دسترسی نامحدود
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
برای ارتباط با ما می توانید از طریق شماره موبایل زیر از طریق تماس و پیامک با ما در ارتباط باشید
در صورت عدم پاسخ گویی از طریق پیامک با پشتیبان در ارتباط باشید
برای کاربرانی که ثبت نام کرده اند
درصورت عدم همخوانی توضیحات با کتاب
از ساعت 7 صبح تا 10 شب
ویرایش: 1
نویسندگان: Trygve Tollefsbol
سری:
ISBN (شابک) : 9780123757098, 0123757096
ناشر: Academic Press
سال نشر: 2010
تعداد صفحات: 631
زبان: English
فرمت فایل : DJVU (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود)
حجم فایل: 10 مگابایت
در صورت تبدیل فایل کتاب Handbook of Epigenetics: The New Molecular and Medical Genetics به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.
توجه داشته باشید کتاب کتاب راهنمای اپی ژنتیک: ژنتیک مولکولی و پزشکی جدید نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.
بسیاری اپی ژنتیک را "ژنتیک جدید" میدانند، زیرا متوجه میشوند که بسیاری از پدیدههای بیولوژیکی نه از طریق جهشهای ژنی، بلکه از طریق فرآیندهای اپی ژنتیکی برگشتپذیر و قابل وراثت کنترل میشوند که مسیرهای جدیدی را برای کشف باز کردهاند. فرآیندهای بیولوژیکی تحت تأثیر اپی ژنتیک از بازسازی بافت/ارگان، غیرفعال سازی کروموزوم X و تمایز سلول های بنیادی گرفته تا چاپ ژنومی و پیری را شامل می شود. اثرات اپی ژنتیک گسترده است و ارگانیسم های پایین تر و همچنین انسان ها را در بر می گیرد. انحرافات اپی ژنتیک بر بسیاری از بیماریها تأثیر میگذارد که شامل سرطان، اختلالات ایمنی، اختلالات عصبی و متابولیک و بیماریهای چاپی میشود. مداخله بالینی در حال حاضر برای برخی از این اختلالات وجود دارد و بسیاری از درمانهای جدید اپی ژنتیک در افق هستند.
این مجموعه جامع از بررسیهای نوشته شده توسط رهبران در زمینه اپی ژنتیک، ارائه میکند. نگاهی گسترده به این موضوع مهم و در حال تحول. از مکانیسمهای مولکولی و فنآوری اپی ژنتیک گرفته تا اکتشافات در بیماریهای انسانی و اپی ژنتیک بالینی، ماهیت و کاربردهای علم برای کسانی که علاقهمندیهایی از پایههای بنیادی اپی ژنتیک تا مداخلات درمانی برای اختلالات مبتنی بر اپی ژنتیک دارند، ارائه خواهد شد.
* مشارکتهای محققان بینالمللی پیشرو درگیر در تحقیقات مولکولی و کاربردهای بالینی و درمانی
* روشها و موضوعات بیولوژیکی را با اکتشافات اساسی و بالینی ادغام میکند
* شامل پوشش موضوعات جدید در اپی ژنتیک مانند پریون ها، تنظیم حافظه بلند مدت توسط اپی ژنتیک، جنبه های متابولیکی اپی ژنتیک، و اپی ژنتیک اختلالات عصبی
Epigenetics is considered by many to be the "new genetics" because the realization that many biological phenomena are controlled not through gene mutations, but rather through reversible and heritable epigenetic processes that have opened up new paths for discovery. The biological processes impacted by epigenetics range from tissue/organ regeneration, X-chromosome inactivation, and stem cell differentiation to genomic imprinting and aging. The effects of epigenetics are vast and encompass lower organisms as well as humans. Aberrations of epigenetics influence many diseases involving but not limited to cancer, immune disorders, neurological and metabolic disorders, and imprinting diseases. Clinical intervention is already in place for some of these disorders and many novel epigenetic therapies are on the horizon.
This comprehensive collection of reviews written by leaders in the field of epigenetics provides a broad view of this important and evolving topic. From molecular mechanisms and epigenetic technology to discoveries in human disease and clinical epigenetics the nature and applications of the science will be presented for those with interests ranging from the fundamental basis of epigenetics to therapeutic interventions for epigenetic-based disorders.
* Contributions by leading international investigators involved in molecular research and clinical and therapeutic applications
* Integrates methods and biological topics with basic and clinical discoveries
* Includes coverage of new topics in epigenetics such as prions, regulation of long-term memory by epigenetics, metabolic aspects of epigenetics, and epigenetics of neuronal disorders
Cover Page\r......Page 1
Front matter......Page 2
Copyright......Page 4
Contributors......Page 5
Preface......Page 10
The basics of DNA methylation and histone modifications......Page 11
Epigenetic technology......Page 12
Metabolism and epigenetics......Page 13
Epigenetic epidemiology......Page 14
Conclusion......Page 15
References......Page 16
Introduction......Page 17
Dnmt3L is a regulatory factor for de novo DNA methylation......Page 18
Dimeric Dnmt3a suggests de novo DNA methylation depends on CpG spacing......Page 19
A structural fragment of Dnmt1......Page 21
Base flipping mechanism......Page 22
UHRF1-histone interactions......Page 23
Replication-coupled crosstalk between DNA methylation and histone modifications......Page 24
DNA demethylation via hydroxylation?......Page 25
Conclusion and perspectives......Page 26
References......Page 27
Histone modifications......Page 36
Ubiquitination......Page 38
ADP-ribosylation......Page 39
Role of histone phosphorylation in transcription regulation......Page 40
Role of histone phosphorylation in DNA repair......Page 41
Role of histone methylation in transcription regulation......Page 42
First Classification......Page 44
p300/CBP......Page 45
HAT complexes......Page 46
Role of histone acetylation in transcription regulation......Page 47
Role of histone acetylation in DNA repair......Page 48
References......Page 49
Introduction......Page 57
Short ncRNAs and epigenetics......Page 58
Long ncRNAs and epigenetics......Page 62
Conclusions......Page 65
Acknowledgements......Page 66
References......Page 67
Prions and Prion-like Phenomena in Epigenetic Inheritance......Page 70
Prions of S. cerevisiae and P. anserina......Page 71
Cytotaxis of Cilia and Other Complex Structures......Page 74
Mixed heredity: A prion that propagates by covalent auto-activation......Page 75
The Lactose Operon and its Positive Feedback Loop......Page 76
Crippled Growth, a Self-Sustained and Mitotically Inheritable Signaling Pathway in the Filamentous Fungus Podospora anserina......Page 77
Conclusion......Page 78
References......Page 79
Introduction......Page 85
CPE and TPE, lessons from model organisms......Page 86
Setting the frontiers of chromatin domains......Page 89
Chromosomal position effect in human pathologies......Page 93
Split-Hand/Foot Malformation Type 1: Position Effect Involving Several Genes?......Page 94
PLP1 and Pelizaeus–Merzbacher Disease: When Position Effect Rescues the Phenotype......Page 96
Alpha-Thalassemia......Page 97
Disorders of unstable repeat expansions......Page 98
Copy number variants: a new challenge in the deciphering of CPE......Page 99
Telomeric position effect in human pathologies......Page 100
Position effects and aging......Page 101
Conclusions......Page 102
References......Page 103
PRC1......Page 116
PRC2......Page 117
Recruiters......Page 118
The H3K27 methyl mark......Page 119
Recruitment by H3K27me3 ......Page 120
Epigenetic maintenance or cellular memory......Page 121
Maintenance of the non-repressed state......Page 122
The bivalent state......Page 123
Differentiation......Page 124
References......Page 125
Principles of DNA methylation analysis......Page 131
Bisulfite Sequencing......Page 133
Real-time MSP and MethyLight......Page 135
PCR Conditions for Unbiased Amplification......Page 136
PCR Conditions for Specific Amplification......Page 137
References......Page 139
Introduction......Page 141
Restriction landmark genomic scanning (RLGS)......Page 142
Techniques based on methylation-sensitive restriction endonucleases and PCR......Page 143
Methylation-specific digital karyotyping (MSDK)......Page 144
Other sodium bisulfite based approaches......Page 146
MBD-affinity column (MAC)......Page 148
Methylated-CpG island recovery assay (MIRA)......Page 149
Future directions and challenges......Page 150
References......Page 151
Introduction......Page 158
Intermediate or Transient Heterochromatin......Page 159
Tri-methyl lysine 9 of histone H3 (H3K9me3) and cell cycle......Page 160
H3K9me3 and cancer......Page 162
References......Page 164
Introduction......Page 167
Features of the epigenome......Page 168
Epigenome during differentiation......Page 171
Cancer epigenome......Page 173
Physical organization of the genome......Page 174
References......Page 176
ChIP-on-chip Technique......Page 181
ChIP-on-chip Data Processing......Page 182
Calculation Algorithms for Epigenetic Data Extraction from ChIP-Seq Experiments......Page 184
Epigenetics of CpG islands......Page 186
References......Page 187
Post-transcriptional gene silencing......Page 190
Quelling in N. crassa......Page 191
Meiotic silencing by unpaired DNA in N. crassa......Page 192
PTGS in other filamentous fungi......Page 193
PTGS in protists......Page 194
RNA mediated development in ciliates......Page 195
Methylation induced premeioticaly in A. immersus ......Page 196
Repeat induced point mutation in N. crassa......Page 198
Chromatin-based regulation of secondary metabolite gene cluster expression......Page 199
Conclusion......Page 200
References......Page 201
Introduction......Page 208
The study of position effect variegation has led to the discovery of factors and structural proteins that constitute heterochromatin......Page 209
Heterochromatin formation involves a sequence of histone modifications......Page 212
RNA interference plays a critical role in heterochromatin formation......Page 213
Telomeric Heterochromatin......Page 214
The Unique Heterochromatin Attributes of Chromosome IV......Page 215
Modulation of Heterochromatin During Euchromatic Gene Transcription......Page 216
PcG Proteins form Regulatory Complexes......Page 217
The Binding of PcG Complexes Induces and Depends on Post-Translational Chromatin Modifications......Page 218
trxG regulatory proteins......Page 219
Interactions between PcG and trxG factors......Page 220
The MSL complex is responsible for dosage compensation......Page 221
Interaction with heterochromatin proteins......Page 222
H3.3 Replaces H3 in the Domain of Actively Transcribed Genes......Page 223
H2Av Participates in Gene Silencing......Page 224
Centromere-specific histone variants......Page 225
Insulators establish the boundaries of regulatory domains......Page 226
Insulators affect nuclear organization......Page 227
DNA methylation......Page 228
References......Page 229
Early exposures and adult disease: the mammalian model advantage......Page 241
Metastable epialleles......Page 242
The Axin Fused (AxinFu) Mouse Model......Page 243
The Mouse CDK5 Activator Binding Protein (CabpIAP) Metastable Epiallele......Page 244
Epigenetic Inheritance in Avy Mice......Page 246
The Avy and AxinFu Models and Methyl Donors......Page 248
The Avy Model and Isoflavones......Page 250
The Avy Model and Paternal Effect Genes......Page 251
Genomic imprinting......Page 252
The future of mouse models in epigenetic research......Page 254
References......Page 255
The plant epigenome......Page 258
The small RNAs in epigenetic regulation of silencing in plants......Page 259
Chromatin-based epigenetic mechanisms operating in transcriptional gene silencing (TGS)......Page 260
Rna-Dependent Rna Polymerases (Rdrs)......Page 261
RNA-directed DNA methylation (RdDM) of plant genomes......Page 262
Pol IV and Pol V......Page 263
Subunits and Partners of Pol IV and Pol V......Page 264
How are AGO and siRNAs Targeted to Specific Chromatin Sites?......Page 265
Transposable elements (TEs) and heterochromatin......Page 267
Epigenetic variations and plant evolution......Page 268
Paramutation......Page 269
Imprinting......Page 271
Genome Reprogramming During Flowering......Page 272
Polycomb group (PcG) and trithorax group (TrxG) complexes in plants......Page 273
Antagonistic PcG/TrxG Functions in Arabidopsis......Page 274
Chromatin remodeling......Page 275
Conclusions and perspectives......Page 276
References......Page 278
One-carbon metabolism and methyl donor production......Page 287
Regulation of SAM levels by precursor and cofactor bioavailability......Page 289
Homocysteine Metabolism......Page 291
Alcohol Antagonism of One-carbon Metabolism......Page 292
Mechanisms of DNA demethylation......Page 293
Cancer and One-carbon Deficiency......Page 294
References......Page 295
Introduction......Page 302
Histone acetylation......Page 305
Histone Deacetylases (HDACs)......Page 306
Histone Acetyltransferases (HATs)......Page 307
Histone methylation......Page 308
Conclusions......Page 313
References......Page 314
Stem cells......Page 321
DNA Methylation......Page 323
Acetylation......Page 325
Methylation......Page 326
Micro RNA......Page 328
Reprogramming for pluripotency......Page 329
References......Page 330
Epigenetic profile of muscle stem cells......Page 339
Genome reprogramming of muscle stem cells......Page 340
Transcriptional network that regulates adult skeletal myogenesis......Page 341
Chromatin-associated kinases: regulators of the epigenome in myogenic cells in response to regeneration cues......Page 342
Epigenetic regulation of skeletal myogenesis by miRNA......Page 343
Role of Individual miRNAs in Muscle Development ......Page 344
miR-27......Page 345
miRNAs and Muscular Dystrophies......Page 346
References......Page 347
Introduction......Page 352
Xist RNA as a key player in XCI......Page 353
Xist gene regulation......Page 355
Regulation of Xist by Pluripotency Related Factors......Page 356
Chromatin modifications characterizing the XCI......Page 357
Role of spatial organization within the nucleus in x inactivation......Page 358
References......Page 359
Introduction......Page 364
Imprint establishment and maintenance in mammals......Page 366
Replication Timing......Page 369
Histone modifications......Page 370
Chromatin Insulators......Page 371
Noncoding RNAs......Page 373
On the origin of genomic imprinting......Page 375
Organismic Models of Genomic Imprinting......Page 376
Mechanistic Models of Genomic Imprinting......Page 378
Reductionist Models of Genomic Imprinting......Page 380
Conclusion......Page 381
References......Page 382
Epigenetic modification of histones underlying memory......Page 391
Covalent modification of DNA underlying memory......Page 394
Summary......Page 397
References......Page 398
Introduction......Page 401
Epigenetic Consequences of Prenatal Maternal Exposures......Page 402
Postnatal Maternal Regulation of the Epigenome......Page 403
Paternal Influence on Offspring Development......Page 404
Germline-mediated Transgenerational Inheritance......Page 405
Experience-dependent Transgenerational Inheritance......Page 407
Epigenetics, Plasticity and Evolving Concepts of Inheritance......Page 408
References......Page 409
Introduction......Page 414
Dynamics of DNA Methylation During Aging......Page 415
Global Methylation Changes in Aging Cells......Page 416
Gene-Specific Methylation Changes......Page 417
One-Carbon Metabolism in Aging......Page 418
Histone Modifications During Aging......Page 420
Sirtuins......Page 421
Epigenetic Control of Telomeres in Aging......Page 422
Other Epigenetic Mediators that Influence Longevity......Page 423
Model of age-dependent epigenetic drift......Page 424
Lessons From Twin Research......Page 426
Conclusions and future directions......Page 427
References......Page 428
Practical Indications of Epigenetics......Page 435
Environment and Evolution......Page 436
Evolutionary concepts from the 19th century to today......Page 437
Evidence – Epidemiological, Transgenerational, and Molecular......Page 438
Inorganic Matter to Cellular Life......Page 439
Further Key Transitions in Evolution With Likely Changes in Epigenetic Processes......Page 440
Relationship in evolution between genetic changes and epigenetic......Page 441
Bacteria and mitochondria......Page 442
Mammals – transitions to placenta, live birth, and genomic imprinting......Page 443
Imprinting differences in the mammalian embryo and placenta......Page 444
Stability of the original chromatin strand in differentiating cells......Page 445
Origins of health and disease – primacy of epigenetics......Page 446
Physiological stages of imprinting processes......Page 447
Continuing evolutionary impacts on health and disease......Page 448
Mental disorders and heritability, and psychotic drug effects......Page 449
In conclusion......Page 450
References......Page 451
Introduction......Page 456
Maternal protein restriction model......Page 457
Nutrients involved in ONE-carbon metabolism......Page 458
Other nutrients......Page 459
Effects of diet on epigenetic states and disease in adulthood......Page 460
Folate, diseases, and epigenetics......Page 462
References......Page 463
Nickel......Page 468
Arsenic......Page 469
Chromium......Page 470
Cadmium......Page 471
Selenium......Page 472
Peroxisome proliferators......Page 473
Radiation......Page 474
Tobacco smoke......Page 475
Endocrine disruptors......Page 476
Polycyclic aromatic hydrocarbons......Page 477
Conclusion......Page 478
References......Page 481
Introduction......Page 486
Infections and epigenetic modifications......Page 488
Virus......Page 489
Chronic Inflammation......Page 491
Virus and epigenetics: role in cancer development......Page 492
Bacterial influence on the cell cycle......Page 493
Helicobacter pylori Infection and the Stomach......Page 494
Epigenetics and Microbial Infection in Colorectal Cancer......Page 496
Potential therapeutic implications......Page 498
References......Page 499
Introduction......Page 507
The Ad12-Hamster Cell System......Page 508
De Novo Methylation – An Ancient Cellular Defense System?......Page 509
Integration of Foreign DNA Can Alter Cellular Methylation Patterns at Sites Remote From the Insertion Locus......Page 510
Methylation Boundary at Equivalent Site in the Mouse Genome......Page 511
Isolated Unmethylated CpG Dinucleotides in De Novo Methylated DNA......Page 512
Proteins Binding at the Boundary Sequence in the Human FMR1 5'-Upstream Region......Page 513
The Epigenetic Profile of the Ad12 Integrates......Page 514
Viral Gene Activities in the Integrates......Page 516
Outlook......Page 517
References......Page 518
Epigenetic biomarkers......Page 524
Patients with drug-resistant cancer......Page 525
Nutritional aspects of population pharmacoepigenomics......Page 526
Effects of age and gender on pharmacoepigenomics......Page 527
References......Page 528
Mechanisms of epigenetic control in cancer......Page 531
Histone Modifications......Page 532
Epigenetics and oncogenesis......Page 533
Epigenetic Changes in “Normal” Stromal Cells of the Tumor Microenvironment......Page 534
Epigenetic Changes and Malignant Transformation......Page 535
Epigenetic Changes Associated with the Metastatic Phenotype......Page 536
Epigenetic diagnosis and prognosis......Page 537
Epigenetic therapy of cancer......Page 538
Conclusion......Page 539
References......Page 540
Innate Immunity......Page 545
Autoimmunity......Page 546
B Cells......Page 547
Epigenetics of SLE......Page 548
Epigenetics of RHEuMATOId ARTHRITIS (RA)......Page 550
Type 1 Diabetes Mellitus......Page 552
Systemic Sclerosis......Page 553
Use of epigenetic modifiers for potential diagnosis and therapy in autoimmune diseases......Page 554
References......Page 555
Introduction......Page 562
Epigenetic dysregulation in neurodevelopmental disorders – The example of Rett syndrome......Page 563
Epigenetic dysregulation in neurodegenerative disorders – The example of Alzheimer’s disease......Page 565
Epigenetic dysregulation in psychiatric disorders – The example of depression......Page 567
Epigenetic dysregulation in psychotic disorders – The example of schizophrenia......Page 569
Epigenetic dysregulation by environmental stress – The example of early life stress......Page 570
Conclusions and outlook......Page 571
References......Page 572
Etiological Factors in Metabolic Syndrome, Type 1 and Type 2 Diabetes Susceptibility......Page 578
Epigenetic Mechanism Underlying Genetic Susceptibility to Metabolic Diseases......Page 579
Influence of the in utero environment on epigenetic modification......Page 581
Epigenetic dysregulation of energy metabolism......Page 583
Epigenetic dysregulation of inflammation......Page 584
Potential therapeutic interventions involving epigenetic regulation......Page 585
References......Page 586
Introduction......Page 591
Uniparental Disomy (UPD)......Page 593
Imprinting Defects......Page 595
General aspects of IDs......Page 597
Beckwith–Wiedemann syndrome/BWS – chromosome 11......Page 598
Maternal and paternal UPD(14) syndromes/UPD(14)mat/pat – chromosome 14......Page 599
Genetic testing for IDs......Page 600
References......Page 601
Introduction......Page 605
Vorinostat (Suberoylanilide Hydroxamic Acid, SAHA)......Page 607
Valproic Acid......Page 608
Entinostat (MS-275, SND-275)......Page 610
HDAC Inhibitors as a Single-Agent Therapy of Solid Tumors......Page 611
Combination Therapy with HDAC Inhibitors in the Treatment of Solid Tumors......Page 612
Phenylbutyrate......Page 614
Clinical Evaluation of Valproic Acid and Phenylbutyrate......Page 615
Current Clinical Trials Underway Evaluating HDAC Inhibitors for the Treatment of Non-Cancer Diseases......Page 616
Conclusion and the future direction of the clinical applications of HDAC inhibitors......Page 617
References......Page 618
Index......Page 624