genetics allowed the formulation of concepts that turned out to be important in the study of higher organisms. In the first section, the principles of bacterial growth are given, as well as the description of the different layers that enclose the bacterial cytoplasm, and their role in obtaining nutrients from the outside media through different permeability mechanism described in detail. A chapter is devoted to allostery and is indispensable for the comprehension of many regulatory mechanisms described throughout the book. Another section analyses the mechanisms by which cells obtain the energy necessary for their growth, glycolysis, the pentose phosphate pathway, the tricarboxylic and the anaplerotic cycles. Two chapters are devoted to classes of microorganisms rarely dealt with in textbooks, namely the Archaea, mainly the methanogenic bacteria, and the methylotrophs. Eight chapters describe the principles of the regulations at the transcriptional level, with the necessary knowledge of the machineries of transcription and translation. The next fifteen chapters deal with the biosynthesis of the cell building blocks, amino acids, purine and pyrimidine nucleotides and deoxynucleotides, water-soluble vitamins and coenzymes, isoprene and tetrapyrrole derivatives and vitamin B12. The two last chapters are devoted to the study of protein-DNA interactions and to the evolution of biosynthetic pathways. The considerable advances made in the last thirty years in the field by the introduction of gene cloning and sequencing and by the exponential development of physical methods such as X-ray crystallography or nuclear magnetic resonance have helped presenting metabolism under a multidisciplinary attractive angle.