Fragment-based Drug Discovery: Lessons and Outlook

از زمان پیدایش آن به عنوان یک تکنیک طاقچه در بیش از 15 سال پیش، رویکردهای مبتنی بر قطعه به ابزار اصلی برای کشف دارو و لیگاند تبدیل شده‌اند، که اغلب در مواردی که روش‌های دیگر شکست خورده‌اند، نتایجی را به همراه دارد. این کتاب که توسط پیشگامان این حوزه نوشته شده است، مروری جامع از روش‌ها و کاربردهای فعلی کشف مبتنی بر قطعه، و همچنین چشم‌اندازی درباره اینکه این حوزه به کجا می‌رود، ارائه می‌کند.

بخش اول ملاحظات اساسی را مورد بحث قرار می‌دهد. زمان استفاده از روش‌های مبتنی بر قطعه، نحوه انتخاب اهداف، و نحوه ساخت کتابخانه‌ها در فضای قطعه شیمیایی. بخش دوم روش های ایجاد شده، جدید و نوظهور را برای غربالگری قطعه، از جمله رویکردهای تجربی و همچنین محاسباتی توصیف می کند. موارد خاص غربالگری مبتنی بر قطعه، e. g. برای سیستم های هدف پیچیده و برای مهارکننده های کووالانسی نیز مورد بحث قرار گرفته است. بخش سوم چندین مطالعه موردی از پروژه‌های کشف داروی اخیر و در حال انجام را برای انواع مختلف کلاس‌های هدف، از کینازها و فسفاتازها گرفته تا تعامل پروتئین-پروتئین و اهداف اپی ژنتیکی را ارائه می‌کند.

From its origins as a niche technique more than 15 years ago, fragment-based approaches have become a major tool for drug and ligand discovery, often yielding results where other methods have failed. Written by the pioneers in the field, this book provides a comprehensive overview of current methods and applications of fragment-based discovery, as well as an outlook on where the field is headed.

The first part discusses basic considerations of when to use fragment-based methods, how to select targets, and how to build libraries in the chemical fragment space. The second part describes established, novel and emerging methods for fragment screening, including empirical as well as computational approaches. Special cases of fragment-based screening, e. g. for complex target systems and for covalent inhibitors are also discussed. The third part presents several case studies from recent and on-going drug discovery projects for a variety of target classes, from kinases and phosphatases to targeting protein-protein interaction and epigenetic targets.