Microarray Analysis of the Physical Genome: Methods and Protocols

در سال‌های اولیه فناوری ریزآرایه، تلاش‌ها عمدتاً بر روی پروفیل‌سازی ژن‌های بیان‌شده انجام می‌شد، در حالی که اخیراً پلتفرم ریزآرایه با کاربردهای متنوعی برای بررسی ژنوم فیزیکی سازگار شده است. در تجزیه و تحلیل ریزآرایه ژنوم فیزیکی: روش‌ها و پروتکل‌ها، متخصصان در این زمینه برنامه‌های ریزآرایه DNA را برای تشخیص و شناسایی تغییرات تعداد کپی مرتبط با DNA ژنومی، از دست دادن هتروزیگوسیتی (LOH)، متیلاسیون سیتوزین پوشش می‌دهند. ، مکان های اتصال پروتئین، عناصر تنظیمی، و زمان تکثیر، با تاکید بر یوکاریوت بالاتر (حیوان) و ژنوم سرطان. این فصل‌ها که با فرمت بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی™ نوشته شده‌اند، شامل معرفی مختصری از موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های گام به گام و یادداشت‌های صرفه‌جویی در زمان است. در مورد عیب‌یابی و اجتناب از دام‌های شناخته شده.

معتبر و با استفاده آسان، تحلیل ریزآرایه ژنوم فیزیکی: روش‌ها و پروتکل‌ها ارزش زیادی دارد. به زیست شناس مولکولی یا زیست شناس محاسباتی که علاقه مند به درک اصول این تجزیه و تحلیل ها یا برنامه ریزی آزمایش های آینده با استفاده از ریزآرایه ها برای توصیف ژنوم فیزیکی است.

In the early years of microarray technology, efforts were directed mainly at profiling expressed genes, while recently the microarray platform has been adapted into diverse applications directed toward the investigation of the physical genome. In Microarray Analysis of the Physical Genome: Methods and Protocols, experts in the field cover DNA microarray applications for the detection and characterization of genomic DNA-associated copy number alteration, loss of heterozygosity (LOH), cytosine methylation, protein binding sites, regulatory elements, and replication timing, with an emphasis on higher eukaryote (animal) and cancer genomes. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters include a brief introduction to their respective subjects, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step protocols, and time-saving notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and easy-to-use, Microarray Analysis of the Physical Genome: Methods and Protocols is of great value to the molecular biologist or computational biologist interested in understanding the principles of these analyses or in planning future experiments using microarrays to characterize the physical genome.