Metal Response in Cupriavidus metallidurans: Volume II: Insights into the Structure-Function Relationship of Proteins

این کتاب دومین جلد از مجموعه دو جلدی است که 40 سال یافته های تحقیقاتی کلیدی را به طور مستقیم با Cupriavidus/Ralstonia (بتاپروتئوباکتری) مقاوم در برابر فلزات، خلاصه می کند. ). در این جلد دوم، داده‌های ساختاری و کاتالیزوری از انتقال‌دهنده‌های اولیه و ثانویه باکتریایی (P-ATPases، سیستم‌های سه‌جانبه شیمی‌اسموتیک کاتیون/پروتون، تسهیل‌کننده‌های انتشار کاتیون، خانواده تسهیل‌کننده اصلی و برخی دسته‌های فرعی) برای موارد مربوطه تشریح و به تفصیل ارائه شده است. > C. پروتئین های metallidurans. ساختارهای سه بعدی موجود به تفصیل مورد بررسی قرار گرفته اند، از جمله RND و پروتئین های همجوشی غشایی (از سیستم های سه جانبه کاتیون شیمیوزموتیک / جریان پروتون)، پروتئین های تنظیم کننده سیگما و ضد سیگما سیستم جریان cnr (مقاومت در برابر کبالت و نیکل) و پروتئین های مختلف پری پلاسمیک عمدتاً در پاسخ به مس و جیوه نقش دارند. علاوه بر این، جلد اول زمینه تاریخی و جغرافیایی این باکتری‌ها را که عمدتاً در محیط‌های صنعتی و آلوده مرتبط با روی و سایر متالورژی‌های غیرآهنی یافت می‌شوند، ترسیم می‌کند تا تعاملات بین باکتری‌ها و فعالیت‌های انسانی و پیامدهای احتمالی تکاملی را نشان دهد. ژنوم باکتری ها به ویژه تا آنجا که به ارتباط ژن های مقاومت فلزات با عناصر ژنتیکی متحرک مربوط می شود. شرح مفصلی از پاسخ و عوامل تعیین‌کننده ژنتیکی نوع سویه Cupriavidus metallidurans CH34 به انواع فلزات ارائه می‌کند. با مقاومت سطح بالایی در برابر کادمیوم، کرومات، کبالت، مس، جیوه، نیکل، سرب و روی که توسط ژن های شناخته شده برای سم زدایی توسط مگا پلاسمیدهای pMOL28 و pMOL30 انجام می شود. این توصیف با زمینه ژنومی ژن های پاسخ فلز در C تکمیل می شود. metallidurans CH34 با تمرکز بر موبیلوم خود از جمله عناصر توالی درج، ترانسپوزون ها، عناصر یکپارچه و مزدوج و جزایر ژنومی.

This book is the second volume of a two-volume set summarizing 40 years of key research findings directly related to metal-resistant Cupriavidus/Ralstonia (Betaproteobacteria). In this second volume, the structural and catalytic data from bacterial primary and secondary transporters (P-ATPases, tripartite chemiosmotic cation/proton efflux systems, cation diffusion facilitators, Major Facilitator Superfamily and some minor categories) are outlined and detailed for the corresponding C. metallidurans proteins. The available three-dimensional structures are reviewed in detail, including RND and membrane fusion proteins (from tripartite chemiosmotic cation/proton efflux systems), sigma and anti-sigma regulatory proteins of the cnr efflux system (resistance to cobalt and nickel) and various periplasmic proteins mainly involved in the response to copper and mercury. In addition, the first volume sketches the historical and geographical context of these bacteria, which are mostly found in industrial and polluted environments linked to zinc and other non-ferrous metallurgy, to illustrate the interactions between bacteria and human activities and the possible evolutionary consequences on bacterial genomes especially as far as the association of metal resistance genes with mobile genetic elements is concerned. It provides a detailed description of the response and underlying genetic determinants of type strain Cupriavidus metallidurans CH34 to a variety of metals. With high level resistance to cadmium, chromate, cobalt, copper, mercury, nickel, lead and zinc mediated by well-known genes for detoxification carried by its megaplasmids pMOL28 and pMOL30. This description is complemented with the genomic context of the metal response genes in C. metallidurans CH34 with a focus on its mobilome including insertion sequence elements, transposons, integrative and conjugative elements and genomic islands.