Metabolomics: Methods and Protocols

متابولومیک: Methods and Protocols به بررسی آخرین فناوری در تجزیه و تحلیل متابولومیک می پردازد. محققان پیشرو در این زمینه پروتکل هایی را برای کاربرد روش های تحلیلی مکمل، مانند کروماتوگرافی گازی- طیف سنجی جرمی (GC-MS) ارائه می کنند. متابولومیک: روش‌ها و پروتکل‌ها شامل پروتکل‌های آینده‌نگر است که زمینه‌ای اساسی برای تلاش‌های آینده در روشن‌سازی ساختار مجهولات شناسایی‌شده در مطالعات متابولومیک فراهم می‌کند.

بخش اول این جلد بر تکنیک‌های GC-MS تمرکز دارد. به طور خاص، توجه به پروفایل متابولیت در پلاسمای خون، ساخت و استفاده از کتابخانه های طیف جرمی و شاخص زمان ماند، و پروفایل متابولومیک مواد فرار طبیعی است. در بخش دوم، تاکید بر یکپارچه سازی داده ها و تکنیک های داده کاوی تغییر می کند و پروتکل های خاص در مورد بهبود تشخیص الگو و انتخاب نشانگر زیستی برای رویکردهای سطح سیستم و تجسم و تجزیه و تحلیل داده های مولکولی و متابولومیک بحث می کنند. بخش های III، IV، و V جفت شدن الکتروفورز مویرگی و طیف سنجی جرمی، کروماتوگرافی مایع فاز معکوس کلاسیک- طیف سنجی جرمی، و تشخیص الکتروشیمیایی متابولیت ها را با استفاده از جداسازی HPLC همراه با آشکارسازهای آرایه الکترود کولومتری بررسی می کنند. در بخش ششم، پروتکل‌هایی برای تعیین نرخ‌های شار متابولیک ارائه شده و یک چارچوب نظری برای تحلیل شبکه مسیر متابولیک ارائه شده است. این جلد با بررسی پروتکل های پیشرفته NMR به پایان می رسد.

Metabolomics: Methods and Protocols examines the state-of-the-art in metabolomic analysis. Leading researchers in the field present protocols for the application of complementary analytical methods, such as gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). Metabolomics: Methods and Protocols contains forward-looking protocols, which provide the essential groundwork for future efforts in elucidating the structure of the unknowns detected in metabolomic studies.

Part I of this volume focuses on GC-MS techniques; specifically, attention is given to metabolite profiling in blood plasma, construction and application of mass spectral and retention time index libraries, and metabolomic profiling of natural volatiles. In Part II, emphasis shifts to data integration and data mining techniques, and specific protocols discuss improving pattern recognition and biomarker selection for systems level approaches, and visualization and analysis of molecular and metabolomic data. Parts III, IV, and V examine the coupling of capillary electrophoresis and mass spectrometry, classical reversed phase liquid chromatography-mass spectrometry, and electrochemical detection of metabolites using HPLC separations coupled with coulometric electrode array detectors. In Part VI, protocols for the determination of metabolic flux rates are presented and a theoretical framework for metabolic pathway network analysis is provided. The volume concludes with an examination of cutting-edge NMR protocols.