مشخصات کتاب

Integer Linear Programming in Computational and Systems Biology: An Entry-Level Text and Course

ویرایش:  
نویسندگان: Dan Gusfield  
سری:  
ISBN (شابک) : 1108421768, 9781108421768 
ناشر: Cambridge University Press 
سال نشر: 2019 
تعداد صفحات: 432 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 11 مگابایت 

در صورت تبدیل فایل کتاب Integer Linear Programming in Computational and Systems Biology: An Entry-Level Text and Course به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.

توجه داشته باشید کتاب برنامه نویسی خطی عدد صحیح در زیست شناسی محاسباتی و سیستمی: متن و دوره ابتدایی نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.

توضیحاتی در مورد کتاب برنامه نویسی خطی عدد صحیح در زیست شناسی محاسباتی و سیستمی: متن و دوره ابتدایی

برنامه‌ریزی خطی عدد صحیح (ILP) یک تکنیک مدل‌سازی و بهینه‌سازی همه‌کاره است که به طور فزاینده‌ای در روش‌های غیر سنتی در زیست‌شناسی مورد استفاده قرار می‌گیرد، با پتانسیل تبدیل محاسبات بیولوژیکی. با این حال، تعداد کمی از زیست شناسان در مورد آن می دانند. این متن چگونه و چرا باید ILP را از دریچه زیست شناسی محاسباتی و سیستمی معرفی می کند. از نمونه های عمیقی از ژنومیک، فیلوژنتیک، RNA، تاخوردگی پروتئین، تجزیه و تحلیل شبکه، سرطان، بوم شناسی، تکامل مشترک، توالی یابی DNA، تجزیه و تحلیل توالی، شجره نامه و استنتاج خواهر و برادر، هاپلوتایپینگ و موارد دیگر برای ایجاد قدرت ILP استفاده می کند. هدف این کتاب آموزش منطق مدل‌سازی و حل مسائل با ILP و آموزش «جریان کاری» عملی مربوط به استفاده از ILP در زیست‌شناسی است. این کتاب که برای طیف وسیعی از مخاطبان نوشته شده است، بدون پیش نیازهای بیولوژیکی یا محاسباتی، برای دوره های مقدماتی و پیشرفته با هدف دانشجویان زیست شناسی و محاسبات و به عنوان منبعی برای متخصصان مناسب است. تمرین های متعدد و نرم افزارهای همراه (در پایتون و پرل) مفاهیم را نشان می دهد.

توضیحاتی درمورد کتاب به خارجی

Integer linear programming (ILP) is a versatile modeling and optimization technique that is increasingly used in non-traditional ways in biology, with the potential to transform biological computation. However, few biologists know about it. This how-to and why-do text introduces ILP through the lens of computational and systems biology. It uses in-depth examples from genomics, phylogenetics, RNA, protein folding, network analysis, cancer, ecology, co-evolution, DNA sequencing, sequence analysis, pedigree and sibling inference, haplotyping, and more, to establish the power of ILP. This book aims to teach the logic of modeling and solving problems with ILP, and to teach the practical 'work flow' involved in using ILP in biology. Written for a wide audience, with no biological or computational prerequisites, this book is appropriate for entry-level and advanced courses aimed at biological and computational students, and as a source for specialists. Numerous exercises and accompanying software (in Python and Perl) demonstrate the concepts.

فهرست مطالب

Cover
Front Matter
INTEGER LINEAR PROGRAMMING IN COMPUTATIONAL AND SYSTEMS BIOLOGY:
An Entry-Level Text and Course
Copyright
Dedication
Contents
Introduction to the Book and Course
Part I
1 A Flyover Introduction to Integer Linear
Programming
2 Biological Networks, Graphs, and
High-Density Subgraphs
3 Maximum Character Compatibility
in Phylogenetics
4 Near Cliques, Dense Subgraphs, and Motifs
in Biological Networks
5 Convergent and Maximum Parsimony
Problems in Phylogenetics
6 The RNA-Folding Problem
7 Protein Problems Solved By Integer
Programming
8 Tanglegrams and Coevolution
9 Traveling Salesman Problems in Genomics
10 Integer Programming in Molecular
Sequence Analysis
11 Metabolic Networks and Metabolic
Engineering
12
Part II
13 Communities, Cuts, and High-Density
Subgraphs
14 Character Compatibility with Corrupted Data
and Generalized Phylogenetic Models
15 More Tanglegrams, More Trees, More ILPs
16 Return to Steiner Trees and Maximum
Parsimony
17 Exploiting and Leveraging Protein
Networks
18 More String and Sequence Problems
Solved by ILP
19 Maximum Likelihood Pedigree
Reconstruction
20 Two DNA Haplotyping Problems
21 More Extended Exercises
22
What’s Next?
23 Epilogue: Some Very Opinionated
Comments for Advanced Readers
24 Bibliography
Index

نظرات کاربران

کتاب های تصادفی

دانلود کتاب Fallout: Conspiracy, Cover-Up, and the Deceitful Case for the Atom Bomb

دانلود کتاب A History of the Central Limit Theorem: From Classical to Modern Probability Theory

دانلود کتاب Mechanical Ventilation from Pathophysiology to Clinical Evidence

دانلود کتاب Low back pain

دانلود کتاب Keen's Latin American Civilization, Volume 2