Metabolic Flux Analysis: Methods and Protocols

تجزیه و تحلیل شار متابولیک: روش ها و پروتکل ها زمینه تجزیه و تحلیل شار متابولیک را به روی کسانی باز می کند که می خواهند یک پروژه تجزیه و تحلیل شار جدید را شروع کنند اما پیچیدگی این رویکرد غرق شده اند. تجزیه و تحلیل شار متابولیک از محدودیت فعلی برای پیش‌بینی شار متابولیک از موجودی اندازه‌گیری شده سلول پدید آمد. به بخش‌های موضوعی مناسب، موضوعات این جلد ضروری شامل ویژگی‌های اساسی شبکه‌های زیربنایی، کاربرد داده‌های کمی متابولیت و اصول ترمودینامیکی برای محدود کردن فضای محلول برای تجزیه و تحلیل تعادل شار (FBA)، جعبه ابزار آزمایشی برای انجام انواع مختلف می‌شود. آزمایش‌های تحلیل شار، پردازش داده‌های ¹³C و سه فصل که برخی از یافته‌های کلیدی اخیر را خلاصه می‌کند. این فصل‌ها که با فرمت موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های گام به گام و به‌راحتی قابل تکرار و یادداشت‌هایی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از ناشناخته هستند. مشکلات.

معتبر و به راحتی قابل دسترسی، تجزیه و تحلیل شار متابولیک: روش‌ها و پروتکل‌ها پروتکل‌هایی را ارائه می‌دهد که طیف وسیعی از ارگانیسم‌های مرتبط را که در حال حاضر در این زمینه استفاده می‌شوند را پوشش می‌دهد. ارائه یک پایه محکم برای هر کسی که علاقه مند به تجزیه و تحلیل شار متابولیک است.

Metabolic Flux Analysis: Methods and Protocols opens up the field of metabolic flux analysis to those who want to start a new flux analysis project but are overwhelmed by the complexity of the approach. Metabolic flux analysis emerged from the current limitation for the prediction of metabolic fluxes from a measured inventory of the cell. Divided into convenient thematic parts, topics in this essential volume include the fundamental characteristics of the underlying networks, the application of quantitative metabolite data and thermodynamic principles to constrain the solution space for flux balance analysis (FBA), the experimental toolbox to conduct different types of flux analysis experiments, the processing of data from ¹³C experiments and three chapters that summarize some recent key findings. Written in the successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible protocols and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and easily accessible, Metabolic Flux Analysis: Methods and Protocols presents protocols that cover a range of relevant organisms currently used in the field, providing a solid basis to anybody interested in the field of metabolic flux analysis.