Gene Essentiality: Methods and Protocols

این جلد با پوشش دو نوع رویکرد اصلی که به طور گسترده برای تعیین ژن‌های ضروری مورد استفاده قرار می‌گیرد، آغاز می‌شود: حذف تک ژنی و جهش‌زایی ترانسپوزون، هم در پروکاریوت‌ها و هم در کاندیدا آلبیکنس. با توجه به پیشرفت قابل توجه در پیش‌بینی‌های محاسباتی ژن‌های ضروری میکروبی، نیمه دوم کتاب چهار نوع رویکرد اصلی را بررسی می‌کند: ژنومیکس مقایسه‌ای، یادگیری ماشینی نظارت شده، روش‌های مبتنی بر محدودیت، و اصلاحات داده‌های جهش‌زایی ترانسپوزون، همچنین پایگاه‌های داده و سرورهایی که اغلب در مطالعه ضروری بودن ژن استفاده می شوند. که در قالب بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، فصل‌ها شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و به راحتی قابل تکرار و نکاتی در مورد عیب‌یابی و اجتناب از دام‌های شناخته شده.

معتبر و به‌روز، ضرورت ژن: روش‌ها و پروتکل‌ها به محققانی که می‌خواهند دانش ما را در این زمینه حیاتی مطالعه بیشتر کنند، کمک می‌کند.

This volume opens by covering two main types of approaches widely used to determine essential genes: single-gene knockouts and transposon mutagenesis, in both prokaryotes and Candida albicans. Given the significant advancement in the computational predictions of microbial essential genes, the second half of the book examines four main types of approaches: comparative genomics, supervised machine learning, constraint-based methods, and corrections of transposon mutagenesis data, as well as databases and servers that are often used in studying gene essentiality. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include an introduction to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and up-to-date, Gene Essentiality: Methods and Protocols will aid researchers who wish to further our knowledge in this vital field of study.