Human Molecular Biology Laboratory Manual

Human Molecular Biology Laboratory......Page 5
Contents......Page 7
Preface......Page 13
Background......Page 17
Deproteinization using organic solvents......Page 19
Removal of RNA......Page 22
Concentrating the DNA......Page 23
Determination of the Purity and Quantity of DNA......Page 25
Technical tips......Page 27
Protocol......Page 29
Technical tips......Page 32
Expected results......Page 34
References......Page 35
Background......Page 36
Background......Page 41
Technical tips......Page 42
Protocol......Page 43
References......Page 44
Background......Page 45
Protocol......Page 50
References......Page 52
Background......Page 53
Protocol......Page 54
References......Page 57
Background......Page 59
Technical tips......Page 66
Protocol......Page 67
References......Page 70
Protocol......Page 72
Protocol......Page 74
Data analysis......Page 75
Introduction......Page 78
Background......Page 79
Protocol......Page 82
Data analysis......Page 85
Expected results......Page 88
General reading......Page 91
Origin of humans......Page 92
PCR......Page 96
Protocol......Page 101
Protocol......Page 105
Data analysis......Page 108
Expected results......Page 109
References......Page 110
Introduction......Page 111
Background......Page 112
DNA sequencing methods......Page 113
Sequencing strategies......Page 114
References......Page 115
Background......Page 116
Safety precautions......Page 118
Technical tips......Page 119
Protocol......Page 120
Safety precautions......Page 122
Technical tips......Page 123
Protocol......Page 124
References......Page 126
Background......Page 127
Technical tips......Page 134
Protocol......Page 135
Introduction......Page 137
Background......Page 138
Technical tips......Page 140
Protocol......Page 142
Expected results......Page 144
References......Page 145
Background......Page 146
Technical tips......Page 147
Protocol......Page 148
Introduction......Page 150
Technical tips......Page 151
Protocol......Page 152
References......Page 153
Background......Page 155
Databases and sequence formats......Page 156
Sequence alignments......Page 159
BLAST......Page 163
BLAST versus FASTA......Page 166
Single-sequence analysis......Page 167
Dot matrix analysis......Page 168
Technical tips......Page 170
Protocol......Page 171
References......Page 173
Search of "nr" database......Page 174
Search for the Chromosome Position of the Query Sequence......Page 175
Converting file formats......Page 177
Dot matrix analysis......Page 178
Introduction......Page 180
Background......Page 181
Background......Page 186
Protocol......Page 187
Introduction......Page 190
Technical tips......Page 191
Protocol......Page 192
Technical tips......Page 193
Protocol......Page 194
Safety precautions......Page 196
Protocol......Page 197
Technical tips......Page 201
Protocol......Page 202
Protocol......Page 203
Background......Page 206
Technical tips......Page 207
Protocol......Page 208
References......Page 210
Background......Page 212
Background......Page 214
Safety precautions......Page 216
Technical tips......Page 217
Protocol......Page 218
References......Page 219
Background......Page 220
Protocol......Page 221
References......Page 223
Background......Page 225
Technical tips......Page 228
Protocol......Page 229
Equipment and supplies......Page 231
Equipment and supplies......Page 233
Solutions to prepare......Page 234
Solutions to prepare......Page 235
Equipment and supplies......Page 236
Solutions to prepare......Page 237
Equipment and supplies......Page 238
Solutions to prepare......Page 232
Index......Page 239