In silico Modeling and Experimental Validation for Improving Methanogenesis from CO2 via M. maripaludis

این پایان نامه توانایی M. maripaludis را در جذب و تبدیل CO2 به متان در حضور نیتروژن آزاد بررسی می کند و یک بررسی تلفیقی از فرآیندهای متابولیک و کاربردهای M. maripaludis ارائه می دهد. علاوه بر این، اولین مدل متابولیکی در مقیاس ژنومی (iMM518) M. maripaludis را توسعه، تأیید و تجزیه و تحلیل می‌کند. خوانندگان برای اولین بار تاثیر تثبیت نیتروژن بر تولید متان را کشف خواهند کرد. به این ترتیب، این پایان‌نامه برای محققانی که روی M. maripaludis، سوخت‌های زیستی و انرژی زیستی، مدل‌سازی زیست‌شناسی سیستم‌ها و اعتبارسنجی تجربی آن، تخمین پارامترهای انرژی نگهداری، میکروب‌های تثبیت‌کننده نیتروژن، و پاکسازی زیستی کار می‌کنند، مورد توجه قرار خواهد گرفت.

This thesis explores the ability of M. maripaludis to capture and convert CO2 to methane in the presence of free nitrogen, and offers a consolidated review of the metabolic processes and applications of M. maripaludis. Further, it develops, validates and analyzes the first genome-scale metabolic model (iMM518) of M. maripaludis. Readers will discover, for the first time, the impact of nitrogen fixation on methane production. As such, the thesis will be of interest to researchers working on M. maripaludis, biofuels and bioenergy, systems biology modeling and its experimental validation, estimation of maintenance energy parameters, nitrogen fixing microbes, and bioremediation.