Forward-Time Population Genetics Simulations: Methods, Implementation, and Applications

ویرایش:  
نویسندگان: Bo Peng,  Marek Kimmel,  Christopher I. Amos(auth.)  
سری:  
ISBN (شابک) : 9780470503485, 9781118180358 
ناشر: Wiley-Blackwell 
سال نشر: 2012 
تعداد صفحات: 247 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 3 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 39,000

تنها کتاب موجود در زمینه شبیه‌سازی ژنتیک جمعیت آینده؟ قابل استفاده برای مطالعات زیست‌پزشکی و تکاملی

افزایش سریع قدرت رایانه‌های شخصی منجر به استفاده از برنامه‌های جدی شبیه‌سازی زمان آینده در مطالعات ژنتیکی شده است. شبیه‌سازی‌های ژنتیکی جمعیت به جلو هم روش‌های جدید و هم متداول را ارائه می‌کند و simuPOP را معرفی می‌کند، یک برنامه جدید قدرتمند و انعطاف‌پذیر که می‌تواند برای شبیه‌سازی فرآیندهای تکاملی دلخواه با ویژگی‌های منحصربه‌فرد مانند انواع کروموزوم‌های سفارشی، غیر تصادفی دلخواه استفاده شود. طرح‌های جفت‌گیری، زیرجمعیت‌های مجازی، زمینه‌های اطلاعاتی و عملگرهای پایتون.

این کتاب با مروری بر مفاهیم و مدل‌های مهم آغاز می‌شود، سپس نشان می‌دهد که چگونه simuPOP می‌تواند تعدادی از مدل‌های ژنتیکی استاندارد جمعیت را شبیه‌سازی کند؟ هدف نشان دادن تأثیر عوامل ژنتیکی مانند جهش، انتخاب و نوترکیب بر روی مدل‌های استاندارد رایت-فیشر است. بقیه کتاب به کاربردهای شبیه‌سازی‌های پیش‌رو در موضوعات مختلف تحقیقاتی اختصاص دارد.

شبیه‌سازی‌های ژنتیک جمعیت به جلو شامل:

• مروری کلی از روش‌های شبیه‌سازی زمان آینده موجود، مزایا و کاستی‌های آن‌ها

• نمای کلی و ارزیابی نرم‌افزار موجود در حال حاضر

• یک آموزش simuPOP

• کاربردها در ژنتیک جمعیت

• کاربردها در اپیدمیولوژی ژنتیک، ژنتیک آماری و نقشه برداری از بیماری های پیچیده انسانی

تنها کتاب در نوع خود در این زمینه امروزه، شبیه سازی ژنتیک جمعیت به جلو برای محققان و دانشجویان جذاب خواهد بود. جمعیت و ژنتیک آماری.

محتوا:
فصل 1 مفاهیم و مدل های اساسی (صفحه های 1-29):
فصل 2 شبیه سازی مدل های ژنتیک جمعیت (صفحات 31-54):
فصل 3 قطعیت تعصب در ژنتیک جمعیت (صفحات 55-72):
فصل 4 مشاهده ویژگی های جمعیت های در حال تکامل (صفحه های 73-103):
فصل 5 شبیه سازی جمعیت ها با بیماری های پیچیده انسانی (صفحه های 105-145):
فصل 6 جفت گیری غیر تصادفی و کاربردهای آن (صفحات 147-183):

The only book available in the area of forward-time population genetics simulations?applicable to both biomedical and evolutionary studies

The rapid increase of the power of personal computers has led to the use of serious forward-time simulation programs in genetic studies. Forward-Time Population Genetics Simulations presents both new and commonly used methods, and introduces simuPOP, a powerful and flexible new program that can be used to simulate arbitrary evolutionary processes with unique features like customized chromosome types, arbitrary nonrandom mating schemes, virtual subpopulations, information fields, and Python operators.

The book begins with an overview of important concepts and models, then goes on to show how simuPOP can simulate a number of standard population genetics models?with the goal of demonstrating the impact of genetic factors such as mutation, selection, and recombination on standard Wright-Fisher models. The rest of the book is devoted to applications of forward-time simulations in various research topics.

Forward-Time Population Genetics Simulations includes:

• An overview of currently available forward-time simulation methods, their advantages, and shortcomings

• An overview and evaluation of currently available software

• A simuPOP tutorial

• Applications in population genetics

• Applications in genetic epidemiology, statistical genetics, and mapping complex human diseases

The only book of its kind in the field today, Forward-Time Population Genetics Simulations will appeal to researchers and students of population and statistical genetics.

Content:
Chapter 1 Basic Concepts and Models (pages 1–29):
Chapter 2 Simulation of Population Genetics Models (pages 31–54):
Chapter 3 Ascertainment Bias in Population Genetics (pages 55–72):
Chapter 4 Observing Properties of Evolving Populations (pages 73–103):
Chapter 5 Simulating Populations with Complex Human Diseases (pages 105–145):
Chapter 6 Nonrandom Mating and its Applications (pages 147–183):