Fundamentals of Bioinformatics and Computational Biology: Methods and Exercises in MATLAB

این کتاب پوشش جامعی از تمام موضوعات اصلی بیوانفورماتیک ارائه می دهد و شامل مثال های عملی است که با استفاده از جعبه ابزار بیوانفورماتیک MATLAB™ تکمیل شده اند. این در درجه اول به عنوان یک کتاب درسی برای دانشجویان مهندسی و علوم کامپیوتر در نظر گرفته شده است که در دوره های پیشرفته کارشناسی و کارشناسی ارشد در بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی شرکت می کنند. این کتاب مفاهیم بیوانفورماتیک را از ابتدا توسعه می‌دهد و با فصل مقدماتی زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیک شروع می‌شود. این فصل دانشجویان علوم فیزیکی را قادر می‌سازد تا اهداف نهایی بکارگیری اصول فناوری اطلاعات را برای چالش‌های مدیریت داده‌های بیولوژیکی، تجزیه و تحلیل توالی و زیست‌شناسی سیستم‌ها به‌طور کامل درک و درک کنند. بخش اول کتاب همچنین شامل بررسی پایگاه های داده بیولوژیکی موجود است، ابزارهایی که در تحقیقات بیوتکنولوژی امروزی ضروری شده اند. بخش دوم کتاب روش‌شناسی برای بازیابی اطلاعات بیولوژیکی، از جمله الگوریتم‌های اساسی برای مقایسه توالی، امتیازدهی و تعیین فاصله تکاملی را پوشش می‌دهد. تمرکز اصلی بخش سوم بر روی مدل‌سازی توالی‌ها و الگوهای بیولوژیکی به‌عنوان زنجیره‌های مارکوف است. این اصول کلیدی را برای تجزیه و تحلیل و جستجوی دنباله هایی از نقوش و نشانگرهای زیستی مهم ارائه می دهد. بخش آخر کتاب که به زیست شناسی سیستم ها اختصاص دارد، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک و محاسبات درخت تکاملی و همچنین تجزیه و تحلیل بیان ژن با ریزآرایه ها را پوشش می دهد. به طور خلاصه، این کتاب راهنمای مرجع ایده‌آل در زمینه بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی را ارائه می‌دهد.

This book offers comprehensive coverage of all the core topics of bioinformatics, and includes practical examples completed using the MATLAB bioinformatics toolbox™. It is primarily intended as a textbook for engineering and computer science students attending advanced undergraduate and graduate courses in bioinformatics and computational biology. The book develops bioinformatics concepts from the ground up, starting with an introductory chapter on molecular biology and genetics. This chapter will enable physical science students to fully understand and appreciate the ultimate goals of applying the principles of information technology to challenges in biological data management, sequence analysis, and systems biology. The first part of the book also includes a survey of existing biological databases, tools that have become essential in today’s biotechnology research. The second part of the book covers methodologies for retrieving biological information, including fundamental algorithms for sequence comparison, scoring, and determining evolutionary distance. The main focus of the third part is on modeling biological sequences and patterns as Markov chains. It presents key principles for analyzing and searching for sequences of significant motifs and biomarkers. The last part of the book, dedicated to systems biology, covers phylogenetic analysis and evolutionary tree computations, as well as gene expression analysis with microarrays. In brief, the book offers the ideal hands-on reference guide to the field of bioinformatics and computational biology.