Encyclopedic Reference of Genomics and Proteomics in Molecular Medicine

front-matter.pdf......Page 2
Definition......Page 42
Definition......Page 43
Definition......Page 44
Definition......Page 45
Characteristics......Page 46
Regulatory Mechanisms......Page 48
Definition......Page 49
Definition......Page 50
Definition......Page 51
Molecular Genetics of Acute Intermittent Porphyria......Page 52
Molecular Dysregulation and the Disorder-Disease Process......Page 53
Therapy......Page 54
References......Page 55
Definition......Page 56
Characteristics......Page 57
The Brain\'s Reward System......Page 58
Drug Substitution and Anti-Craving Medication......Page 59
Definition......Page 60
Adherens Junction......Page 61
Cadherin System......Page 62
Cadherin Complex......Page 64
Regulatory Mechanisms......Page 65
Adhesion Molecules......Page 66
Integrins......Page 67
Immunoglobulin Superfamily Cell Adhesion Molecules (IgCAMs)......Page 68
Definition......Page 69
Definition......Page 70
Definition......Page 71
Characteristics......Page 72
Identification of Protein Complexes......Page 73
References......Page 75
Definition......Page 76
Definition......Page 77
Definition......Page 78
Characteristics......Page 79
Regulation of MGMT......Page 81
Clinical Applications: MGMT Inhibitors and MGMT Gene Transfer......Page 82
Definition......Page 83
Definition......Page 84
Definition......Page 85
Abundance of Human Alternative Splicing......Page 86
Enhancer/Silencer......Page 87
Alternative Splicing in Disease......Page 88
Further Reading......Page 89
Epidemiology and Risk Factors......Page 90
Genetics......Page 91
Therapy......Page 93
Genetic Counseling......Page 94
Definition......Page 95
Classification of Amino Acids......Page 96
Rare Amino acids and Non-protein Amino Acids......Page 100
Optical Characteristics and Stereochemistry of Amino Acids......Page 101
Absorption Spectra of Amino Acids......Page 102
Analysis of Amino Acid Content and Determination of Amino Acid Sequence of Polypeptides and Proteins......Page 103
Peptides, Structure and Conformation......Page 104
The Peptide Bond is Rigid and Planar......Page 105
Methods Used to Determine the Tertiary Structure of Proteins......Page 106
Clinical Relevance......Page 107
Definition......Page 109
Amyotrophy......Page 110
Description......Page 111
Sedimentation Velocity......Page 113
Sedimentation Equilibrium......Page 114
Definition......Page 115
Characteristics......Page 116
VEGF\'s......Page 117
Regulatory Mechanisms......Page 118
Definition......Page 119
Anomalous Scattering......Page 120
Definition......Page 121
Definition......Page 122
AOM......Page 123
Definition......Page 124
Definition......Page 125
Molecular Interactions......Page 126
Bacterial and Fungal Infections......Page 128
Autoimmune Inflammation......Page 130
References......Page 131
Definition......Page 132
ARE......Page 133
Definition......Page 134
Definition......Page 135
Definition......Page 136
AT-LD......Page 137
Description......Page 138
Clinical Applications......Page 139
References......Page 140
Positional Cloning......Page 141
Candidate Gene Studies......Page 142
HLA-DRB1......Page 144
Genes in the Interleukin (IL)-4/IL-13 Pathway......Page 145
CD14......Page 146
ATP-Dependent Nucleosome Remodelling......Page 147
Definition......Page 148
Systemic Autoimmune Diseases......Page 149
Genetics......Page 151
References......Page 153
Characteristics......Page 154
Arrayed cDNAs and Tracked Transfections into Cell Cultures......Page 155
Clinical Relevance......Page 156
Definition......Page 158
Definition......Page 159
Definition......Page 160
Wnt Signalling......Page 161
Transcription Factors (goosecoid, lim1, foxa2/hnf3beta/axial, and floating head/Xnot)......Page 162
Nodal and Nodal Inhibitors......Page 163
Definition......Page 164
Definition......Page 165
Definition......Page 166
Mechanism......Page 167
Substrates and Structure of DNA Glycosylases......Page 168
Mouse Models......Page 169
Definition......Page 170
BCC......Page 171
Definition......Page 172
Beta‐Blocker (&bbeta;‐Blocker)......Page 173
Definition......Page 174
Definition......Page 175
Biosynthesis of Sialic Acid and Biochemical Engineering of Glycoproteins......Page 176
Engineering of Cell Surface Sialic Acid Interferes’with’Virus Infections......Page 177
Activation of Human T‐lymphocytes by ManProp......Page 178
Stimulation of Neurons......Page 179
Definition......Page 180
Lipid Composition......Page 181
Molecular Interactions......Page 183
Regulatory Mechanisms......Page 184
Definition......Page 186
Adoption Studies......Page 187
Linkage Studies......Page 188
Definition......Page 189
Definition......Page 190
Metaphase Chromosomes......Page 191
Mutations......Page 192
Craniofacial Phenotype......Page 193
Definition......Page 194
Definition......Page 195
Characteristics......Page 196
Molecular Interactions......Page 197
References......Page 198
References......Page 199
Abnormal Patterning......Page 200
Abnormal Growth......Page 201
Defects in Homeostasis......Page 204
Definition......Page 205
References......Page 206
Vessels......Page 208
Neurons......Page 209
Molecular Interactions......Page 211
Definition......Page 213
References......Page 214
Histological Carcinogenesis......Page 215
Steroid Hormone Receptors......Page 216
Ki‐67......Page 217
E‐Cadherin......Page 218
Various Breast Cancer Antigens......Page 219
Definition......Page 220
Definition......Page 221
bZIP Proteins......Page 222
References......Page 223
Protein – Protein Interaction Screens......Page 224
Definition......Page 225
References......Page 226
References......Page 227
Regulatory Mechanisms......Page 228
Genetics......Page 229
Programmed Cell Death......Page 230
RNAi and MicroRNAs......Page 231
Aging and Life Span Regulation......Page 232
References......Page 233
References......Page 234
VHHs Against the Proteome......Page 235
Camelid VHH as Crystallisation Aids......Page 236
Definition......Page 237
References......Page 238
Proteomes of Invasive Cells......Page 239
The Tumour Ecosystem......Page 241
Definition......Page 242
References......Page 243
Cap‐independent Initiation of Translation......Page 244
Definition......Page 247
Definition......Page 248
Cardiac Function......Page 249
G‐Protein Coupled Receptors......Page 251
The Stretch Signal......Page 252
Ras/MAPK Signaling......Page 253
Acknowledgements......Page 254
Characteristics......Page 255
Clinical Relevance......Page 256
References......Page 257
Definition......Page 258
Application of Ribozymes......Page 259
Clinical Application of RNAi......Page 261
Future Applications......Page 264
Definition......Page 265
References......Page 266
References......Page 267
References......Page 268
Specialized Cell‐Cycles......Page 269
Kinases and Phosphatases......Page 270
Subcellular Localization......Page 271
The Spindle Assembly Checkpoint and Exit from Mitosis......Page 272
References......Page 273
Cell Division in Development......Page 274
Specialized Cell Division: Asymmetry......Page 275
References......Page 276
The Formation of the Apical Junctional Complex......Page 277
Polarized Secretion and Protein Targeting......Page 278
Definition......Page 283
Regulatory Mechanisms......Page 284
Cellular Senescence, Cancer, and Ageing......Page 285
Definition......Page 287
Regulatory Functions......Page 288
Definition......Page 290
Definition......Page 291
References......Page 292
Characteristics......Page 293
Chemokine Receptors......Page 294
Role in Immune Response......Page 295
Chemokine Receptors in Pathogen Infection......Page 296
References......Page 297
Chip Technologies, Basic Principles......Page 298
Solid Support......Page 299
Deposition of Prefabricated Molecules......Page 300
Handling and Detection......Page 302
Clinical Applications and Therapeutical Consequences......Page 303
Definition......Page 304
References......Page 305
Transcription‐related Chromatin Acetylation......Page 306
Cross‐talk Between Chromatin Acetylation and Other’Chromatin Modifications......Page 307
Definition......Page 308
References......Page 309
Mechanisms: Sliding, Jumping, Ejection and Exchange......Page 311
Clinical Relevance......Page 312
Chromatin Remodelling Factors......Page 313
References......Page 314
Chromosome Breaks and DNA Double‐Strand Break’Repair......Page 315
DNA‐Repair and the Cell Cycle......Page 318
Clinical Relevance......Page 319
Definition......Page 320
Monogenic Disorders......Page 321
Gene Catalogue......Page 323
Molecular Mechanisms of Pathogenesis in DS......Page 326
Definition......Page 327
Mitotic Chromosome Condensation......Page 328
Protein Components – Topoisomerase II and Condensin......Page 329
References......Page 331
Definition......Page 332
Circadian Clocks......Page 333
References......Page 334
Clock Cells in the Suprachiasmatic Nucleus......Page 335
Circadian Control of the Sleep‐Wake Cycle in Humans......Page 336
References......Page 337
References......Page 338
Synonyms to ‘active site’......Page 339
Definition......Page 340
Characteristics......Page 341
Cellular and Molecular Regulation......Page 343
Definition......Page 344
Characteristics......Page 345
Gene Therapy of Monogeneic Diseases......Page 347
Prevention and Therapy of Infectious Disease......Page 348
Current Expectations Concerning Clinical Gene Transfer......Page 349
CLP......Page 350
CMT......Page 351
Definition......Page 352
References......Page 353
Characteristics......Page 354
Molecular Consequences of APC Mutations......Page 355
Wnt Target Genes and Cancer Development......Page 356
Definition......Page 357
References......Page 358
Common Cardiovascular Disorders......Page 359
Common Immunologic Disorders......Page 360
Technological Advances......Page 361
Definition......Page 362
Definition......Page 363
Marker......Page 364
Evaluation......Page 365
Lymphoma......Page 366
Definition......Page 367
Definition......Page 368
Definition......Page 369
Definition......Page 370
References......Page 371
Definition......Page 372
Evidence of Genetic Background......Page 373
Characteristics of Genetic Studies of COPD and Asthma......Page 374
Cellular and Molecular Regulation......Page 376
Clinical Relevance......Page 377
Definitions......Page 378
Core Promoter Elements......Page 379
Inr Element......Page 380
Definition......Page 381
References......Page 382
Covalent Coupling......Page 383
Characteristics......Page 384
Normal Developmentally Regulated CpG Island Methylation......Page 385
References......Page 386
Characteristics......Page 387
Conditional Gene Targeting......Page 389
DNA Integration and Genome Engineering......Page 390
References......Page 391
Definition......Page 392
Characteristics......Page 393
Cellular and Molecular Regulation......Page 394
Definition......Page 396
Definition......Page 397
Determination of a 3D Structure......Page 398
Definition......Page 401
References......Page 402
References......Page 403
Definition......Page 404
Characteristics......Page 405
Interference with Cytokine Action......Page 407
Regulatory Mechanisms......Page 408
Definition......Page 409
Definition......Page 410
Intermediate Filaments......Page 411
Intermediate Filaments of Type III (Vimentin‐like Filaments)......Page 412
Therapeutic Use of Agents with Action on Microtubules......Page 413
Definition......Page 414
Definition......Page 415
References......Page 416
Exploration......Page 417
Clinical Relevance......Page 418
Definition......Page 419
Definition......Page 420
References......Page 421
Mechanism of Tissue Damage by Misfolded Proteins......Page 422
Molecular Diagnostics and Therapy......Page 423
Definition......Page 424
Definition......Page 425
Definition......Page 426
Ultrastructural Appearance......Page 427
Desmosomal Cadherins......Page 428
Armadillo Proteins......Page 429
Desmoplakin......Page 430
Definition......Page 431
Diabetes Insipidus, a Water Homeostasis Disease......Page 432
The Genetics of Diabetes Insipidus......Page 433
Defective V2R ‐ X‐linked Recessive NDI......Page 434
Definition......Page 436
References......Page 437
Type 2 Diabetes......Page 438
The Search for Diabetes Complications Genes......Page 439
Definition......Page 440
Definition......Page 441
References......Page 442
Fitting of Heat Capacity Curves to Different Transition’Models Using Partition Functions......Page 444
Stoichiometry Tests......Page 445
Estimation of the Average Degree of Ligandation......Page 446
Definition......Page 447
Definition......Page 448
Definition......Page 449
Definition......Page 450
DNA Amplification......Page 451
Characteristics......Page 452
Mechanisms of DNA Amplification......Page 453
Definition......Page 455
Characteristics......Page 456
Ionizing Radiation......Page 457
Chemical DDA......Page 458
Aromatic Hydrocarbons (PAH)......Page 459
Alkylating Agents: N‐Nitrosamines and N‐Nitrosamides......Page 460
DDA in Tobacco Smoke......Page 461
Definition......Page 463
Biochemical Characteristics......Page 464
Bioinformatic Characteristics......Page 465
Helicases and Human Disease......Page 468
Clinical Relevance......Page 469
ATP‐Dependent DNA Ligases......Page 470
DNA Ligase Inhibitors with Antibiotic Activity......Page 472
Definition......Page 473
DNA Polymerase &balpha;‐Primase......Page 474
DNA Polymerase &bgamma;......Page 476
DNA Polymerase ϵ......Page 477
References......Page 478
Definition......Page 479
References......Page 480
Clinical Relevance......Page 482
References......Page 483
Genetics......Page 484
References......Page 485
References......Page 486
Prevention of Re‐Replication by Cdks......Page 487
Prevention of Re‐Replication by Geminin: Is It Independent of Cdk Activity?......Page 488
Definition......Page 489
Characteristics......Page 490
Reactions Carried Out by Topoisomerases......Page 491
Topoisomerase Strand Passage Mechanisms......Page 492
The Complement of Topoisomerases in Cells: Genetic’Studies on the Physiological Roles of Topoisomerases......Page 493
Biological Functions: Replication......Page 494
Chromosome Structure and Condensation......Page 495
Clinical Relevance......Page 496
Vector Design......Page 497
Coexpression of Immune Modulators by DNA Vaccines......Page 498
Production of DNA Vaccines......Page 499
Definition......Page 500
Definition......Page 501
References......Page 502
References......Page 503
Clinical Relevance......Page 505
Definition......Page 506
Genetic Tools......Page 507
Genomic Tools......Page 508
Clinical Relevance......Page 510
Characteristics......Page 511
Evolutionary Conservation of Heart Formation......Page 513
Using Model Systems to Identify Gene Functions Involved in Polygenic Traits......Page 514
References......Page 515
Drug Tolerance......Page 516
Characteristics......Page 517
Clinical Relevance......Page 518
Definition......Page 519
Definition......Page 520
Definition......Page 521
Definition......Page 522
EGFR......Page 523
Definition......Page 524
2‐D Electron Microscopy and Sample Preparation for EM......Page 525
Visualization of 3‐D Data......Page 526
Molecular Component Identification: the Quest for a GFP for Electron Microscopy......Page 527
Definition......Page 528
Definition......Page 529
Definition......Page 530
Definition......Page 531
Definition......Page 532
Enhancers Have a Modular Structure......Page 533
Mechanism of Action: Certainly Recruitment – but How?......Page 535
Enhancers in the Context of Eukaryotic Gene Regulation......Page 537
Definition......Page 538
Definition......Page 539
Definition......Page 540
Types of Protein Hydroxylation......Page 541
Overview......Page 543
Individual Values and Cultural Diversities......Page 544
Procollagen Lysyl‐5‐Hydroxylases (EC 1.14.11.4)......Page 545
Clinical Relevance of Collagen Hydroxylation......Page 549
Definition......Page 550
Epigenetic (Epigenetics)......Page 551
Definition......Page 552
Modifier Genes of the CF Phenotype......Page 553
Clinical Relevance......Page 554
Molecular Interactions......Page 555
Intercellular Junctions......Page 556
Cytoskeleton......Page 558
Specialized Epithelia......Page 559
The Apical Junctional Complex......Page 560
Pathogen Entry and Host Defense......Page 561
Definition......Page 562
Definition......Page 563
Definition......Page 564
Functional Genomics......Page 565
Functional Genomics and Application to Embryonic Stem Cells......Page 566
ESI‐MS......Page 568
Towards Risk Factor Health Assessment and Education......Page 569
Carrier Ethics and Family Health Care......Page 570
Research Ethics in Molecular Medicine......Page 571
Definition......Page 573
Excitable Membranes......Page 574
Definition......Page 575
Exit from the ER......Page 576
Arrival at and Transit Through the Golgi Complex......Page 577
Regulatory Mechanisms......Page 578
Definition......Page 579
Definition......Page 580
Definition......Page 581
Constituents of the ECM......Page 582
Organization of the ECM......Page 583
Interactions with Cell Surface Receptors......Page 585
Definition......Page 586
Definition......Page 587
References......Page 588
Acknowledgements......Page 589
Inheritance......Page 590
“Early Disease”......Page 591
Pathogenetic Mechanisms......Page 592
Clinical Relevance......Page 595
Familial Hypercholesterolemia......Page 596
References......Page 597
Cellular and Molecular Regulation......Page 598
Clinical Relevance......Page 599
Definition......Page 600
References......Page 601
Palmitoylation......Page 602
DHHC‐CRD Proteins......Page 603
Release of Acylated Proteins from the Membrane......Page 604
Fatty Acid Acylation and the Viral Replication Cycle (3, 5)......Page 605
Definition......Page 606
References......Page 607
Fibroblasts\' Heterogeneity......Page 608
Role of Fibroblasts in Wound Healing and Tissue Remodeling......Page 609
Conclusions and Perspectives......Page 610
Definition......Page 611
Definition......Page 612
Definition......Page 613
Definition......Page 614
References......Page 615
Clinical Applications......Page 616
Definition......Page 617
References......Page 618
Particle Localization with Nanometer Precision......Page 619
Clinical Applications......Page 621
Description......Page 622
Definition......Page 625
Definition......Page 626
Definition......Page 627
Formation of Focal Adhesions......Page 628
Conclusion......Page 629
References......Page 630
Visualizing the Formation of Focal Complexes and Focal Contacts......Page 631
Definition......Page 632
Theory......Page 633
Sensitized Emission......Page 634
Acceptor Photobleaching......Page 635
Photochromic FRET (pcFRET)......Page 636
Outlook......Page 637
Definition......Page 638
Definition......Page 639
Treatment......Page 640
References......Page 641
Definition......Page 643
FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching)......Page 644
FLIP (Fluorescence Loss in Photobleaching)......Page 645
References......Page 646
FLIP (Fluorescence Loss in Photobleaching)......Page 647
Free Induction Decay......Page 648
References......Page 649
Molecular Interactions (1, 3, 4)......Page 650
Regulation by Free Radicals......Page 651
FTI......Page 652
RNA is an Intermediate between DNA and Protein......Page 653
Full‐Length Cloning and Sequencing vs. Gene Discovery......Page 654
Clinical Relevance......Page 655
References......Page 656
Reference......Page 658
Fluorescence Photobleaching Techniques......Page 659
Functional Genomics, a Major Step Forward......Page 660
Evolutionary Analysis......Page 661
Alternative Splice Products......Page 662
Analysis of Transcript Levels......Page 663
RNAi Constructs......Page 666
Systems Biology......Page 667
Fluorescence Correlation Spectroscopy......Page 670
Definition......Page 672
FzB......Page 673
Gamates......Page 674
Connexins......Page 675
Assembly and Breakdown of Gap Junctions......Page 678
Modifications in Disease......Page 679
Definition......Page 680
Definition......Page 681
Characteristics......Page 682
Clinical Relevance......Page 685
Clinical Applications......Page 689
The Microarray Experiment......Page 691
Analysis and Data Management......Page 692
Definition......Page 693
References......Page 694
Evolutionary Implications of Gene Duplication......Page 695
Definition......Page 696
Definition......Page 697
Definition......Page 698
References......Page 699
The Flanking Allele Problem......Page 700
Solutions to the Flanking Allele Problem......Page 701
References......Page 702
Accuracy of the Coding Rules......Page 703
Caveat......Page 704
Reassignments......Page 705
References......Page 707
Definition......Page 708
Parametric Linkage Analysis......Page 713
Non‐Parametric Linkage Analysis of Complex Diseases......Page 714
Quantitative Phenotypes......Page 715
Linkage Disequilibrium......Page 716
Family‐based Association Studies......Page 717
Genetic Heterogeneity......Page 718
References......Page 719
Linkage Genome Screens......Page 720
Clinical Relevance......Page 721
Definition......Page 722
Cellular and Molecular Regulation......Page 723
Genealogy Tracing for Identification of Affected’Individuals......Page 724
References......Page 725
References......Page 726
(Whole) genome analysis of single disseminatedcancer cells......Page 727
Clinical Relevance......Page 728
Characteristics of Imprinted Genes......Page 729
Molecular Mechanisms......Page 730
Clinical Relevance......Page 731
Characteristics......Page 732
Expression Microarrays......Page 733
Summary......Page 734
Definition......Page 735
References......Page 736
Definition......Page 737
Myelin Lipids......Page 738
Myelin Basic Protein (MBP, McKusick *159430)......Page 739
Definition......Page 740
Definition......Page 741
References......Page 742
Definition......Page 743
Characteristics......Page 744
N‐Glycan Biosynthesis......Page 748
GPI‐Anchor Biosynthesis......Page 752
Biosynthesis of Other O‐Glycans......Page 754
Glycoproteins Have Many Biological Functions......Page 755
Human Disorders Associated with Defective Protein’Glycosylation......Page 756
Definition......Page 757
References......Page 758
Definition......Page 759
G‐Protein Composition and Structural Aspects......Page 760
G‐Protein Cycle......Page 761
Activating Mutations in G&balpha;s......Page 763
Loss‐of‐Function Mutations in G&balpha;s......Page 764
References......Page 767
Definition......Page 768
References......Page 769
Regulatory Mechanisms......Page 771
Definition......Page 773
Definition......Page 774
Characteristics......Page 775
Regulatory Mechanisms......Page 776
Definition......Page 779
Definition......Page 780
Definition......Page 781
Characteristics......Page 782
The Heartbeat......Page 783
Modulation of Cardiac Contraction by Sympathetic’Innervation......Page 784
Definition......Page 785
Definition......Page 786
Reception and Transduction of the Hedgehog Signal......Page 787
Transcriptional Mediation......Page 788
Regulatory Mechanisms......Page 789
Definition......Page 790
Definition......Page 791
Molecular Interactions......Page 792
Acquired and Genetic Skin Diseases Involving Hemidesmosomes......Page 793
Regulatory Mechanisms......Page 795
Definition......Page 796
References......Page 797
Secondary Hemochromatosis......Page 798
Hepatocellular Carcinoma......Page 799
References......Page 800
Genetic Risk......Page 801
References......Page 803
References......Page 804
Recombinant Activated Coagulation Factor VII (rFVIIa)......Page 805
Hereditary Motor Neuropathies......Page 806
References......Page 807
Peripheral Myelin Protein 22 Gene (PMP22; OMIM *601097)......Page 809
Kinesin Family Member 1B Gene (KIF1B; OMIM’*605995)......Page 810
Neurofilament, Light Polypeptide Gene (NEFL; OMIM’*162280)......Page 811
Inhibitor of Kappa Light Polypeptide Gene Enhancer in’B‐„cells, Kinase Complex‐associated Protein Gene (IKBKAP; OMIM......Page 812
References......Page 813
Susceptibility Genes......Page 814
DNA Mismatch Repair Defect in HNPCC......Page 815
Drug Sensitivity or Resistance......Page 816
Cell Recognition and Signalling: L1‐CAM......Page 817
Abnormalities of Mitochondrial Molecular Chaperones:’Paraplegin and HSP60......Page 818
Defects of Intracellular Molecular Trafficking: KIF5A,’Spartin, Spastin and Atlastin......Page 819
Definition......Page 820
Epidermolysis Bullosa Simplex (EBS)......Page 821
Epidermolytic Hyperkeratosis (EHK; Bullous Congenital Ichthyosiform Erythroderma of Brocq; Bullous Ichthyosis)......Page 822
Cellular and Molecular Regulation......Page 824
Clinical Relevance......Page 825
Definition......Page 826
Definition......Page 827
Definition......Page 828
References......Page 829
Definition......Page 830
Characteristics......Page 831
Molecular Diagnostics......Page 832
Microarray Preparation......Page 833
Detection Assay......Page 834
Gene Silencing Studies......Page 835
Clinical Relevance......Page 836
References......Page 837
Definition......Page 838
Variations Within the MHC and Their Associations’with’Diseases......Page 839
Rheumatoid Arthritis......Page 840
Clinical Relevance......Page 841
Definition......Page 842
References......Page 843
References......Page 844
Biological Functions......Page 845
Mutations Associated with Diseases and Syndromes......Page 846
Homeobox Genes Implicated in Cancer......Page 850
Definition......Page 851
Description......Page 852
Alignment of the Query Sequence with the Template(s)......Page 853
Clinical Applications and Therapeutic Consequences......Page 854
Definition......Page 855
Definition......Page 856
Definition......Page 857
HTH......Page 858
References......Page 859
Characteristics......Page 860
Clinical Relevance......Page 862
References......Page 869
Genetics......Page 870
From Aggregation to Pathology......Page 871
Point of Origin – Expansion Mechanisms in HD......Page 872
Definition......Page 873
Definition......Page 874
References......Page 875
Hypoparathyroidism......Page 876
Hyperparathyroidism......Page 877
Definition......Page 878
Definition......Page 879
Definition......Page 880
References......Page 881
References......Page 882
GHRH Receptor Mutations......Page 884
Pituitary Transcription Factor Mutations......Page 885
Clinical Relevance......Page 886
Characteristics......Page 887
Oxygen Dependent HIF Activation......Page 888
Angiogenesis and Erythropoiesis......Page 889
Clinical Relevance......Page 890
Definition......Page 891
Definition......Page 892
Definition......Page 893
Cellular and Molecular Regulation......Page 894
Definition......Page 896
Definition......Page 897
Definition......Page 898
Characteristics......Page 899
Definition......Page 903
Definition......Page 904
In Situ Localization of the Protein......Page 905
Traditional Generation of Antibodies......Page 906
Definition......Page 907
Definition......Page 908
Definition......Page 909
Transgenic Mice with Fluorescent Protein Expression......Page 910
Definition......Page 912
Definition......Page 913
Innate Immunity and Inflammation......Page 914
Necrosis......Page 915
Apoptotic and Necrotic Signals to Phagocytes......Page 916
Secretory Phospholipase and C‐Reactive Protein in Apoptosis and Necrosis......Page 917
Concluding remark......Page 918
Definition......Page 919
References......Page 920
The Fragile X Syndrome......Page 921
Linking an Autosomal Recessive Enzyme Defect with Dysmorphology......Page 922
Cellular and Molecular Regulation......Page 923
Definition......Page 924
Definition......Page 925
Definition......Page 926
Definition......Page 927
References......Page 928
Connections to Intracellular Signaling Pathways......Page 929
Integrin Cross‐talk......Page 930
Definition......Page 931
Definition......Page 932
Definition......Page 933
Interleukins: Expression and Biological Activity......Page 934
Interleukin Receptors......Page 936
Molecular Interactions......Page 939
References......Page 940
References......Page 941
Expression......Page 942
Genes......Page 945
Cellular and Molecular Regulation......Page 946
Disorders of Intermediate Filaments......Page 947
Definition......Page 948
References......Page 949
Characteristics......Page 950
Voltage‐gated Ion Channels......Page 951
Kv Channels......Page 952
Definition......Page 953
Iron Storage Disease......Page 954
Definition......Page 955
References......Page 956
Binding to Independent Sites......Page 958
Thermodynamic Relationships......Page 960
Determination of Kinetic Parameters of Enzyme Reactions Using ITC......Page 961
Definition......Page 962
Definition......Page 963
Transactivation Domain......Page 964
References......Page 965
Post‐Translational Control of AP‐1 Activity......Page 966
In Vivo Functions of Fos and Jun Proteins in Physiology’and Pathology......Page 967
Acknowledgements......Page 970
Juvenile Spinal Muscular Atrophy......Page 971
Definition......Page 972
Definition......Page 973
References......Page 974
Induction of Ureteric Bud......Page 975
Wnt Signals as Inducers of Kidney Tubulogenesis......Page 976
Regulatory Mechanisms......Page 977
Acknowledgement......Page 978
Definition......Page 979
Definition......Page 980
Definition......Page 981
References......Page 982
Forward Genetics......Page 983
Clinical Relevance......Page 984
Relevance of “Model‐Mutations” to Diseases......Page 985
References......Page 986
Characteristics......Page 987
The German Gene Trap Consortium......Page 988
Clinical Relevance......Page 989
Characteristics......Page 990
Large‐Scale Processes – Outline of Operating Concepts......Page 991
Outline Units......Page 992
General Discussion......Page 993
Definition......Page 994
LDL......Page 995
Definition......Page 996
Definition......Page 997
References......Page 998
References......Page 1000
Acute Myeloid Leukemia......Page 1001
Acute Lymphoblastic Leukemia......Page 1002
Chronic Lymphocytic Leukemia......Page 1003
Acute Myeloid Leukemia......Page 1004
Chronic Lymphocytic Leukemia......Page 1005
Acute Lymphoblastic Leukemia......Page 1006
Chronic Lymphocytic Leukemia......Page 1007
Definition......Page 1008
Definition......Page 1009
References......Page 1010
Characteristics......Page 1011
The BMP‐Wnt/&bbeta;‐catenin Regulatory Network (Fig. 3b)......Page 1012
Limb Defects in Humans......Page 1014
LGMD1A: Genetic Localization: 5q31; Causative Protein: Myotilin (TTID)......Page 1015
Other LGMD1:......Page 1016
LGMD2J: Genetic Localization: 2q24.3; Causative Protein: Titin (TTN)......Page 1017
Cellular and Molecular Regulation......Page 1018
Definition......Page 1019
Definition......Page 1020
Lipopolysaccharide......Page 1021
Definition......Page 1022
Definition......Page 1023
Definition......Page 1024
Definition......Page 1025
Definition......Page 1026
References......Page 1027
Sonic Hedgehog (SHH) Induces Mesenchymal Cell Proliferation......Page 1028
Wnt Signaling Controls Epithelial and Mesenchymal Differentiation......Page 1029
Toward an Integrated Model of Branching Morphogenesis......Page 1030
Lynch Syndrome......Page 1032
Definition......Page 1033
References......Page 1034
References......Page 1035
Algebraic Background of the Phase Determination......Page 1037
Definition......Page 1041
Mammalian Fertilization......Page 1042
Oogenesis in Mammals......Page 1043
Sperm‐Egg Interactions......Page 1044
ManNAc......Page 1047
Characteristics......Page 1048
Cellular and Molecular Recognition......Page 1050
References......Page 1051
Definition......Page 1052
Characteristics......Page 1053
Characteristics......Page 1055
MALDI Matrices......Page 1056
MALDI Sample Preparation......Page 1057
Protein Identification by MALDI MS Peptide Mass Fingerprinting......Page 1058
References......Page 1059
References......Page 1060
Tandem MS Modes......Page 1061
Tandem Mass Spectrometry in Proteomics......Page 1062
Definition......Page 1063
LC/MS......Page 1064
Instrumentation......Page 1066
Characteristics......Page 1067
Clinical Relevance......Page 1068
Definition......Page 1069
Definition......Page 1070
References......Page 1071
Functional Analysis of Genomes......Page 1072
Transgenesis......Page 1073
Comparative Approaches......Page 1074
References......Page 1075
The Stages of Meiosis......Page 1076
Homologous Chromosome Pairing......Page 1077
Meiotic Recombination......Page 1080
Chromosome Segregation at Meiosis I......Page 1082
Sex Differences in Germ Cell Development......Page 1083
Definition......Page 1084
References......Page 1085
Synonyms......Page 1086
Apparent Mineralocorticoid Excess (AME)......Page 1087
Pseudohypoaldosteronism Type II (PHA Type II)......Page 1089
Molecular Diagnostics......Page 1090
References......Page 1091
References......Page 1092
Endoribonucleolytic Decay......Page 1093
mRNA‐Stability Regulatory Proteins......Page 1094
Clinical Relevance......Page 1095
Metabolomics......Page 1098
Non‐Hyphenated Detection Technologies......Page 1099
Metabolite Fingerprinting......Page 1100
Clinical Relevance......Page 1101
References......Page 1102
References......Page 1103
Lysine Methylation......Page 1104
l‐Isoaspartyl Methylation......Page 1105
References......Page 1106
Hyperhomocysteinemia......Page 1107
References......Page 1108
Raw Data Analysis – from Hybridisation Images to Gene Expression Data Matrix......Page 1109
Higher Level Analysis – Extracting Biological Meaning from Data......Page 1111
Data Meta‐Analysis and Microarray Databases......Page 1112
References......Page 1113
Synonyms......Page 1114
Gene Expression Analysis in Colon Cancer......Page 1115
Hypoxia‐induced Gene Expression......Page 1120
Clinical Relevance......Page 1121
References......Page 1122
Candidate Gene Selection......Page 1123
Class Prediction and Class Discovery......Page 1124
Characteristics......Page 1125
What Is the Purpose of Microarray Experiments?......Page 1126
Samples for Microarray Analysis......Page 1130
Gene Expression Profiling of Tissues and Tissue Cells......Page 1131
Gene Expression Profiling of Peripheral Blood Cells......Page 1132
Clinical Relevance......Page 1133
References......Page 1134
Characteristics......Page 1135
Clinical Features......Page 1142
Synonyms......Page 1143
Biogenesis......Page 1144
Function......Page 1145
Related Molecules and Pathways......Page 1147
Definition......Page 1148
References......Page 1149
References......Page 1150
Assembly Mechanisms of Microvilli......Page 1153
Disorders of Microvilli and Pathology......Page 1154
References......Page 1155
References......Page 1156
Definition......Page 1157
Fusion and Fission of Mitochondria......Page 1158
Optic atrophy type I......Page 1159
Characteristics......Page 1160
Replication of the Mitochondrial Genome......Page 1161
Mitochondrial Inheritance......Page 1162
Segregation and Heteroplasmy......Page 1163
Definition......Page 1164
Known mtDNA Mutations: mtDNA Point Mutations......Page 1165
Clinical Relevance......Page 1166
References......Page 1167
Definition......Page 1168
References......Page 1169
MR as a Mutagenic (or Sub‐Optimal Repair) Process......Page 1171
Conclusions......Page 1172
References......Page 1173
Spindle Poles......Page 1174
Mechanism of Chromosome Movement......Page 1175
References......Page 1176
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Definition......Page 1178
Free Radical Theory......Page 1179
Mouse Models of Human Aging......Page 1180
Definition......Page 1181
References......Page 1182
Clinical Applications......Page 1184
Definition......Page 1186
References......Page 1187
Applications in Drug Design......Page 1188
Determination, Modeling and Analysis of Target Structures......Page 1189
Free‐Energy Calculations......Page 1191
References......Page 1193
Taking a Step......Page 1203
Molecular Interactions......Page 1204
Regulatory Mechanisms......Page 1206
References......Page 1207
Hybridoma Technique for the Production of Monoclonal Antibodies......Page 1208
Production of Recombinant Antibodies......Page 1209
Monoclonal Antibodies in Diagnostics......Page 1211
Monoclonal Antibodies in Therapy......Page 1212
Monogenic Hypertension......Page 1214
Definition......Page 1215
Polymorphisms......Page 1216
Clinical References......Page 1217
References......Page 1218
Morpholino Oligonucleotides Based Genetics......Page 1219
Definition......Page 1220
Introduction to the Mouse Genome......Page 1221
Transgenics......Page 1222
Duplications......Page 1223
Inversions......Page 1224
Translocations......Page 1225
Definition......Page 1226
A Brief History of Molecular MRI......Page 1227
Relaxation‐Time Based MRI......Page 1228
Perspectives......Page 1229
Discovery of the mRNA Cap from Virus Research......Page 1230
Fundamental Structure and Biological Functions of the Cap......Page 1231
Corona Virus......Page 1232
Adenovirus and Discovery of mRNA Splicing......Page 1233
Clinical Relevance......Page 1234
References......Page 1235
References......Page 1236
References......Page 1237
Homo‐ and Heteronuclear NMR......Page 1238
Three‐Dimensional NMR......Page 1239
Resolution in NMR Spectra......Page 1240
Multidrug Resistance and Cancer......Page 1241
MDR1/P‐Glycoprotein: Drug Transport, Gene Expression and Therapy‐caused Induction......Page 1242
The MRP Family: Drug‐Transport and Clinical Implications......Page 1243
MDR Modulators of the First, Second and Third Generations......Page 1244
Definition......Page 1245
Multiplexed Expression Fluorescence in Situ Hybridization......Page 1246
References......Page 1247
Characteristics......Page 1248
Mechanochemical Energy Transformation......Page 1249
Excitation‐Contraction Coupling......Page 1251
Clinical Relevance......Page 1252
All Skeletal Muscles are Derived from Defined Mesodermal Progenitor Cell Populations in the Vertebrate Embryo......Page 1253
The MRF Family of Four Basic Helix‐Loop‐Helix Transcription Factors Dictates Skeletal Muscle Development......Page 1254
Members of the Myocyte Enhancer Factor 2 (MEF2) Family of Transcription Factors Collaborate with MRFs in Myoblast Differentiat......Page 1255
Myogenic Determination Occurs Independently in Somites and Limb Buds......Page 1256
Definition......Page 1257
Mutagenesis Approaches......Page 1258
Inbred Medaka Strains......Page 1259
Linkage Map and Positional Cloning......Page 1260
Clinical Relevance......Page 1261
ENU Mutagenesis Screens......Page 1262
Mosaic Screens......Page 1263
Insertional Mutagenesis Screens......Page 1266
Clinical Relevance......Page 1267
Characteristics......Page 1268
Clinical Relevance......Page 1271
Definition......Page 1272
Definition......Page 1273
Characteristics......Page 1274
The DNA‐Chromatin Level......Page 1275
DMPK......Page 1276
Definition......Page 1277
Definition......Page 1278
Symptoms......Page 1279
References......Page 1280
Definition......Page 1281
References......Page 1282
Definition......Page 1284
Definition......Page 1285
Definition......Page 1286
Definition......Page 1287
Characteristics......Page 1288
Migration of NC Cells......Page 1289
Enteric Progenitors......Page 1290
Characteristics......Page 1291
References......Page 1292
Patterning of the Neural Tube......Page 1293
Proneural bHLH Factors......Page 1294
Generation of Glial Cells......Page 1295
Axon Guidance......Page 1296
Initiation of Synapse Formation......Page 1297
Synapse Elimination at Neuromuscular Junctions......Page 1298
Definition......Page 1299
References......Page 1300
Neural Stem Cells in the Adult Brain......Page 1301
Molecular Interactions......Page 1302
Definition......Page 1303
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The NF1 Gene Product (Neurofibromin)......Page 1305
NF1 – a Tumour Suppressor Gene......Page 1306
References......Page 1307
Definition......Page 1308
Dendrites......Page 1309
Axons......Page 1310
Synapses......Page 1311
References......Page 1313
References......Page 1314
Secretion......Page 1316
Retrograde/Anterograde Transport......Page 1317
Definition......Page 1318
Characteristics......Page 1319
I&bkappa;B Kinase Complex......Page 1321
Molecular Mechanisms of NF‐&bkappa;B Activation......Page 1323
Mechanisms of NF‐κB Dependent Transactivation......Page 1324
Nick‐Closing Enzymes......Page 1325
NMD......Page 1326
References......Page 1327
Ligand Observation......Page 1328
Hit Elaboration and Optimization......Page 1330
References......Page 1331
Characteristics......Page 1332
The HMGA Proteins......Page 1333
Definition......Page 1334
References......Page 1335
Signal Transduction......Page 1336
Cleavage of the Receptor......Page 1337
Regulatory Mechanisms......Page 1339
Interactions with Other Signalling Pathways......Page 1340
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References......Page 1342
The Nucleolus......Page 1343
PML Bodies......Page 1344
Clinical Relevance......Page 1345
Definition......Page 1346
References......Page 1347
The Ligand‐Binding Domain......Page 1350
Ligand Independent Activation of Nuclear Receptors......Page 1351
Rapid Action of Nuclear Receptor......Page 1352
Characteristics......Page 1353
Nuclear Import Pathways......Page 1354
Regulatory Mechanisms......Page 1355
Nuclear Transport and Human Disease......Page 1356
Definition......Page 1357
Characteristics......Page 1358
Interactions Between Nucleoporins and Transport Receptors......Page 1359
Regulatory Mechanisms......Page 1360
References......Page 1361
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Characteristics......Page 1363
Methylation......Page 1364
Clinical Relevance......Page 1365
De Novo Pyrimidine Nucleotide Biosynthesis......Page 1366
Bacterial and Parasitic Infections......Page 1369
Recognition of Damage in Non‐Transcribing Regions of the Genome......Page 1370
Damage Verification......Page 1372
Replication of Damaged DNA......Page 1373
Clinical Relevance......Page 1374
Definition......Page 1375
OFC......Page 1376
Definition......Page 1377
Characteristics......Page 1378
Definition......Page 1380
Definition......Page 1381
Definition......Page 1382
Definition......Page 1383
Definition......Page 1384
Oxidation......Page 1385
Definition......Page 1386
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Outlook......Page 1388
Definition......Page 1389
Definition......Page 1390
Clinical......Page 1391
Genetic Causes of Parkinson\'s Disease......Page 1392
Ubiquitin C‐Hydrolase‐1 (UCHL1, PARK5)......Page 1393
Definition......Page 1394
Patch Clamp Set‐up......Page 1395
Patch Clamp Configurations......Page 1396
Clinical Applications......Page 1397
Definition......Page 1398
Definition......Page 1399
Definition......Page 1400
Identification and Validation of Therapeutic Targets......Page 1402
Description......Page 1404
Peptide Array production......Page 1405
Peptide Library Types......Page 1408
Definition......Page 1409
References......Page 1410
PPIases in Cell Signaling......Page 1411
Clinical Relevance......Page 1412
Definition......Page 1413
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Peroxisomal Biogenesis Disorders......Page 1415
Single Peroxisomal Enzyme Deficiencies......Page 1416
Clinical Relevance......Page 1417
Definition......Page 1418
References......Page 1419
Histopathology......Page 1420
Cellular Functions......Page 1421
Diagnosis and Genetic Testing......Page 1422
PEV......Page 1423
Definition......Page 1424
Characteristics......Page 1425
Cytochrome P450 2D6......Page 1428
Definition......Page 1429
References......Page 1430
Speed Versus Quality......Page 1431
Clinical Relevance......Page 1432
Definition......Page 1433
Therapeutic Management......Page 1434
Types of Mutations......Page 1435
Pathogenesis of Metabolic and Cognitive Phenotype......Page 1436
Phosphatidylinositides......Page 1437
Definition......Page 1438
Definition......Page 1439
Topology......Page 1440
Properties of the Signaling State......Page 1441
Deactivating Interactions and Adaptation......Page 1443
Definition......Page 1445
Definition......Page 1446
Definition......Page 1447
Front‐Runners in Plant Genomics......Page 1448
Genomics of Other Plant Species......Page 1450
Application of Plant Genomics to Crop Improvement......Page 1451
Definition......Page 1452
PNA......Page 1453
Description......Page 1454
Surface Plasmon Resonance......Page 1455
Definition......Page 1456
Definition......Page 1457
Definition......Page 1458
Catalytic Activity of PARP‐1 and Life Cycle of Poly(ADP‐ribose)......Page 1459
Transcriptional Regulation......Page 1460
Clinical Relevance......Page 1461
Septic or Haemorrhagic Shock......Page 1462
Outlook: ADP‐Ribosylation Inhibitors as Therapeutic Drugs for Humans......Page 1463
Definition......Page 1464
Factors and Mechanisms......Page 1465
Clinical Relevance......Page 1466
Cellular and Molecular Regulation......Page 1467
Polycystin‐1......Page 1468
Polycystins 1 and 2 Function in the Same Pathway......Page 1469
Loss of the Morphological Constraints Determining Normal Tubule Architecture......Page 1470
Polyglutamine Disease, the Emerging Role of Transcription Interference......Page 1471
References......Page 1472
Elucidating the Normal Function of Disease Proteins Provides a Clue......Page 1473
Polyglutamine Disease and Aberrant Acetylation......Page 1474
Definition......Page 1475
Definition......Page 1476
Definition......Page 1477
Introductory Remarks......Page 1478
Data Evaluation Methods......Page 1479
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Chromosomal Mechanisms Leading to PWS and AS......Page 1483
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Sporadic (Idiopathic) Creutzfeldt‐Jakob Disease......Page 1495
New Variant CJD and the Transmission of BSE to Humans......Page 1496
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Definition......Page 1500
Proteases and Inhibitors......Page 1501
Metalloproteinases......Page 1502
Threonine Proteases......Page 1503
Definition......Page 1504
Definition......Page 1505
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Membrane Fusion......Page 1507
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The Future of Protein Crystallization......Page 1512
Definition......Page 1514
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Examples......Page 1516
2‐D PAGE Databases......Page 1517
Definition......Page 1518
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Prefolding Stage......Page 1520
Protein Disulfides as a Tool to Study Conformational Properties of a Protein......Page 1521
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Domain Databases......Page 1524
From Domain to Function......Page 1526
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Stages of Protein Folding......Page 1528
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Cross‐Linking Reagents......Page 1540
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Phage Display in Allergy: Identification of Allergens......Page 1544
Phage Display in Cancer: Identification of Marker Molecules and Potential Therapeutic Targets......Page 1545
References......Page 1546
Protein–Ligand Interactions in Crystals: Co‐Crystallisation vs. Soaking Experiments......Page 1547
From Crystal to Electron Density Map......Page 1548
Problems Associated with X‐Ray Protein‐Ligand Complexes......Page 1549
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Definition......Page 1553
Methods for Detection......Page 1554
Protein‐Detection Microarrays......Page 1555
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Clinical Relevance......Page 1557
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Function of Protein Prenylation......Page 1560
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Definition......Page 1562
Smart Sampling: Use Information About Preferred Conformations......Page 1563
Clinical Applications......Page 1564
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Multimerization upon DNA‐Binding......Page 1571
DNA Recognition by &balpha;‐Helices......Page 1572
Clinical Relevance......Page 1573
Dosage Suppressor Analysis......Page 1574
All Mutations Are Not Created Equal......Page 1575
Definition......Page 1576
Ligand‐Exchange Rates......Page 1577
Detection of Protein NMR Signals‐SAR by NMR......Page 1578
Structures of Protein‐Ligand Complexes......Page 1579
Characteristics......Page 1580
Structural Features of Protein‐Interaction Sites......Page 1581
Energetics......Page 1582
Proteins of Known Structure......Page 1583
Definition......Page 1584
Proteomics and Complexity of Age‐related Protein Modifications......Page 1585
Analytical Protein Microarrays......Page 1588
Isolation and Characterisation of Protein Complexes......Page 1589
Protein Arrays and Phage Display......Page 1590
Disease Expression Profiling......Page 1591
Proteomics and Drug Development......Page 1592
Proteomics and Other Biogerontological Systems......Page 1595
Future of Proteomics in Experimental Gerontology......Page 1596
Proteomics: the State of the Art......Page 1597
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Ischaemic Heart Disease......Page 1599
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Proteomics Studies of the Pathogen......Page 1602
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Basics of Microfluidics......Page 1604
Sensing......Page 1605
Clinical Relevance......Page 1606
Definition......Page 1607
PS......Page 1608
Definition......Page 1609
Definition......Page 1610
Diagnostics......Page 1611
Genetics and Other Pathophysiological Aspects......Page 1612
Definition......Page 1614
pVHL......Page 1615
Definition......Page 1616
Definition......Page 1617
A Brief History of QSAR......Page 1618
Molecular Descriptors Used in Classical QSAR......Page 1619
Variable Selection......Page 1620
Three‐Dimensional QSAR......Page 1621
Definition......Page 1622
Definition......Page 1623
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Definition......Page 1625
Definition......Page 1626
Identification of Oncogenic Ras Proteins by Reverse Genetic Approaches......Page 1627
Signalling Upstream of Ras Proteins......Page 1628
Signalling Downstream of Ras Proteins......Page 1629
Nuclear Targets of Ras Signalling Pathways......Page 1631
Definition......Page 1632
Readlength......Page 1633
Definition......Page 1634
Ligand‐Receptor Interactions......Page 1635
Modulatory Proteins......Page 1637
Function of RSKs in Development and Human Disease......Page 1638
Characteristics......Page 1639
Definition......Page 1640
The Cloning of DNA into a Vector......Page 1641
Protein Expression and Analysis......Page 1644
Purification of Recombinant Proteins......Page 1646
Definition......Page 1647
Vectors for Mammalian Expression......Page 1648
Plasmid Vectors......Page 1649
Cell Hosts......Page 1650
Definition......Page 1651
Saccharomyces cerevisiae......Page 1652
Methylotrophic Yeasts......Page 1653
Clinical Relevance......Page 1654
Definition......Page 1655
Definition......Page 1656
Definition......Page 1657
Definition......Page 1658
Diseases with Repeat Expansions that Are Not Expressed on the Protein Level......Page 1659
Clinical Relevance......Page 1662
Characteristics......Page 1663
Clinical Relevance......Page 1665
Definition......Page 1666
Pre‐Replication and Post‐Replication Complexes......Page 1667
The DNA Origin Associated to the Human Lamin B2’Gene......Page 1668
Chromatin Structure, Epigenetics, and Origins......Page 1669
Clinical Relevance......Page 1670
Definition......Page 1671
Definition......Page 1672
Definition......Page 1673
Mendelian Genetics......Page 1674
Other Retinal Degenerations Related to RP......Page 1677
Cellular and Molecular Mechanisms......Page 1678
Definition......Page 1679
Definition......Page 1680
References......Page 1681
Entry......Page 1682
Translation......Page 1684
References......Page 1685
Clinical Features......Page 1686
MECP2 Mutations......Page 1688
Genotype‐Phenotype Correlation......Page 1689
References......Page 1690
Reverse Transcriptase......Page 1691
Reverse Transcriptase and HIV‐1 Genetic Variability......Page 1692
Competitive and Non‐Competitive Inhibitors of HIV‐1 Reverse Transcriptase......Page 1693
Resistance Mutations in Reverse Transcriptase and HIV‐1 Fitness......Page 1694
Definition......Page 1695
References......Page 1696
References......Page 1697
Cytokines......Page 1698
Clinical Relevance......Page 1699
Definition......Page 1701
References......Page 1702
Suppressive Subtractive Hybridization (SSH)......Page 1703
Verification......Page 1705
Functional Characterization......Page 1706
Clinical Relevance......Page 1707
Definition......Page 1708
Molecular Interactions......Page 1709
Regulatory Mechanisms......Page 1710
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The Genetic Code......Page 1712
Transfer RNA......Page 1713
Ribosomes......Page 1714
Translation Factors......Page 1715
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Aa‐tRNA Binding......Page 1717
Peptide Bond Formation......Page 1719
Translocation......Page 1720
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Export of Coding RNA......Page 1725
Clinical Relevance......Page 1727
Characteristics......Page 1728
RNA Interference – the Issue of Specificity......Page 1730
Genome‐Wide Functional Screens in Mammalian Cells......Page 1731
Definition......Page 1732
RNA Polymerase I Transcription of rRNA Genes and Ribosome Biogenesis......Page 1733
RNA Polymerase I Transcription Machinery: Pol I and Transcription Factors......Page 1734
The Mammalian Pol I Transcription Cycle......Page 1736
Clinical Relevance......Page 1737
Protein Phosphorylation Governs the Entry into the Elongation Step......Page 1738
The CTD Acts as a Platform for RNA Processing......Page 1739
Integration of mRNA Quality Control with Transcription......Page 1740
Definition......Page 1741
Promoters of Genes Transcribed by RNA Polymerase III......Page 1742
Transcription by RNA Polymerase III......Page 1743
Negative Regulators of Pol III Transcription......Page 1745
Clinical Relevance......Page 1746
Definition......Page 1747
Definition......Page 1748
RT‐PCR......Page 1749
RxRE......Page 1750
Definition......Page 1751
Definition......Page 1752
Definition......Page 1753
Schizophrenia, Genetics......Page 1754
Genetic Linkage......Page 1755
Definition......Page 1756
Definition......Page 1757
Definition......Page 1758
Definition......Page 1759
Definition......Page 1760
Hierarchy in Selenoprotein Expression......Page 1761
Iodothyronine Deiodinases......Page 1762
Selenoproteins Identified in Silico......Page 1763
Definition......Page 1764
Sequence Annotation in Evolution......Page 1765
Methods of Analysis I: Evolution at the DNA Level......Page 1766
Methods of Analysis II: Evolution at the Protein Level......Page 1768
A Large Scale Study on Ancient Genome Duplications......Page 1769
Definition......Page 1770
Sequence Alignment and Dot‐Plots......Page 1771
Database Searching......Page 1772
Definition......Page 1773
Definition......Page 1774
Sex‐Determining Gene......Page 1775
Definition......Page 1776
Introduction......Page 1777
Sequencing Vector......Page 1778
Clinical Relevance......Page 1779
Definition......Page 1780
Characteristics......Page 1781
Cooperations with Growth Factor Receptors and Other Membrane Proteins......Page 1782
Small G Proteins......Page 1783
Definition......Page 1784
Definition......Page 1785
Definition......Page 1786
Expression Modulation......Page 1787
Definition......Page 1788
Definition......Page 1789
Definition......Page 1790
Skin Neoplasms......Page 1791
Ectodermal Dysplasia......Page 1792
Definition......Page 1793
Reverse Genetic Studies......Page 1794
Definition......Page 1798
Smad Ubiquitin Regulatory Factor......Page 1799
Small Vessel Vasculitis......Page 1800
SMS......Page 1801
Single Nucleotide Polymorphisms......Page 1802
Matrix‐Assisted Laser Desorption/Ionisation Mass Spectrometry......Page 1803
SNP Discovery......Page 1804
Definition......Page 1805
Definition......Page 1806
Cycling Genes – see Review (1) and Fig. 1......Page 1807
Maturation of the Somite and its Tissue Derivatives......Page 1808
Signalling from Surrounding Tissues Regulates the Tissue Specification of Somitic Cells......Page 1809
Definition......Page 1810
Definition......Page 1811
SMN1 Deletion Mutations and Conversion Mutations......Page 1812
The SMN Protein and the SMN Complex......Page 1813
Molecular Genetic Testing......Page 1815
Definition......Page 1816
Definition......Page 1817
Mechanism of Nuclear Pre‐mRNA Splicing......Page 1818
Alternative Pre‐mRNA Splicing......Page 1820
Defects in Pre‐mRNA Splicing Can Cause or Predispose Individuals to a Disease......Page 1821
Synonyms......Page 1822
Definition......Page 1823
XX Male Syndrome......Page 1824
SOX9......Page 1825
Summary......Page 1826
Definition......Page 1827
Steinert\'s Disease......Page 1828
Adult Stem Cells......Page 1829
Hematopoietic Stem Cells......Page 1830
Embryonic Stem Cells......Page 1831
Definition......Page 1832
Glucocorticoid Receptor Mutations......Page 1833
Inactivating Mutations of the Mineralocorticoid Receptor......Page 1835
Definition......Page 1836
Definition......Page 1837
Definition......Page 1838
Structural Databases......Page 1839
Structural Genomics......Page 1840
Function from Structure: Bioinformatics......Page 1841
Function from Structure: Experimental Approaches......Page 1843
Definition......Page 1845
What is Required: The Complement of the Binding Site......Page 1846
A Quantitative Picture: Mapping “Hot Spots” of Binding......Page 1847
Definition......Page 1848
Sequential Backbone Resonance Assignments for Labeled Proteins......Page 1849
Structure Refinement......Page 1850
Structure Validation......Page 1851
Definition......Page 1852
Data Collection and Evaluation (See X‐Ray Crystallography – Basic Principles)......Page 1853
Structure Refinement......Page 1854
Definition......Page 1855
Definition......Page 1856
SUMO Conjugating Enzyme Ubc9......Page 1857
SUMO E3 Ligases......Page 1858
SUMO Attachment Can Be Regulated......Page 1859
Definition......Page 1860
Definition......Page 1861
Configuration of System......Page 1862
Immobilization of Lipids and Membrane Proteins......Page 1863
Quantitative Analysis of Sensorgrams......Page 1864
Definition......Page 1865
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Definition......Page 1867
Definition......Page 1868
Definition......Page 1869
Defective ABCA1 Causes TD and Familial HDL‐Deficiency Syndromes......Page 1870
Association Between Mutation Topology and Clinical Phenotypes in Individuals with TD......Page 1871
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Cancer......Page 1876
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Nearest Neighbor Model......Page 1882
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General Features......Page 1886
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