Evolutionary Bioinformatics

این کتاب اکنون در نسخه سوم خود و تکمیل شده با مطالب آنلاین بیشتر، قصد دارد بیوانفورماتیک مبتنی بر اطلاعات (و نه مبتنی بر ژن) را برای افراد "زیستی" قابل درک کند. و افراد \"اطلاعات\" کتاب‌های مربوط به بیوانفورماتیک به طور سنتی در خدمت شکارچیان ژن و زیست‌شناسانی هستند که می‌خواهند درخت‌های خانوادگی بسازند که خطوط تبار مرتب را نشان می‌دهند. در حالی که به طور گسترده به موضوعات هیجان انگیز کشف ژن و جستجو در پایگاه داده می پردازند، چنین کتاب هایی به سختی ژنوم ها را به عنوان کانال های اطلاعاتی در نظر گرفته اند که از طریق آن اشکال و سطوح مختلف اطلاعات از طریق نسل ها عبور کرده اند. این «بیوانفورماتیک جدید» در تضاد با بیوانفورماتیک مبتنی بر ژن «قدیمی» است که متون قبلی را به خود مشغول کرده است. اشکال اطلاعاتی که ما با آنها آشنا هستیم (ذهنی، متنی) به فرم هایی مربوط می شود که کمتر با آنها آشنا هستیم (ارثی). این کتاب خطی از تفکر تکاملی را گسترش می‌دهد که از قرن نوزدهم (داروین، باتلر، رومنز، بیتسون)، تا قرن بیستم (گلدشمیت، وایت)، و به قرن بیست و یکم (آثار پایانی استفان جی گولد فقید) منتهی می‌شود. منطقه ای طولانی از بحث و جدل، اکنون ممکن است دیدگاه های متفاوت با هم سازگار شوند.

Now in its third edition and supplemented with more online material, this book aims to make the "new" information-based (rather than gene-based) bioinformatics intelligible both to the "bio" people and the "info" people. Books on bioinformatics have traditionally served gene-hunters, and biologists who wish to construct family trees showing tidy lines of descent. While dealing extensively with the exciting topics of gene discovery and database-searching, such books have hardly considered genomes as information channels through which multiple forms and levels of information have passed through the generations. This “new bioinformatics” contrasts with the "old" gene-based bioinformatics that so preoccupies previous texts. Forms of information that we are familiar with (mental, textual) are related to forms with which we are less familiar (hereditary). The book extends a line of evolutionary thought that leads from the nineteenth century (Darwin, Butler, Romanes, Bateson), through the twentieth (Goldschmidt, White), and into the twenty first (the final works of the late Stephen Jay Gould). Long an area of controversy, diverging views may now be reconciled.